| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 1,472,392 | G→T | 6.4% | pseudogene (3325/5622 nt) | ebh ← | very large surface anchored protein (pseudogene) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 1,472,392 | 0 | G | T | 6.4% | 1246.9 / 31.7 | 317 | pseudogene (3325/5622 nt) | ebh | very large surface anchored protein (pseudogene) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (161/132); new base T (4/20); total (165/152) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.20e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
CTTGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGATC > BX571857/1472296‑1472488 | cTTGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAg < 2:2491877/97‑1 (MQ=255) gTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAgcgc > 1:3119733/1‑97 (MQ=255) tCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCAtt > 1:2111066/1‑97 (MQ=255) tCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCAtt < 1:1541738/97‑1 (MQ=255) aTTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTa > 2:2817277/1‑97 (MQ=255) tttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAAt > 2:2025620/1‑97 (MQ=255) cTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTc < 2:4286579/97‑1 (MQ=255) ttAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGt < 1:2373006/97‑1 (MQ=255) aGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTa < 1:2489591/97‑1 (MQ=255) aGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTa > 1:1659470/1‑97 (MQ=255) cTTTCACTAAATCTTTAATGTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATg < 2:3284402/97‑1 (MQ=255) tttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGa > 2:1328378/1‑97 (MQ=255) tttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGa > 1:3356002/1‑97 (MQ=255) ttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGAc > 1:112334/1‑97 (MQ=255) cACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCt > 1:3516695/1‑97 (MQ=255) aCTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCtt > 1:4260835/1‑97 (MQ=255) cTAAATCTTTGATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttg < 2:2056202/97‑1 (MQ=37) cTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAGGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttg < 2:957351/97‑1 (MQ=255) tAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttgt > 2:1805810/1‑97 (MQ=255) aTCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGa > 1:3737907/1‑97 (MQ=255) tCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGaa > 2:3843828/1‑97 (MQ=255) tCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGaa > 1:719480/1‑97 (MQ=255) tCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGaa > 2:1175186/1‑97 (MQ=255) cTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAg > 1:2059628/1‑97 (MQ=255) tttAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGt > 2:149774/1‑97 (MQ=255) ttAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTa > 2:3942043/1‑97 (MQ=255) tgaTTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTAt < 1:888391/95‑1 (MQ=255) aTTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTAttt > 1:1926453/1‑97 (MQ=255) aTTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTAttt > 1:4073155/1‑97 (MQ=255) ttCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGa > 1:569261/1‑97 (MQ=255) tCTTGTCATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGAt > 2:305691/1‑97 (MQ=255) tCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGAt > 1:1515125/1‑97 (MQ=255) tCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGAt > 1:2008048/1‑97 (MQ=255) ttGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCGTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTa > 1:1245901/1‑97 (MQ=255) tGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTaa < 1:2234104/97‑1 (MQ=255) tGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTaa < 2:1729262/97‑1 (MQ=255) tGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTaa < 1:2946106/97‑1 (MQ=255) aaTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTa < 1:4106538/85‑1 (MQ=39) aTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACg > 2:2570116/1‑97 (MQ=255) aTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACg > 1:2803425/1‑97 (MQ=255) aTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACg < 1:2774004/97‑1 (MQ=255) aTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACg < 1:3174530/97‑1 (MQ=255) tGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGa < 2:2719359/97‑1 (MQ=255) tGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGa > 2:317710/1‑97 (MQ=255) gCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGAt > 1:1268498/1‑97 (MQ=255) gCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGAt > 2:2950662/1‑97 (MQ=255) cTTGTGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATc < 2:4113189/97‑1 (MQ=255) cTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATc > 1:104887/1‑97 (MQ=255) cTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATc > 2:3463194/1‑97 (MQ=255) cTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATc > 1:3600346/1‑97 (MQ=255) cTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATAAGATc > 1:1162938/1‑97 (MQ=255) tGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCtt > 2:225217/1‑97 (MQ=255) gcgcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGAcc < 1:686577/67‑1 (MQ=40) gcgcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCttt > 1:1856111/1‑97 (MQ=255) gcgcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCttt > 1:3799197/1‑97 (MQ=255) cgcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTa < 1:3991939/97‑1 (MQ=255) cgcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTa > 1:1343654/1‑97 (MQ=255) gcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTaa < 2:3520312/97‑1 (MQ=255) aaGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGt < 2:2367763/97‑1 (MQ=25) aaGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGt < 2:210677/97‑1 (MQ=255) aGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTg < 1:808094/97‑1 (MQ=255) gTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGc < 1:1484722/97‑1 (MQ=40) ttGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCt < 1:2784714/97‑1 (MQ=255) ttGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCt > 2:450944/1‑97 (MQ=255) ttGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCt > 2:106588/1‑97 (MQ=255) ttGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCt < 1:4357264/97‑1 (MQ=255) ttGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCt > 1:3439932/1‑97 (MQ=255) tgtgCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCtt > 2:3213025/1‑97 (MQ=255) gtgCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTAt < 1:448504/70‑1 (MQ=35) tgCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGt > 2:830831/1‑97 (MQ=255) cTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttt < 2:772512/97‑1 (MQ=21) cTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttt > 1:2284087/1‑97 (MQ=255) tttGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGtttt > 2:786038/1‑97 (MQ=40) ttGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttttt > 2:474248/1‑97 (MQ=255) tGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTaa > 2:4619508/1‑39 (MQ=255) tGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTaa < 1:4619508/39‑1 (MQ=255) tGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTc > 2:3666533/1‑97 (MQ=255) gCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCt < 1:3272004/97‑1 (MQ=255) cTTGTTCTATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCtt < 2:4429633/97‑1 (MQ=255) ttGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTa > 1:783234/1‑97 (MQ=255) tGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAAt < 2:4321819/35‑1 (MQ=255) gTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATc < 2:340053/97‑1 (MQ=40) ttCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGt < 2:1628952/79‑1 (MQ=255) tCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTg < 1:790801/97‑1 (MQ=255) cAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGAt > 2:4035123/1‑69 (MQ=255) cAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGt > 1:4583132/1‑97 (MQ=255) cAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGt > 1:3196771/1‑97 (MQ=255) tttCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAg < 2:2682108/97‑1 (MQ=21) tttCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAg > 2:679793/1‑97 (MQ=255) ttcttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATGCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCt < 1:3541790/88‑1 (MQ=255) tcttTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTg < 2:3737104/97‑1 (MQ=21) cttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGt < 1:1400581/88‑1 (MQ=255) cttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTgg < 2:1950977/97‑1 (MQ=255) tttAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGa < 2:3026075/97‑1 (MQ=18) ttAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGAt < 1:1872623/97‑1 (MQ=255) tAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGAtt > 1:2701458/1‑97 (MQ=255) gTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTc < 2:130147/97‑1 (MQ=255) tCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCg < 1:3035549/97‑1 (MQ=255) cAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGa > 2:3152811/1‑97 (MQ=255) aGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGAt > 1:1132793/1‑97 (MQ=255) | CTTGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGATC > BX571857/1472296‑1472488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |