New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP042583 | = 2506348 | 242 (0.840) | 4 (0.010) | 4/516 | 24.6 | 1.7% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | CP042583 | = 2508509 | 220 (0.780) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
TTTACCATCAGCTATGAGTTGTAATATTTCTGACTCACGATTTGTAAGTTGATTATCAGAGGAATACCTGGAAGATATTTTTTCACAATCCATATGTACACTATCAAAATAAGTGTAACCATTACTAATCGAATCAATAGCACGATTTAGTTTCGCCGGGTGACTGGTTTTCCATACGCATCCTTTCGCACCTGCTTCAAGCAATTTTATTGAATCAATATACGGCATCTTTGCTACAAATGTAATAATATGAGCATCTATCTTATGCGATTTAACCCATTTTACGAGTTCGGCCCCCATCATTCCACCTGCAAATTCTCCTAAAATAAATATTTAGGCTGTAGATTTGTTACACTCCGCTATAGCTTTCTTCAGATCTTTATAGCCCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAAGGATTGCATTGCGTAAACGCTTTTTATTTACAACAAAATGGGGAAGTATTACGGCGAAGATAAATTGGAGCGGGCGAAGGGAATCGAACCCTCGTATAGAGCTTGGGAAGCTCTCGTTCTACCATTGAACTACGC > CP042583/2506060‑2506632 | tttACCATCAGCTATGAGTTGTAATATTTCTGACTCACGATTTGTAAGTTGATTATCAGAGGAATACCTGGAAGATATTTTTTCACAATCCATATGTACACTATCAAAATAAGTGTAACCATTACTAATCGAATCAATAGCACGATTTAGTTTCGCCGGGTGACTGGTTTTCCATACGCATCCTTTCGCACCTGCTTCAAGCAATTTTATTGAATCAATATACGGCATCTTTGCTACAAATGTAATAATATGAGCATCTATCTTATGCGATTTAACCCATTTTACGAGt > 2:971769/1‑289 (MQ=255) tttACCATCAGCTATGAGTTGTAATATTTCTGACTCACGATTTGTAAGTTGATTATCAGAGGAATACCTGGAAGATATTTTTTCACAATCCATATGTACACTATCAAAATAAGTGTAACCATTACTAATCGAATCAATAGCACGATTTAGTTTCGCCGGGTGACTGGTTTTCCATACGCATCCTTTCGCACCTGCTTCAAGCAATTTTATTGAATCAATATACGGCATCTTTGCTACAAATGTAATAATATGAGCATCTATCTTATGCGATTTAACCCATTTTACGAGt < 1:1377808/289‑1 (MQ=255) aCCATCAGCTATGAGTTGTAATATTTCTGACTCACGATTTGTAAGTTGATTATCAGAGGAATACCTGGAAGATATTTTTTCACAATCCATATGTACACTATCAAAATAAGTGTAACCATTACTAATCGAATCAATAGCACGATTTAGTTTCGCCGGGTGACTGGTTTTCCATACGCATCCTTTCGCACCTGCTTCAAGCAATTTTATTGAATCAATATACGGCATCTTTGCTACAAATGTAATAATATGAGCATCTATCTTATGCGATTTAACCCATTTTACGAGTTCg < 2:2232650/289‑1 (MQ=255) cATCAGCTATGAGTTGTAATATTTCTGACTCACGATTTGTAAGTTGATTATCAGAGGAATACCTGGAAGATATTTTTTCACAATCCATATGTACACTATCAAAATAAGTGTAACCATTACTAATCGAATCAATAGCACGATTTAGTTTCGCCGGGTGACTGGTTTTCCATACGCATCCTTTCGCACCTGCTTCAAGCAATTTTATTGAATCAATATACGGCATCTTTGCTACAAATGTAATAATATGAGCATCTATCTTATGCGATTTAACCCATTTTACGAGTTCgg > 2:145002/1‑288 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |