Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 758,638 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 758,638 | 0 | A | T | 99.2% | 604.4 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (132/127); minor base G (0/2); total (136/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 758,639 | 0 | G | C | 99.6% | 607.6 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (135/128); total (136/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 758,640 | 0 | C | G | 99.2% | 624.3 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (134/129); total (136/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
GGCCCTGGCCCGAAGCCTTGCGAAGCGCCCGAAACTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCAGCGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATAGCCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCAGCGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCG‑AAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTAGCGTGTATCACGTTCGTCTGAAAAGTGGGCAGATGATTAGCGCCCA > CP042583/758358‑758918 ||| tggcccGAAGCCTTGCGAAGCGCCCGAAACTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCtt > 1:1887852/1‑289 (MQ=255) ggcccGAAGCCTTGCGAAGCGCCCGAAACTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCttt > 1:199129/1‑289 (MQ=255) aGCCTTGCGAAGCGCCCGAAACTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCg < 1:1931033/289‑1 (MQ=255) gCGAAGCGCCCGAAACTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCa < 1:1165908/289‑1 (MQ=255) cgcCCGAAACTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAAAGCCTTTTAAAGCGTACCCACAAAGc > 2:1165908/1‑289 (MQ=255) cgcCCGAAACTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGAGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTACGAATCGTGGGAAATTTGTCCATATTTGCTAACCGGAAGAGATCTACGATCATCCGCCGCCCCGCTAAAGGCCCGAAATTATTGGC‑TCGTGCAACGTCTTGGAAGGCGTATCAAAagaga > 2:125572/1‑288 (MQ=255) gcCCGAAACTATTACTGCTCGATGTGCCGATGGGCGCGCTTGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTTGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGc < 1:796179/288‑1 (MQ=255) cccGAAACTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCg > 2:487230/1‑288 (MQ=255) cTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAg < 1:701067/289‑1 (MQ=255) cTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGcc < 1:604915/289‑1 (MQ=255) cTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTgg > 1:514223/1‑289 (MQ=255) cTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTgg > 1:929796/1‑289 (MQ=255) tCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCCCGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACAGGACGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATATCGCCGAATTTATTGGCACCGT‑AACCGGCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGCCATGAAGATGGCCTGGt > 2:1449572/1‑289 (MQ=255) tCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGt > 2:1746159/1‑289 (MQ=255) tCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCAGCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTCCTCAAAGAGCGTCCGGAAGATGGCCTGGt > 2:985855/1‑289 (MQ=255) tGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGCAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCCATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCCTTTAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGagtcccc > 2:92281/1‑283 (MQ=255) 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tGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGTGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAACAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATTCACTTAAAGttctcgcggg > 2:1924902/1‑280 (MQ=255) tGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGAttcgc > 1:213255/1‑251 (MQ=255) tGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGa > 1:1005449/1‑289 (MQ=255) ggAAGTGGTGGATATTCTTGAGCGCGTCGGTGTGACTGGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGcctcg < 1:1875106/288‑4 (MQ=255) gAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCTACGCGCATGccgcgg > 2:1132081/1‑285 (MQ=255) gAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGcctcgg > 1:627580/1‑285 (MQ=255) 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atatTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATa < 2:204996/288‑1 (MQ=255) tatTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATaa < 1:1814024/288‑1 (MQ=255) atTCTGGGGCGGGTAGGTGTGACTTGTGTGTTGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGACAGTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGACCCGGAAGAGATCTACTAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACg < 2:1887852/289‑1 (MQ=255) atTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACg < 1:487230/289‑1 (MQ=255) ttCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGAt < 1:1868494/269‑1 (MQ=255) tGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGcc < 1:1361525/289‑1 (MQ=255) tGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCGGGTTCCTCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGGTGTCGATAAccgct > 2:2145459/1‑284 (MQ=255) cgcgTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTAc > 1:1472725/1‑289 (MQ=255) cgcgTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTAc > 1:1635512/1‑289 (MQ=255) 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ccGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCG‑AAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTCGGTGTATCACGTTCGTCTGAAAAGTggg < 2:128366/289‑1 (MQ=255) ccGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCG‑AAGAACCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTggggg < 1:751060/227‑1 (MQ=255) gCTATAGCGCCGAATTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCAGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCG‑AAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTCGGTGTATCACGTTCGTCTGAAAAGTGGGCa > 1:2176231/1‑289 (MQ=255) cgcCGAATTTATTGGCTCGGT‑AGACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCG‑AAGAGCCGCCCGCCa > 1:2153249/1‑194 (MQ=255) aaTTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCG‑AAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATaca > 2:738331/1‑223 (MQ=255) aTTTATTGGCTCGGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATTCGCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCTCGGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCG‑AAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTTCGGTGTATCACGTTCGTCTGAAAAGTGGGCAGATGATTAGCGcc < 2:893239/289‑1 (MQ=255) ||| GGCCCTGGCCCGAAGCCTTGCGAAGCGCCCGAAACTATTACTGCTCGATGAGCCGATGGGCGCGCTGGATAAAAAGCTGCGTGACAGGATGCAGCTTGAAGTGGTGGATATTCTGGAGCGCGTCGGTGTGACTTGTGTGATGGTCACCCACGATCAGGAAGAGGCGATGACCATGGCGGGGCGCATCGCCATTATGAATCGTGGGAAATTTGTCCAGATTGGCGAACCGGAAGAGATCTACGAGCATCCGACTACCCGCTATAGCGCCGAATTTATTGGCAGCGT‑AAACGTCTTTGAAGGCGTACTCAAAGAGCGTCAGGAAGATGGCCTGGTGCTTGATAGCCCGGGGCTGGTGCATCCACTGAAAGTCGACGCGGATGCCAGCGTGGTCGATAACGTGCCGGTACATGTGGCGCTGCGCCCGGAAAAAATCATGCTTTGCG‑AAGAGCCGCCCGCCAATGGTTGTAACTTCGCGGTGGGGGAGGTGATACACATTGCCTATCTCGGCGATCTTAGCGTGTATCACGTTCGTCTGAAAAGTGGGCAGATGATTAGCGCCCA > CP042583/758358‑758918 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |