Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 460,071 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 460,071 | 0 | A | T | 100.0% | 670.6 / NA | 277 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (129/148); total (129/148) | |||||||||||
* | CP042583 | 460,072 | 0 | G | C | 99.6% | 656.1 / NA | 277 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (128/148); minor base A (1/0); total (129/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 460,073 | 0 | T | A | 100.0% | 669.2 / NA | 277 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (129/148); total (129/148) |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
TCTGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTAGCGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTAAGCCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTAGCCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCAAGTCCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATAGTCAAATTCCCTTACCCAGTGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTAGTGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATAGTTCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCC > CP042583/459794‑460352 ||| tctGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTccc < 1:1261544/289‑1 (MQ=255) ggATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccct > 2:1761842/1‑287 (MQ=255) gATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctca > 2:700674/1‑286 (MQ=255) tGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcagg < 1:1442504/289‑6 (MQ=255) tGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcag < 1:201892/288‑5 (MQ=255) tGAATGTTAAGACGATCCCTTCAGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGAGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcag < 1:893457/288‑5 (MQ=255) aTGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcaggatt > 2:95555/1‑281 (MQ=255) aTGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcaggagt > 1:1026184/1‑281 (MQ=255) atcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAATTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACTCAGAGTTAATTCACAACTTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGc > 1:2141097/10‑289 (MQ=255) atcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGaaa > 1:969727/10‑287 (MQ=255) tcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTccc < 2:2162935/255‑1 (MQ=255) tcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGaaa > 2:1516651/9‑286 (MQ=255) tcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCAAAAATTCACTTACCCTCAGGAGTGCAGGGaaa > 2:41615/9‑286 (MQ=255) aGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAg < 1:962938/289‑1 (MQ=255) aTAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTTGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGa > 1:613770/1‑288 (MQ=255) tAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAcc > 1:186260/1‑289 (MQ=255) aaTGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTa < 1:469986/289‑1 (MQ=255) aaTGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTa < 2:1168945/289‑1 (MQ=255) cATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCACTTCCCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAAACCGTTAATGa > 2:1841235/1‑289 (MQ=255) ttGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGAtt > 2:590338/1‑289 (MQ=255) aCGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATgg < 1:1006458/289‑1 (MQ=255) aCGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATgg < 2:1594219/289‑1 (MQ=255) aCGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATgg < 1:1057777/289‑1 (MQ=255) aTGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGttcagta > 2:150831/1‑281 (MQ=255) tGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACt < 2:1026184/289‑1 (MQ=255) ttttGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcag < 1:1363674/234‑5 (MQ=255) ttGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCgg > 1:2038796/1‑289 (MQ=255) ttGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCgg > 1:1202412/1‑289 (MQ=255) tGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGt < 1:727909/289‑1 (MQ=255) tGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGt < 1:150831/289‑1 (MQ=255) ggCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGaa > 1:80581/1‑289 (MQ=255) cGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAg < 2:226195/288‑1 (MQ=255) cGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAg < 1:1516651/288‑1 (MQ=255) ttCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCt < 2:1108850/289‑1 (MQ=255) tcCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGAc < 1:1728460/289‑1 (MQ=255) tcCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGAc < 2:369932/289‑1 (MQ=255) tcCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGAc < 1:90021/289‑1 (MQ=255) tcCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGAc < 2:83444/289‑1 (MQ=255) cGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACaa > 1:1644948/1‑289 (MQ=255) tCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTccc < 2:1241885/181‑1 (MQ=255) tCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAata > 1:2151781/1‑289 (MQ=255) ttACAAGAATTACCCGCAGCAGCGCCGGACACCCTCAAGTTTTCGCGATCAGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGCAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACAGTTAATGATTATGTTTCAGTACCCCCGGCTAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCACCTGACAAAATACGAGCCaa > 2:1188471/1‑289 (MQ=255) cAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCt < 1:1225264/269‑1 (MQ=255) cAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTa < 2:80581/289‑1 (MQ=255) aTTAACCGCAGAAGCGCCGGACACAATCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGGAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTGTGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGaaa < 2:210029/289‑1 (MQ=255) tACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGc < 2:1651023/186‑1 (MQ=255) gCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCa < 2:2243601/289‑1 (MQ=255) gACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCt < 2:1274001/245‑1 (MQ=255) acacacTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGata < 1:2219756/288‑1 (MQ=255) acacacTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGata < 2:18921/288‑1 (MQ=255) cacacTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATAtt < 1:1167284/289‑1 (MQ=255) ccTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTAAGTCAATGTTCCTAATCCATCACCTTTTTATGTCAACCCTGTTAACTTAACAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCAATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCg < 2:454569/288‑1 (MQ=255) acTCAAGTTTTCGCGATCCGGTTACTATATCCATGTTCATAATCCATCAACCTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTAAAAGTGGGCCGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCg < 1:2170825/289‑1 (MQ=255) acTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCagag > 2:613821/1‑253 (MQ=255) cTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGc < 1:1826279/289‑1 (MQ=255) cTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGc < 2:1745182/289‑1 (MQ=255) tttcgcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAgg < 2:2142723/282‑1 (MQ=255) ttcgcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAcc < 1:1559232/131‑1 (MQ=255) ttcgcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAcc > 2:1559232/5‑135 (MQ=255) tcgcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 2:1854716/278‑1 (MQ=255) gcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGaaa > 2:2078754/2‑253 (MQ=255) gcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGaaa < 1:2078754/252‑1 (MQ=255) cAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAAtt > 1:812221/1‑289 (MQ=255) tGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCATTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATACCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATCGTCCCAAGATGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTGGt > 2:1957068/1‑289 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGc > 2:218885/1‑255 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGc < 1:218885/255‑1 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTta > 2:1703879/1‑289 (MQ=255) tAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCa < 1:391362/233‑1 (MQ=255) tAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTtattca < 1:1952992/289‑4 (MQ=255) atcaccTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGc > 2:893556/5‑267 (MQ=255) caccTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTccc > 1:1240963/3‑92 (MQ=255) tgtgctccTGGTTACCTTACAAGTGGGCAGACAAAAGTTGGGGTATGCCTTGGCTTCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTAccc < 2:2003740/283‑1 (MQ=255) tGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAAttt > 1:1785456/1‑263 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGGCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 2:1088173/289‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 1:2097187/289‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 1:1569428/289‑1 (MQ=255) cACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct > 2:1862854/1‑287 (MQ=255) cACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct > 2:179547/1‑287 (MQ=255) gTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATgg > 2:2208685/1‑125 (MQ=255) gTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCaga < 1:298547/226‑1 (MQ=255) gTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCaga > 2:298547/1‑226 (MQ=255) tAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAg < 1:1848801/288‑1 (MQ=255) aaCTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAgg < 1:1749132/225‑1 (MQ=255) aCTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTa > 2:510210/1‑289 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAg < 2:1379801/93‑1 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAAc > 1:1302321/1‑138 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGAc > 1:628/1‑161 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCa > 1:578908/1‑190 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGtt > 1:43050/1‑289 (MQ=255) aGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTAtt > 2:1936445/1‑289 (MQ=255) gggAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCt < 1:52804/262‑1 (MQ=255) gggAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCAt > 2:811974/1‑289 (MQ=255) tATGGCTGCAACCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTttatt < 2:2123580/288‑1 (MQ=255) gCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTtat > 2:1232197/1‑216 (MQ=255) cACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTttatta < 2:574272/281‑1 (MQ=255) cACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATg > 1:1881581/1‑288 (MQ=255) cACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATg > 2:1339355/1‑288 (MQ=255) cACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATg > 2:1423819/1‑288 (MQ=255) cACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCAGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct > 2:2021589/1‑234 (MQ=255) gagTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACAt > 1:2249198/1‑288 (MQ=255) ||| TCTGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTAGCGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTAAGCCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTAGCCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCAAGTCCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATAGTCAAATTCCCTTACCCAGTGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTAGTGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATAGTTCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCC > CP042583/459794‑460352 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |