Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 744,068 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 744,068 | 0 | A | T | 99.3% | 642.3 / NA | 273 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (126/142); minor base G (1/1); total (129/144) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 744,069 | 0 | G | C | 98.5% | 636.5 / ‑2.4 | 273 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base C (127/141); minor base T (1/3); total (129/144) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.25e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 744,070 | 0 | T | A | 98.2% | 637.4 / ‑2.3 | 273 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base A (126/141); minor base C (2/3); total (129/144) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
ATGCGGATGAGAAACTGGATCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TAGTAGCGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTAGCGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGAGTTTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGGCGCGG > CP042583/743790‑744347 ||| aTGCGGGTGAGAAACTGGATCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGGCTCATCG‑GTAATGTTCCTCAAACCGGGCGGTCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGAGTATCCAGTCCGGTAATGACGACTGTATTGCGCTGGCTGAGTA‑CGTTGCCGGGCTCCAGGAGGCCTTTATTgg > 2:1990419/1‑289 (MQ=255) aTGCGGATGAGAAACTGGATCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTgg > 1:816246/1‑289 (MQ=255) tGCGGATGAGAAACTGGATCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGAACAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGt < 2:1861383/289‑1 (MQ=255) gATGAGAAACTGGATCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCtga > 1:1422841/1‑289 (MQ=255) gATGAGAAACTGGATCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCtg < 1:1048774/288‑1 (MQ=255) tCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGcc > 1:64784/1‑289 (MQ=255) ccTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTg > 2:330027/1‑289 (MQ=255) gACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGt < 1:869161/289‑1 (MQ=255) aCTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGt < 2:1833959/288‑1 (MQ=255) aaaaTCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTACCGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTg < 1:235090/289‑1 (MQ=255) aaaTCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGAc < 2:64784/289‑1 (MQ=255) aTGATCGGCTATGTGGGTGGGCAGGCGCTTAAGGCAGATAAGATTAAACTCACCGATGTAGTGACGGTCGGGAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAaca < 1:1098138/289‑1 (MQ=255) gaacAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACt < 1:1665427/286‑1 (MQ=255) acaacgtATGTGGGTGTGAAGGGCCTTAGGGCGGATAAGATGAAACTACCCGATATGGGGACGGTGGGTAAGGATGCCTGGGCGACGGGAACTCCGGCACTGCGTGG‑TTCCTCGGGAATGTTCCACAAACCGGGCGATTAGGTTACGGTGGCAGCCTTGAACTAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGGATTGCGCTTGCTGATTA‑CGTTGCCGTGAGCCACGAGTCATTTATTGGTCTGGTGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACt < 2:1103898/282‑1 (MQ=255) cAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACt > 2:1081158/1‑286 (MQ=255) cAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACt < 1:1081158/286‑1 (MQ=255) gCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACt > 2:1884567/1‑284 (MQ=255) gCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCt > 1:164221/1‑288 (MQ=255) tgGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACt < 1:465682/278‑1 (MQ=255) tgGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGAc > 2:1287556/1‑289 (MQ=255) tgGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGAc > 1:611928/1‑289 (MQ=255) tGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGAGTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTg < 2:589323/289‑1 (MQ=255) gggCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAAc > 2:1947517/1‑256 (MQ=255) gggCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAAc < 1:1947517/256‑1 (MQ=255) gggCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGc > 1:1024852/1‑289 (MQ=255) gCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCa < 2:1329449/288‑1 (MQ=255) ggCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACgg > 1:696771/1‑288 (MQ=255) gcgcTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACt < 1:332859/267‑1 (MQ=255) ccGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATgcgc > 2:83649/1‑288 (MQ=255) cGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGc > 2:1545781/1‑277 (MQ=255) cGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGc < 1:1545781/277‑1 (MQ=255) aTAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCggg > 2:520753/1‑289 (MQ=255) tAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCgggg < 1:122149/289‑1 (MQ=255) tAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCGGGATGCGCCggg > 1:1979201/1‑288 (MQ=255) aCCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACt < 2:1595191/240‑1 (MQ=255) ccGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCgggg < 1:2226734/275‑1 (MQ=255) tatGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACcgcgcg < 2:696771/288‑1 (MQ=255) aCGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATg > 1:1706632/1‑288 (MQ=255) ggtcggtAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTg > 2:1730043/1‑241 (MQ=255) aaGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTggg < 1:79666/289‑1 (MQ=255) tGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTa < 2:816246/287‑1 (MQ=255) tGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTa < 1:1384950/287‑1 (MQ=255) ccTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCgggg > 2:1687762/1‑248 (MQ=255) ccTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATgg > 2:1404756/1‑273 (MQ=255) ccTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCt > 1:41091/1‑280 (MQ=255) ccTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGc > 2:2062172/1‑289 (MQ=255) cTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCa < 1:2062172/289‑1 (MQ=255) ggCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGAc > 2:548986/1‑201 (MQ=255) ggCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCgggg < 1:262206/244‑1 (MQ=255) cGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGTTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATcc > 1:1182883/1‑288 (MQ=255) aaaTCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGa < 1:520753/288‑1 (MQ=255) aaaTCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGa < 1:1797581/288‑1 (MQ=255) aaaTCCGGCACTGCGTGG‑TTCATCGGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGa < 2:1069040/288‑1 (MQ=255) cgtggttcatcggTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCACAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCGTGGTAAAGAATTGCTCCACGATGTGCCGGAagact > 1:540246/13‑287 (MQ=255) cgtggttcatcggTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATgg < 2:586630/235‑1 (MQ=255) cgtggttcatcggTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑Gt > 1:1744687/13‑289 (MQ=255) cgtggttcatcggTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑Gt > 1:2180218/13‑289 (MQ=255) gtggttcatcggTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑Gt < 1:2101943/277‑1 (MQ=255) tggttcatcggTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGCCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTAc > 2:239214/11‑289 (MQ=255) atcggTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCg > 1:549505/5‑274 (MQ=255) cggTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCa > 2:441214/3‑289 (MQ=255) aTGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGAGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGCTATGGCAGTGCTGGGGAAAGCATTGACCCACGATCGGCCGGAAGA‑GCACGCCACTCATaaag > 2:179323/1‑289 (MQ=255) ttCCTCAAACAGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATaaagaga < 1:2023401/289‑1 (MQ=255) ccTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCa < 1:358727/183‑1 (MQ=255) cGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCCGTTCAGCCCCGACCGCGATATGGCAATGCTGGGTAAAGGATTGATCCACGAAATCGCGGAACATGACCGCCTTTC‑TAAAGAGAAAGAGttac > 2:948138/1‑286 (MQ=255) cGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCa > 2:2131413/1‑288 (MQ=255) gggCGATCAGGTTTCGGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCAcc < 1:2131413/289‑1 (MQ=255) caggtttcggTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATCAAGAGAAAGAGTTCACCTTccaac > 1:1837349/10‑285 (MQ=255) gtttcggTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACaaa < 1:1694169/282‑1 (MQ=255) gTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGt < 2:1024852/288‑1 (MQ=255) cAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGc < 1:441214/288‑1 (MQ=255) gAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCACCCcaaccga > 2:2216654/1‑288 (MQ=255) gtgtGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTTACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTc < 2:869190/288‑1 (MQ=255) gtgtGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTg > 1:920137/1‑188 (MQ=255) gATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTctgctg < 2:164221/289‑1 (MQ=255) aTCCAGTCCGGTAATAACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACcgcgcg > 1:1357388/1‑167 (MQ=255) ccAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGc > 2:13844/1‑263 (MQ=255) cAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGGAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGagca < 1:1408497/289‑1 (MQ=255) gTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGagcagc > 2:1272781/1‑289 (MQ=255) tCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCg > 2:458264/1‑204 (MQ=255) aCGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCt > 1:820668/1‑166 (MQ=255) gCCTGTATGCGGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCAGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTg < 2:338529/289‑1 (MQ=255) tATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCCTAACGAGAAAGAGTTCACCTTCAACCAAATTCGTCAGCCTAACCGCAACCGTCTGCTCTGGACCAGCAATCTGAATTTTGATTGc > 2:2043928/1‑289 (MQ=255) ttGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCAt > 1:1464517/1‑289 (MQ=255) tGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATg < 1:1287556/289‑1 (MQ=255) tGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATg < 1:1877086/289‑1 (MQ=255) cgcTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCCTTCATAAAGAGAAAGAGTTCAACTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTATCCGTCTGCTGGCGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGag > 2:1205332/1‑288 (MQ=255) ggctgATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACa < 1:83649/289‑1 (MQ=255) gctgATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCACCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGACCACACACCCGAATCTTGATGGCATGAAGACAg > 2:1938628/1‑289 (MQ=255) ttA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGCTGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGAAAGGAAc > 1:1587280/1‑288 (MQ=255) ttA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAAc < 1:30856/288‑1 (MQ=255) ttGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAaga < 1:1004796/172‑1 (MQ=255) ttGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAaga > 2:1004796/1‑172 (MQ=255) ttGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACgg > 2:380019/1‑288 (MQ=255) ttGCCGGGAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCC‑AAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCa > 1:397820/1‑289 (MQ=255) gggAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGgcg < 2:1430000/289‑1 (MQ=255) gAGCCAGGATTCATTTATTGGGCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACGGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGGGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGgcgc < 2:210360/288‑1 (MQ=255) gAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGgcgc < 2:410342/288‑1 (MQ=255) gAGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGgcgc < 1:1272781/288‑1 (MQ=255) aGCCAGGAGTCATTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCAACTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGGCTGCTGTGGCGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGACGACAGGAAACACGGCCgggccgg > 2:2166839/1‑284 (MQ=255) ||| ATGCGGATGAGAAACTGGATCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGTGG‑TAGTAGCGTAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTAGCGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTA‑CGTTGCCGGGAGCCAGGAGAGTTTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGA‑GTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCTTCAACAAAATTCGTCAGCCTAACCGTAACCGTCTGCTGTGGAGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGGCGCGG > CP042583/743790‑744347 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |