| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 744,575 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 744,575 | 0 | A | T | 99.1% | 521.6 / NA | 225 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (112/108); minor base C (1/1); total (115/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 744,576 | 0 | G | C | 99.6% | 522.8 / NA | 225 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (114/110); minor base T (1/0); total (115/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 744,577 | 0 | T | A | 100.0% | 533.0 / NA | 225 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (115/110); total (115/110) | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
AGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTAGCGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCAGTGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCAGCTGGTTCTCTTAATCTTCTGATAACCGGATGGCGCGAAACGTCATC > CP042583/744296‑744856 ||| agcaATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGCGGCCACCTTTGTGCCTCAGCGCGGCTGGTTTGGTGTATAGAGCGAAGGTAATCCCGGGGGAGGTGGAGCGGGCCCAGTGACTATAc > 2:171101/1‑289 (MQ=255) gATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGGGGGCAGCTGa > 2:623459/1‑289 (MQ=255) aTGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGaa > 2:2180686/1‑289 (MQ=255) gCATGAAGACAGGAACCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGaaaaa > 2:364405/1‑289 (MQ=255) aTGAAGACAGGAACCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTCCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCACTTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGTGTCTGGTTTGGTGATAAGAGGGAAGTGAATCTCGGCGCCGGTGAAGCGGGCTCAGCGACCATACCACGTGCGGAGCCGAAAAAc > 2:2068518/1‑288 (MQ=255) gAACCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATCCCGCGGGGGCAGCGAAAAAACCTGCAAGCGAg > 2:2251820/1‑289 (MQ=255) aaCCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGaaa < 1:1512757/283‑1 (MQ=255) aaCCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAg < 2:1301344/284‑1 (MQ=255) aaCCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAg < 1:769933/284‑1 (MQ=255) aaCCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGc < 2:2045180/285‑1 (MQ=255) cGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCCCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGGCAGTtaacc > 2:1169470/1‑286 (MQ=255) gcgcGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGc > 1:2046326/1‑274 (MQ=255) gcgcGGGATATAATCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTaa < 2:1398107/288‑1 (MQ=255) aTCTGGTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCGGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCt > 1:1776006/1‑289 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGt > 2:1659409/1‑262 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGt < 1:1659409/262‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTacc > 1:752578/1‑289 (MQ=255) ggTTGCTTCGGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTac > 1:1425820/1‑288 (MQ=255) ttgcttcggcTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGt > 2:194492/9‑260 (MQ=255) ttgcttcggcTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTaccg > 2:1339114/9‑288 (MQ=255) ttcggcTACCCAGGGCGATCTGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAGCCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTaccgcaccg < 2:884989/285‑1 (MQ=255) tACCCCGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTGGGGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGaa < 2:1715405/288‑1 (MQ=255) ggCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGCTTGGGGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGGGACCATACCGCGAGGGAAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTc > 1:1708384/1‑289 (MQ=255) gcgtgatgctgttAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAGACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTc < 2:146159/277‑1 (MQ=255) gCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTc < 1:1902014/288‑1 (MQ=255) gATATGCGTCTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGGTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGGGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAg < 2:776478/288‑1 (MQ=255) tatGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCAt > 1:1479397/1‑204 (MQ=255) tatGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAg > 1:2221243/1‑233 (MQ=255) gTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCGCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCGGAAAGCGAGGTATACGTTAACGGAACCGCAACTTACCTCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGtttgcgg > 2:542997/1‑284 (MQ=255) cGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTaa < 2:1576945/233‑1 (MQ=255) cGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTaa > 1:1576945/1‑233 (MQ=255) tgtTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCa > 1:2178724/1‑238 (MQ=255) ttGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCa < 1:1264264/236‑1 (MQ=255) ttGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCa > 2:1264264/1‑236 (MQ=255) gtgggCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCtt < 2:1146401/287‑1 (MQ=255) ggggCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGTTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTa > 1:1029323/1‑289 (MQ=255) ggggCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGTTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCCGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAGCCGCAGCTTACCCCACCGCTGAAAAAAGCTCAGGTTGTCGGGACCATGCATTTCCAGCTTa > 2:1499198/1‑289 (MQ=255) ggggCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTa > 1:1143656/1‑289 (MQ=255) gggCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTa < 1:2087993/288‑1 (MQ=255) ggCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCGGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTa > 1:876449/1‑287 (MQ=255) ggCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAAc > 1:918917/1‑289 (MQ=255) gCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCGCCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAAc < 1:921798/288‑1 (MQ=255) gAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAAc < 1:1007393/224‑1 (MQ=255) gAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAAc > 2:1007393/1‑224 (MQ=255) gAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCg > 1:429486/1‑226 (MQ=255) gAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCg < 2:429486/226‑1 (MQ=255) gAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACgg < 1:1339114/288‑1 (MQ=255) aaaCCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGTGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTaa < 1:602976/289‑1 (MQ=255) accgaccgTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAAt < 1:573404/289‑1 (MQ=255) gaccgTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACTCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGGCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGACTCTCCGGGCGGGTGAACCGGGCTCAGTCACCATACCGCGTGGGCAGCGGAAAACCCTGAAAGCGACATAAACGTTCACGGACCGGGACACTACCGCCCCGCACAAAAAACGACACGCTTGCGTCACCATTGTCTCCCCGCTTCACGGCAAATc > 2:1562187/1‑287 (MQ=255) accgTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGGCGGGACCATTGATTTACAGCTCAACGGTAAATCCAt > 2:573404/1‑289 (MQ=255) aTCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGagc < 1:364873/289‑1 (MQ=255) tttAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTc < 1:1820665/289‑1 (MQ=255) ttattGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGaaa > 1:2161533/1‑289 (MQ=255) gACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAAtgtg > 2:2031494/1‑289 (MQ=255) cTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGaaa > 2:94064/1‑281 (MQ=255) tGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAag < 1:221582/289‑1 (MQ=255) gggTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTCAACGGTAATTCCATTGAGCAGCGTCCGCTGACGGTGATGGAAAATGTGGAagag > 2:627798/1‑289 (MQ=255) ttCCGGTTCTTTGAAACCGGGACGCCAATTAAACCGGATGCCACCTGTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCg < 2:752578/289‑1 (MQ=255) ttCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAGTTAACCCTGAGGCCACCTTTGTGACTGAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCg < 2:1425820/289‑1 (MQ=255) ttCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGc < 2:1688312/288‑1 (MQ=255) ttCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCg < 1:1670560/289‑1 (MQ=255) tCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGaaa < 1:1788939/273‑1 (MQ=255) tCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGaaa > 2:1788939/1‑273 (MQ=255) tCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCgg > 1:447709/1‑289 (MQ=255) tGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGt < 2:447709/289‑1 (MQ=255) tGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGt < 1:139556/289‑1 (MQ=255) tGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGt > 1:351919/1‑289 (MQ=255) gAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTc < 1:1169470/289‑1 (MQ=255) acccttGACGCCAATTACACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGACAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCgg < 2:239469/284‑1 (MQ=255) cggtaCGCCAATTAAACCGTATGCCACCTTTGGGACTCCGGGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGgtg < 2:918917/285‑1 (MQ=255) tGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGtgtg > 2:1991076/1‑289 (MQ=255) tGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGtgtg > 1:645081/1‑289 (MQ=255) aaTTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTc < 1:1499198/289‑1 (MQ=255) gATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGtgatgatga > 1:1193653/1‑289 (MQ=255) aTGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGaa > 1:612237/1‑289 (MQ=255) aTGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGaa > 1:1244642/1‑289 (MQ=255) aTGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGGCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGaa > 2:1536738/1‑289 (MQ=255) tGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAag > 1:1967341/1‑245 (MQ=255) tGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGaaa < 1:1409553/289‑1 (MQ=255) tgtgACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTc < 1:2248733/254‑1 (MQ=255) tgtgACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAg < 2:134501/289‑1 (MQ=255) cAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCg > 2:868332/1‑289 (MQ=255) aGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAGTCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCt < 2:256320/205‑1 (MQ=255) aGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGtgatgat < 2:2218141/268‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTTAGCAGCGTCCGCTGATCGTTATGGAAAATGCGGAAGAGGGCGGCTTCTTGGGTCGGGTGTGGGAGTTCGTGATGGTGAAATTCCATCAGTGTTTCGGCa > 2:1358594/1‑289 (MQ=255) cgcgTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCa > 1:950414/1‑289 (MQ=255) cgcgTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCa > 1:1774783/1‑289 (MQ=255) cTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCAGCTgg < 2:1193653/289‑1 (MQ=255) tGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTGGGCAGCTGGt > 1:1654421/1‑289 (MQ=255) gTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCt > 2:180242/1‑121 (MQ=255) tGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCAGCTGGTTCTCTTa < 1:228098/288‑1 (MQ=255) aTAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCAGCTGGTTCTCTTAAt < 2:1754282/288‑1 (MQ=255) aaGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCAGCTGGTTCTCTTAAtctt < 2:2161533/289‑1 (MQ=255) gCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCAGCTGGTTCTCTTAAtcttct < 1:1740018/287‑1 (MQ=255) cGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATc < 2:2195275/254‑1 (MQ=255) cGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATc > 1:2195275/1‑254 (MQ=255) cGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCAGCTGGTTCTCTTAATCTTCTGa < 1:1049344/288‑1 (MQ=255) cGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCAGCTGGTTCTCTTAATCTTCTGAt > 1:822194/1‑289 (MQ=255) ggggCAGGTGAAGCGGGCTCAGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGAAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAATAGGGCGGATTCTGTGGTCGGGTGTGTGATTTCGTGATGATGAAATTCCATTAGTGGTTCGGCAGCTGGTTCTCTTACTCTTCTGATAACCGGCTGgcac > 2:1424730/1‑287 (MQ=255) ||| AGCAGCAATCTGAATGTTGATGGCATGAAGACAGGAACCACGGCAGGCGCGGGATATAATCTGGTTGCTAGCGCTACCCAGGGCGATATGCGTTTAATCTCCGTAGTGTTGGGGGCGAAAACCGACCGTATCCGTTTTAATGAGTCTGAGAAATTATTGACCTGGGGTTTCCGCTTCTTTGAAACCGTGACGCCAATTAAACCTGATGCCACCTTTGTGACTCAGCGCGTCTGGTTTGGTGATAAGAGCGAAGTGAATCTCGGGGCAGGTGAAGCGGGCAGTGTGACCATACCGCGTGGGCAGCTGAAAAACCTGAAAGCGAGTTATACGTTAACGGAACCGCAGCTTACCGCACCGCTGAAAAAAGGTCAGGTTGTCGGGACCATTGATTTCCAGCTTAACGGTAAATCCATTGAGCAGCGTCCGCTGATCGTGATGGAAAATGTGGAAGAGGGCGGATTCTTTGGTCGGGTGTGGGATTTCGTGATGATGAAATTCCATCAGTGGTTCGGCAGCTGGTTCTCTTAATCTTCTGATAACCGGATGGCGCGAAACGTCATC > CP042583/744296‑744856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |