| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 761,339 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 761,339 | 0 | A | T | 99.2% | 587.2 / NA | 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.27e-01 | |||||||||||
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| * | CP042583 | 761,340 | 0 | G | C | 100.0% | 593.0 / NA | 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (119/130); total (119/130) | |||||||||||
| * | CP042583 | 761,341 | 0 | C | G | 100.0% | 586.1 / NA | 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (119/130); total (119/130) | |||||||||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTG‑TGCGTTTAGTCTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTAGCCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAAAGTAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATGCTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCAGCACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGT‑CGCCCCTGATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAGAGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGCCGACTTTCCGGTTGAGGAATGGTGCGCGCCGGTGAGTGGCCCGGAACAAGGGTTTCGTAATAAAGCCAAAATGGTGGTGAGTGGTAGCGTTGAAAAA > CP042583/761061‑761618 ||| gAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTG‑TGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATGCTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCTCGACCAGTCGGCGGttctt > 2:776694/1‑288 (MQ=255) 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TACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTG‑TGCGTTTAGTCTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTAGCCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAAAGTAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATGCTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCAGCACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGT‑CGCCCCTGATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAGAGCAACTCTCCGCTAAAACCGCCGATCTTAAAAATCTGCTCGCCGACTTTCCGGTTGAGGAATGGTGCGCGCCGGTGAGTGGCCCGGAACAAGGGTTTCGTAATAAAGCCAAAATGGTGGTGAGTGGTAGCGTTGAAAAA > CP042583/761061‑761618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |