| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 2,362,203 | T→A | 22.5% | F133L (TTT→TTA) | SAS2208 → | putative transcription regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 2,362,203 | 0 | T | A | 22.5% | 488.6 / 166.8 | 174 | F133L (TTT→TTA) | SAS2208 | putative transcription regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (67/67); new base A (21/18); total (88/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.43e-01 | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
ACGTACTACACGCGCACTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTGTTCAAGAAACACATA > BX571857/2362107‑2362300 | acGTACTACACGCGCACTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTta > 1:2255194/1‑98 (MQ=255) gTACTACACGCGCACTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTtata < 1:2528614/98‑1 (MQ=255) actacACGCGCACTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTtatata > 1:291807/1‑98 (MQ=255) actacACGCGCACTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTtatata > 2:2553272/1‑98 (MQ=255) actacACGCGCACTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTaatata > 1:1420206/1‑98 (MQ=255) actacACGCGCACTTAATCATGCTAATAACGAAGTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGCTCTGAGACGATTTTtctata > 2:703698/1‑98 (MQ=255) acacGCGCACTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATgg < 2:2358750/98‑1 (MQ=255) cACTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGgc > 1:1475646/1‑98 (MQ=255) aCTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGgcg > 2:197708/1‑98 (MQ=255) cTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGgcgc < 2:1547075/98‑1 (MQ=255) cTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTAATTGTTTAAAACGTTCAGAGACGATTCTTACACATGGTTTTGgcgc > 2:209334/1‑98 (MQ=255) ttAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCa < 1:1144624/98‑1 (MQ=255) ttAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCa > 2:1397336/1‑98 (MQ=255) ttAATCATGCTAATAACGAATGAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCa < 2:1441727/98‑1 (MQ=255) tAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCAt > 2:2064245/1‑98 (MQ=255) tAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCAt < 1:791976/98‑1 (MQ=255) aaTCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATc < 1:1804887/98‑1 (MQ=255) aTCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCt > 2:2603681/1‑98 (MQ=255) aTCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCt < 1:953919/98‑1 (MQ=255) tCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCtt > 2:529130/1‑98 (MQ=255) tCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCtt < 2:1919717/98‑1 (MQ=255) aTGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCtttt < 1:2371470/98‑1 (MQ=255) gCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGt > 2:239942/1‑98 (MQ=255) gCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGt < 2:103335/98‑1 (MQ=255) gCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTCTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGt > 2:2006789/1‑98 (MQ=255) taataaCGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAg < 1:2507774/98‑1 (MQ=255) taataaCGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAg < 1:1815697/98‑1 (MQ=255) taataaCGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAg < 1:632362/98‑1 (MQ=255) ataaCGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGtt < 1:2307804/98‑1 (MQ=255) taaCGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTg > 1:1320032/1‑98 (MQ=255) cGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTa > 2:1700078/1‑98 (MQ=255) aTTAAATGATAAAACTATTGATCAGATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCg > 2:2350995/1‑98 (MQ=255) aTTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTAcgg > 2:461684/1‑96 (MQ=255) aTTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCg > 1:197422/1‑98 (MQ=255) ttAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGa > 1:2286701/1‑98 (MQ=255) ttAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGa > 2:211223/1‑98 (MQ=255) tAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGAc > 2:1091767/1‑98 (MQ=255) tAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGAc > 2:1041466/1‑98 (MQ=255) tAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGAc < 1:1588915/98‑1 (MQ=255) tAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGAc > 1:805376/1‑98 (MQ=255) tAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGAc > 2:1833899/1‑98 (MQ=255) aaaTGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACt > 1:244837/1‑98 (MQ=255) aaTGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACtt > 1:2211516/1‑98 (MQ=255) aaTGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATATTTTGTAGTTGCTACCGACtt > 2:1575773/1‑98 (MQ=255) aaTGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACtt > 1:60933/1‑98 (MQ=255) gATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTtata < 1:1943902/98‑1 (MQ=255) gATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTtata > 1:1105840/1‑98 (MQ=255) gATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTtata > 2:2434995/1‑98 (MQ=255) gATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTtata < 2:33693/98‑1 (MQ=255) gATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTtata > 1:381540/1‑98 (MQ=255) tAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATAcc > 1:669877/1‑98 (MQ=255) aaaaCTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGATTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCa > 1:1724327/1‑98 (MQ=255) aaaaCTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCa < 1:2232277/98‑1 (MQ=255) aaaCTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCaa < 2:2486371/98‑1 (MQ=255) aaaCTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCaa < 1:1540075/98‑1 (MQ=255) aaCTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCaaa > 2:1375453/1‑98 (MQ=255) aCTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCaaaa > 1:1016605/1‑98 (MQ=255) aCTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCaaaa > 1:2027044/1‑98 (MQ=255) aCTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCaaaa < 1:1684635/98‑1 (MQ=255) tGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTAt > 1:1718512/1‑98 (MQ=255) tGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTAt > 1:2122039/1‑98 (MQ=255) aTCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCa < 2:648533/98‑1 (MQ=255) aTCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCa < 2:733736/98‑1 (MQ=255) tCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCaa < 1:1791746/98‑1 (MQ=255) cAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAg > 1:2590256/1‑98 (MQ=255) cAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAg > 2:1409930/1‑98 (MQ=255) cAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAg > 2:1646537/1‑98 (MQ=255) aaaTATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGa < 1:1601561/98‑1 (MQ=255) aaaTATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGa < 1:1795269/98‑1 (MQ=255) aaaTATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGa < 1:748322/98‑1 (MQ=255) gTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGt > 2:491734/1‑98 (MQ=255) gTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGt < 1:519165/98‑1 (MQ=255) tCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTc < 1:1000231/98‑1 (MQ=255) cATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCt > 2:1208242/1‑98 (MQ=255) cATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCt < 2:90279/98‑1 (MQ=255) cATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCt > 1:1893159/1‑98 (MQ=255) ttGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTa > 2:1132714/1‑98 (MQ=255) ttGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTa < 2:453298/98‑1 (MQ=255) tGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTaa < 2:1587646/98‑1 (MQ=255) tGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTaa > 1:1503729/1‑98 (MQ=255) gTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAat < 1:1188563/98‑1 (MQ=255) gTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAat < 1:128870/98‑1 (MQ=255) gTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAat < 2:859645/98‑1 (MQ=255) tAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATAtt > 1:1489827/1‑98 (MQ=255) aaaaCGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTc < 1:2056349/98‑1 (MQ=255) aaCGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCaa > 2:1636308/1‑98 (MQ=255) aCGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAAc < 2:928309/98‑1 (MQ=255) aCGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAAc > 1:873358/1‑98 (MQ=255) aCGTTCTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAAc > 1:2597182/1‑98 (MQ=255) cGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAGAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACt < 1:854166/98‑1 (MQ=255) gTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACtt < 2:281271/98‑1 (MQ=255) ttCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTg > 1:1494954/1‑98 (MQ=255) tCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGGATAGGTCTTAATATTTAACTTGt > 2:1279265/1‑98 (MQ=255) cTGAGACGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTGtt > 2:1898923/1‑98 (MQ=255) tGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTGTTc < 1:1959539/98‑1 (MQ=255) gagaCGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTGTTCa > 1:1606828/1‑98 (MQ=255) gaCGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTGTTCAAg < 1:732153/98‑1 (MQ=255) aCGATTTTAATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTGTTCAAGa < 2:888278/98‑1 (MQ=255) ttttATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTGTTCAAGAAacac > 2:598012/1‑98 (MQ=255) tatataTGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTGTTCAAGAAACACata < 2:1511571/98‑1 (MQ=255) | ACGTACTACACGCGCACTTAATCATGCTAATAACGAATTAAATGATAAAACTATTGATCAAATATGTCATTGTTTAAAACGTTCTGAGACGATTTTTATATATGGTTTTGGCGCATCTTTTGTAGTTGCTACCGACTTATACCAAAAGTTATCAAGAATAGGTCTTAATATTCAACTTGTTCAAGAAACACATA > BX571857/2362107‑2362300 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |