| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 809,845 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 809,846 | 0 | G | C | 99.6% | 556.8 / NA | 234 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (124/109); minor base A (1/0); total (125/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 809,847 | 0 | C | G | 99.6% | 556.6 / NA | 234 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (125/108); minor base T (0/1); total (125/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
TGCGTGTTCAGGTCTTTGTCGTCATTCTCGGCAGTATCGCGATGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGAGTTTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTAAGCTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATG > CP042583/809567‑810125 ||| tGCGTGTTCAGGTCTTTGTCGTCATTCTCGGCAGTATCGCGATGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATACTTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATc > 2:944105/1‑287 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