| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 460,884 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 460,884 | 0 | A | T | 100.0% | 591.2 / NA | 245 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (109/136); total (109/136) | |||||||||||
| * | CP042583 | 460,885 | 0 | G | C | 100.0% | 577.8 / NA | 245 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (109/136); total (109/136) | |||||||||||
| * | CP042583 | 460,886 | 0 | T | A | 99.6% | 587.0 / NA | 245 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (109/135); total (109/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
GAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATAGTGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGTTTTATTATCTATCAAAGCTATGTTTCCCCCGGCGCTTTTGAAA > CP042583/460604‑461160 ||| tACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGAAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGaataa > 1:2168332/1‑289 (MQ=255) cTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAatat < 1:2130007/289‑1 (MQ=255) tGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATAtt < 2:81032/289‑1 (MQ=255) tGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATAtt < 1:26978/289‑1 (MQ=255) tGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATAtt < 1:775927/289‑1 (MQ=255) tttcccgcaTTAACTTTGATTTTGCATCGATTCGCCTAAACATAAATATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGTTATTCCTGCTTTACTCCTTAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTgg < 2:1437103/281‑1 (MQ=255) tGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTgg < 1:1983790/288‑1 (MQ=255) tGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTgg > 2:156757/1‑288 (MQ=255) tGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTgg < 2:1601967/288‑1 (MQ=255) tGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGc > 2:661021/1‑289 (MQ=255) gCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGGAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCa < 1:1543363/289‑1 (MQ=255) cacaATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGa > 1:1238967/1‑275 (MQ=255) cacaATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCa > 1:1976678/1‑287 (MQ=255) cacaATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCAc < 2:1157356/288‑1 (MQ=255) tagcTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTa < 1:706350/286‑1 (MQ=255) cTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATAACTATCCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAg < 1:1212885/289‑1 (MQ=255) tGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTGTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTTGCGTTTCCGTCACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATCTTGGCACCTTGGTActg > 2:2082131/1‑284 (MQ=255) tGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCatt > 2:2049488/1‑289 (MQ=255) tGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGCTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCatt > 1:2191547/1‑289 (MQ=255) gCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCatta < 1:1002197/289‑1 (MQ=255) gCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCatta > 2:950028/1‑289 (MQ=255) tGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCt < 1:830991/289‑1 (MQ=255) gcCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGa < 1:879483/288‑1 (MQ=255) cATCACTATTCCTCAGGTAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGaa < 1:602552/289‑1 (MQ=255) cACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAatat < 1:1764417/243‑1 (MQ=255) cACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATAtt < 2:1190584/244‑1 (MQ=255) cACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCAc < 2:2029464/249‑1 (MQ=255) ttCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGGTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTCTAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGAATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAAAAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCTGAAATGGACATCATTCACAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTCCAGCGCGCCATAATGCCGCTGAAAAGGGAACTGGCAAt > 2:1790089/1‑289 (MQ=255) tcaggcaGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACCGTTACAGTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGGGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAAAAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGga < 2:582765/283‑1 (MQ=255) cAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCa < 1:700570/238‑1 (MQ=255) aGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGCTAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGgag > 1:370708/1‑288 (MQ=255) aGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGc < 2:1945208/289‑1 (MQ=255) cGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGgaga < 2:1052863/283‑1 (MQ=255) cGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGgaga > 1:1052863/1‑283 (MQ=255) tAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTAc > 1:168608/1‑230 (MQ=255) tAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTAc < 2:168608/230‑1 (MQ=255) tAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGt > 2:1307010/1‑289 (MQ=255) tAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACAGCAATACAGGAAGt > 1:1416202/1‑289 (MQ=255) cgcTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGaa > 1:1008238/1‑256 (MQ=255) cgcTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGat > 1:65852/1‑289 (MQ=255) cgcTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGat > 1:2089160/1‑289 (MQ=255) ggTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAg < 1:2079682/222‑1 (MQ=255) tCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACAGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGtt < 2:1416202/289‑1 (MQ=255) gCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGTAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGAGAGCATTCAAAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACGGCGGGACATTATTCCGCTGAAAAGTGAACGGGGAATGTGAGAAGGCCATACAGGCAGTGAGATTGTAGATgggggttga > 2:786291/1‑282 (MQ=255) cTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGAtt < 1:1307010/289‑1 (MQ=255) aaGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCg > 1:1406069/1‑289 (MQ=255) agagTGGGATGAAGGTATTCCTGGTTTACACCTGAATTATAATTTGACCGGTAACAGGGGTAATGGTAACGATAGCTATTGTTTTAGTGAGCTCAGCGGGAGTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTGTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCg < 2:1346595/288‑1 (MQ=255) gTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAACATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCAc < 2:1970119/192‑1 (MQ=255) ggATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCgtg < 1:507089/284‑1 (MQ=255) ggATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCgtg > 2:507089/1‑284 (MQ=255) gATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTa < 1:1571732/288‑1 (MQ=255) gATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTa < 1:950028/288‑1 (MQ=255) ccTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTAttctt < 1:792366/289‑1 (MQ=255) tGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTAttct > 1:441626/1‑286 (MQ=255) tttATTCCTAAATTATAATTGCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTATGAAGCTCAGCGGGATTAATTTTGGCCCGTGGCGTTTACGAAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGat < 2:688324/289‑1 (MQ=255) tttACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGGGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGat < 2:2182094/289‑1 (MQ=255) tttACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTTGTGTACGGCTTTATTCTTCTGat > 1:1017808/1‑289 (MQ=255) tttACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGat < 2:1033300/289‑1 (MQ=255) tttACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGat < 2:231188/289‑1 (MQ=255) tttACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGat < 1:1082927/289‑1 (MQ=255) tttACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTACTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGat < 2:1406069/289‑1 (MQ=255) cTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGataata > 2:1648464/1‑289 (MQ=255) cTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGt > 2:704851/1‑289 (MQ=255) tGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTa < 1:1648464/289‑1 (MQ=255) tGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTa < 1:2047416/289‑1 (MQ=255) gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgcg < 1:1834417/174‑1 (MQ=255) gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGgaga > 2:1382955/1‑213 (MQ=255) aTTTTAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATcc < 1:533442/289‑1 (MQ=255) tttCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGc < 2:698515/289‑1 (MQ=255) tAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGGGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAggg > 1:133178/1‑289 (MQ=255) gTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTAttctt < 2:279063/249‑1 (MQ=255) gTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTAttctt > 1:279063/1‑249 (MQ=255) tAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTgg < 1:312505/132‑1 (MQ=255) aaTGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTAttctt < 2:173646/247‑1 (MQ=255) aaTGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTAttctt > 1:173646/1‑247 (MQ=255) aTGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAAGATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAAc < 1:69402/289‑1 (MQ=255) tGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCa > 1:2235968/1‑131 (MQ=255) gATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGAtt > 1:24646/1‑215 (MQ=255) gCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTgg > 2:305611/1‑118 (MQ=255) gCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAt < 2:620186/289‑1 (MQ=255) cTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGcccc < 1:1186626/273‑1 (MQ=255) cTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCAGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGAt < 2:898899/288‑1 (MQ=255) cTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATa > 1:988506/1‑238 (MQ=255) aTTAGTATTGGTCCTTGGCGTTGTCGCAACAATGGTTCCTGAAACTATTGTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTTGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAATCGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTTGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGa < 2:2235638/289‑1 (MQ=255) atatTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCg > 1:1375288/1‑289 (MQ=255) atTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCaa < 1:1357441/244‑1 (MQ=255) ggCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCGTTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGat > 2:1250496/1‑204 (MQ=255) ggCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGaa > 2:379805/1‑123 (MQ=255) ccGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAAt < 2:441626/288‑1 (MQ=255) tGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGgaga > 2:758512/1‑131 (MQ=255) tGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTa < 1:1107128/180‑1 (MQ=255) tGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCaaaa < 2:2166491/284‑1 (MQ=255) tGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCaaaa < 1:683752/284‑1 (MQ=255) tGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGtt > 1:2011964/1‑289 (MQ=255) acaaTGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGTTTTATTATCTATCa > 1:128787/1‑289 (MQ=255) aTGGTTTCTTGATATAGTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGTTTTATTATCTATCAAAg < 2:1005883/289‑1 (MQ=255) ggAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTg < 2:1880891/171‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCaa < 2:486709/107‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCaa > 1:486709/1‑107 (MQ=255) aaTGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGTTTTATTATCTATCAAAGCTATGTTTCCCCCGGCGCTTTTGaaa > 1:390847/1‑289 (MQ=255) ||| GAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCTCACGGTTACATTCCGCCTGAAGAGTGGGATGAAGGTATTCCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAGCGGGATTAATATTGGCCCGTGGCGTTTACGCAACAATGGTTCCTGGAACTATTTTCGCGGAAATGGATATCATAGTGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGCGCGCCATTATTCCGCTGAAAAGTGAACTGGTAATGGGAGACGGCAATACAGGAAGTGATATTTTCGATGGCGTTGGATTTCGTGGTGTACGGCTTTATTCTTCTGATAATATGTATCCTGATAGCCAGCAAGGGTTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGTTTTATTATCTATCAAAGCTATGTTTCCCCCGGCGCTTTTGAAA > CP042583/460604‑461160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |