| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 1,785,855 | A→G | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,785,855 | 0 | A | G | 99.7% | 744.8 / NA | 313 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
GGCGGCGCTTTTGCAACAAACAGACGACCCCGTGTGTCTGGTTTCTGGCTTTGTCAGTTTTGTTGAAGGGCAATTGACACTGGAACCACGGGTGATGATGACAAAAACCCGTGCCTGGGCGCTGGACGCAGAAACTACGCCTGTGGCACCGCTACCTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAATTGCTGGCGAATGACCTCACCGCGGTGGGTTTTTATCGGCTGGCACATGTGTTGGGACAATTTCGTAATACAGAAAGCGAGGCACGGGTAGAAGCAATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATG > CP042583/1785573‑1786138 | ggcgCTTTTGCAACAAACAGACGACCCCGTGTGTCTGGTTTCTGGCTTTGTCAGTTTTGTTGAAGGGCAATTGACACTGGAACCACGGGTGATGATGACAAAAACCCGTGCCTGGGCGCTGGACGCAGAAACTACGCCTGTGGCACCGCTACCTTCTGCCAGCGTTTTGCCTGTGCCGTCTACTGCTCATCAGTTGCTGATACGCTGCCAGGCGTTACTTATTCAACTGCTCCATAACGGCTGGCGCTATCAGGAACAGAGTGCTATTGGTCAGGCATAGTTGCTGGCg < 1:1006873/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |