Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 807,149 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 807,149 | 0 | A | T | 99.7% | 799.3 / NA | 341 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (172/167); minor base C (1/0); total (173/168) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 807,150 | 0 | G | C | 99.4% | 796.8 / NA | 341 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base C (170/168); total (173/168) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 807,151 | 0 | C | G | 99.1% | 795.5 / NA | 341 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base G (171/167); total (173/168) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
AATAGCCGCCCGACCGGGGATACCACTGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTAGTCCAATGCGCGCTTTTAA‑CAGCCTCAACCGGGTAGGGGCTAGTGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTAGCATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGAGTCCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTGGGTTAC > CP042583/806869‑807430 ||| aaTAGCCGCCCGACCGGGGATACCACTGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAAc < 2:1810848/289‑1 (MQ=255) tAGCCGCCCGACCGGGGATACCACTGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCGTGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCg > 1:1906266/1‑289 (MQ=255) cccGACCGGGGATACCACTGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCCTAGGCTTTATCGCCTCTATGCCCCATCTTGGTTCCCTCATCGGCGCTTTTAA‑CTTGCCCAACCGGGTAgg > 2:558822/1‑289 (MQ=255) cccGACCGGGGATACCACTGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAgg > 2:2087998/1‑289 (MQ=255) cccGACCGGGGATACCACTGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAgg > 1:1739224/1‑289 (MQ=255) aTACCACTGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCttcagca < 1:1072575/288‑7 (MQ=255) tACCACTGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTAGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGTCCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTATATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCttcagcact < 1:1966972/289‑9 (MQ=255) tGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTa > 1:1328584/1‑288 (MQ=255) ggCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCttca < 2:832971/277‑4 (MQ=255) aggaggTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTTGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCTCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATGGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCATTTAATCCGCC‑CTACCGGGTAGTGGCTTCCGCACCCCGTACCGCAATCCCCAGCG‑Gttcgt > 2:1655056/1‑285 (MQ=255) gtgtGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCttt > 2:1715259/1‑289 (MQ=255) ggAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCttcagc < 1:509254/245‑6 (MQ=255) gAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGCTGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTGTTAA‑CTCGCCCAACCCGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTCACCACACCGCCAGCG‑GT‑TCGTCtttttttgacctcg > 2:1166651/1‑280 (MQ=255) gAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAgg > 1:35435/1‑289 (MQ=255) gAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAg > 1:709511/1‑288 (MQ=255) gAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAg > 2:1956930/1‑288 (MQ=255) gATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCa > 1:517473/1‑288 (MQ=255) ggCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAACTCGCCAGCG‑GTCCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCCTCgg > 2:399689/1‑289 (MQ=255) ccGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTa < 1:381998/232‑1 (MQ=255) cGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGc > 1:682642/1‑289 (MQ=255) cGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGc > 2:549992/1‑289 (MQ=255) cACGGTCTTCGGGAAATGTGTGGACGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAg < 2:60735/289‑1 (MQ=255) tCTTCGGGCAATGGGTAGCAGGTGGTGTTATCGTTATGGCTTTGGGGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgt < 2:924830/288‑2 (MQ=255) gCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgtcaccggc < 2:485576/288‑9 (MQ=255) atggtgtGGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCAt < 2:798755/285‑1 (MQ=255) aTGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCAtt > 1:924830/1‑288 (MQ=255) aTGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTg > 1:483568/1‑289 (MQ=255) aTGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTGCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAAGGCTGAAAAAGCTgtcaccggctatg > 2:1375632/1‑277 (MQ=255) gtgtAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCg < 1:2045101/289‑1 (MQ=255) gtggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCt > 1:990257/1‑240 (MQ=255) gtggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCttgg > 2:1700085/1‑286 (MQ=255) gtggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCtgtg > 1:329646/1‑289 (MQ=255) gtggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCtgtg > 1:1485203/1‑289 (MQ=255) gtggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGCAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCtgtg > 2:241458/1‑289 (MQ=255) ggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgtcaccggc > 1:286797/1‑264 (MQ=255) ggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTTAGGTGTGGc > 2:1092381/1‑289 (MQ=255) ggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCtgtg > 1:1534993/1‑287 (MQ=255) ggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCtgtg > 1:2114984/1‑287 (MQ=255) ggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTgg < 1:1140062/288‑1 (MQ=255) ggtTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTgg > 2:1140062/1‑288 (MQ=255) cTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGa > 1:1587454/1‑289 (MQ=255) tgctCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCg < 2:149670/288‑1 (MQ=255) tgctCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCg < 1:2087323/288‑1 (MQ=255) cGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGt < 1:1790580/288‑1 (MQ=255) cGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTATAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGt < 2:272588/288‑1 (MQ=255) gACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCt < 1:184026/289‑1 (MQ=255) aCCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCAt < 1:944564/196‑1 (MQ=255) aCCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgtcacc > 1:555829/1‑227 (MQ=255) aCCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACg > 1:1933877/1‑245 (MQ=255) aCCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACg < 2:1933877/245‑1 (MQ=255) aGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc < 2:2147874/287‑1 (MQ=255) agcGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGtata < 2:308304/288‑1 (MQ=255) gcGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAAc > 2:580655/1‑289 (MQ=255) cgttttttggccgccATGTTTGGTTTATGTGTGCTGTTGTGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCGATGCGCGCTTTTAA‑CTCGGTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAAc < 2:3590/274‑1 (MQ=255) cGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAAc < 2:7077/288‑1 (MQ=255) gttttATTGCCTGCTTGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATaa < 2:1403014/283‑1 (MQ=255) tgtTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTgtcaccg > 2:1789802/1‑202 (MQ=255) tgtTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAAc < 1:2004498/286‑1 (MQ=255) tgtTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGc > 1:811939/1‑289 (MQ=255) tgtTACCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGc > 1:1700587/1‑289 (MQ=255) gCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATa < 1:241458/289‑1 (MQ=255) gCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATa < 1:1453470/289‑1 (MQ=255) tttGTTTTATGGGTGCTGATGGGCTTTGGCTTTATCCCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATTCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGa < 1:847736/289‑1 (MQ=255) tGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGAcc < 1:695200/289‑1 (MQ=255) tATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTa < 1:399689/289‑1 (MQ=255) tATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTa < 1:1392001/289‑1 (MQ=255) ccgggggcgtaTGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCAGCTTGGTTCCGCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTa < 2:2051347/278‑1 (MQ=255) aTGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTAc < 1:1003646/289‑1 (MQ=255) gCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTTCGACCTgtgacggta > 2:176217/1‑279 (MQ=255) gCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCAt < 1:1655738/288‑1 (MQ=255) aTGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTc < 2:512488/268‑1 (MQ=255) aTGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTgg > 2:327025/1‑288 (MQ=255) cATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCt < 2:1240889/183‑1 (MQ=255) cATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCg > 1:872050/1‑289 (MQ=255) tGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc < 1:2177355/233‑1 (MQ=255) tGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc > 2:2177355/1‑233 (MQ=255) tGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTc > 2:345552/1‑260 (MQ=255) tATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGct > 2:1917008/1‑287 (MQ=255) aTCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGcttct > 2:1447595/1‑289 (MQ=255) ctctATGCTCCATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCg > 2:2248116/1‑197 (MQ=255) cATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGgatga < 1:1161193/205‑1 (MQ=255) cATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc < 2:68732/211‑1 (MQ=255) cATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTa < 1:768926/248‑1 (MQ=255) cATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTa > 2:953822/1‑289 (MQ=255) cATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTa > 2:1575445/1‑289 (MQ=255) cATCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTa > 2:1023386/1‑289 (MQ=255) tCTTGGTTCACCAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATg > 1:6277/1‑289 (MQ=255) cttggttcaccAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATgg > 1:124752/10‑289 (MQ=255) cttggtgcaccAATGCGCGCTTTTAC‑CGCGCTCAGCCGGGTAGGGGCTTCAGCAATCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATTTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGAt < 2:1728173/219‑1 (MQ=255) tggttcaccAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTa < 1:1763911/236‑1 (MQ=255) gttcaccAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGc > 1:2220776/6‑204 (MQ=255) tcaccAATGGGAGCTTTTCA‑CTCGCACAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCGTGTCG‑ATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGggcggc < 2:1374347/285‑1 (MQ=255) ccAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCg < 1:1598751/175‑1 (MQ=255) ccAATGCGCGCTTTTAA‑ATCGCCCAACCGGGTCGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGACATCGACAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCGTCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTAAGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTTGCGTCATCTTTGTCTGGACGATGGTGCGTGTGTATAACCGCATTTATCCCGTTCCGACCTGATACAGCATCTGTACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGACTTTCATGGGCGGCCCg > 2:747643/1‑288 (MQ=255) cAATGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTACACCGTGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTACCGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGTCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGtt < 2:2018112/289‑1 (MQ=255) caTGCGCTGTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTa < 2:1534993/288‑1 (MQ=255) tGCGCGCTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACt < 1:1023386/289‑1 (MQ=255) cgcgcTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTTGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTa > 1:1719574/1‑285 (MQ=255) cgcgcTTTTAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTgg > 1:1950401/1‑289 (MQ=255) ttttAA‑CTCGCTCAACCGGGTAGGGGCTTCAGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTTCGATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGTCACCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTGGGTTa > 1:580530/1‑288 (MQ=255) ||| AATAGCCGCCCGACCGGGGATACCACTGGCTATCTGGCAAACCCGAAGGAGGTGTGAGATGGGAAGTGGATGGCATGAATGGCCGCTGATGATCTTCACGGTCTTCGGGCAATGTGTAGCAGGTGGTTTTATCGTTCTGGCTTTGGCGCTGCTCAAAGGCGACCTGCGAGCAGAAGCCCAGCAGCGTGTTATCGCCTGCATGTTTGGTTTATGGGTGCTGATGGGCATTGGCTTTATCGCCTCTATGCTCCATCTTGGTAGTCCAATGCGCGCTTTTAA‑CAGCCTCAACCGGGTAGGGGCTAGTGCACTCAGTAACGAAATCGCCAGCG‑GTAGCATCTTTTTTGCCGTAGGCGGCATCGGCTGGTTGCTGGCAATGCTGAAAAAGCTGAGTCCGGCATTGCGTACGCTGTGGCTGATAGTGACGATGGTTCTTGGCGTCATCTTTGTCTGGATGATGGTGCGTGTGTATAACAGCATTGATACCGTTCCGACCTGGTACAGCATCTGGACGCCGATGGGCTTCTTCCTGACGATGTTTATGGGCGGCCCGTTACTGGGTTAC > CP042583/806869‑807430 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |