Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 811,053 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 811,053 | 0 | A | T | 99.6% | 598.7 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (122/128); minor base C (1/0); total (123/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 811,054 | 0 | G | C | 98.8% | 588.2 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base C (122/127); total (123/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 811,055 | 0 | C | G | 100.0% | 595.6 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (123/129); total (123/129) |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GCAGAGAAGATTTCTCCTTACGTTAATCAAACGCGCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCAGCCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATAGCCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCAGCATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATAGCGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAAC > CP042583/810774‑811332 ||| gCAGAGAAGATTTCTCCTTACGTTAATCAAACGCGCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGAt < 1:115551/288‑1 (MQ=255) agagAAGATTTCTCCTTACGTTAATCAAACGCGCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGc < 1:1661551/288‑1 (MQ=255) gaagaTTTCTCCTTACGTTAATCAAACGCGCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGc < 2:373232/285‑1 (MQ=255) ttCTCCTTACGTTAATCAAACGCGCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGTCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTaaa > 1:1010114/1‑289 (MQ=255) tcCTTACGTTAATCAAACGCGCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTg < 2:959823/289‑1 (MQ=255) tAATCAAACGCGCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAgg < 1:1930318/288‑1 (MQ=255) aaCGCGCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCt < 1:1454711/289‑1 (MQ=255) aCGCGCAACCCAGGAAAATAATTTCCCAAAGGGATTTTATGCCTGTCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTg < 2:642419/289‑1 (MQ=255) cgcgCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAAGACCCTGGGGCAAGTAGCGGCGCTGGTATCCTCGATTCATGCCCCGCTTAAAGTGCTATGAGCGGATTCTg > 2:213897/1‑288 (MQ=255) gcAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTCTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACa < 2:728207/288‑1 (MQ=255) cAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGTGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTaaa < 2:977945/265‑1 (MQ=255) cAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAg < 1:2040605/288‑1 (MQ=255) aTTTCCAAGAGGGATGTTATGCCTGGCGTTGATGGTTGGGGTTTGTGCCAGTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGCATGATGTTTGACTGGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACAAACAGTAAGTATTAAGCCTTTCAGACGCTTGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTCTAATGGTGATTTACGCCACTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATTCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTccag < 2:1014522/287‑1 (MQ=255) aTTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTccag < 1:980880/287‑1 (MQ=255) tCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTTCTATTAGGTGATGCTGACCGCAAATATATTCCCGCCAGt > 2:2190990/1‑289 (MQ=255) aaaaGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTa < 2:1581228/289‑1 (MQ=255) aaGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATg < 1:1847506/289‑1 (MQ=255) aTGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGt > 1:156773/1‑288 (MQ=255) ttggcttGGGGGTGATGCTTGCGGTTTGGGCCGTTCTGGGCTCTCTTGCAATGGGTATGATGTTTGATTCGCGTCATATCCCGGATAACTTAATGACCAACGATCAGTATTTAGCCGTTCAGAAGCTGGCCTAGTATTACAACATGGGTTATACTTTAATGGAGAGTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATGCTGGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGAAGCTGACCGCAAATATATGCCAACCAATTTATGG‑AGTACGaa < 2:658115/283‑1 (MQ=255) tATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCaa < 1:879740/289‑1 (MQ=255) cGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTccagc > 2:339809/1‑262 (MQ=255) tGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCCATTAGGTGATGCTGAGAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGtt > 1:2233721/1‑289 (MQ=255) tttGTGCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATg > 1:1884152/1‑288 (MQ=255) ttGTGCCATTCTGGGGTCGGTGGCGATGGGGATGATGTTTGCTTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGc < 2:1212781/289‑1 (MQ=255) tgtgCCATTCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCt < 2:24995/289‑1 (MQ=255) ttCTGGGCTCGCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCt < 1:1968719/289‑1 (MQ=255) ggctcgcTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTccag > 2:1906548/7‑232 (MQ=255) gcTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCaa > 2:583962/2‑246 (MQ=255) gcTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCaa < 1:583962/245‑1 (MQ=255) gcTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGt > 2:1926136/2‑288 (MQ=255) gcTGGCGATGGGGATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGt > 1:1977581/2‑288 (MQ=255) gggATGATGTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGa > 2:1041175/1‑289 (MQ=255) tgatgTTTGATTCGCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGAt > 2:1871860/1‑286 (MQ=255) ttgattcgcGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTAt < 1:1337441/281‑1 (MQ=255) tgattcgcGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTAtg < 2:27371/282‑1 (MQ=255) cgcctAATATCCCGTATGACTTAATTACCAACTGTCATTATTACGCCTTTCAGAAGCATGGCGAGTATTTCAACATGTGTAATACTTTAATGTTGATTTACTCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCTTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTTGCGATTCTGATTATGCTGcc < 1:352014/285‑1 (MQ=255) cGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCg > 1:1269804/1‑288 (MQ=255) atatCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGActct < 1:1041175/289‑1 (MQ=255) ccGGATGACTTAATGACCAACGGTAAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCa < 2:1816436/289‑1 (MQ=255) cGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGTCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTAGTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACGGGTTGCGATTCTGTTTATGCTGCCGACTCCCGCCag > 2:496611/1‑288 (MQ=255) aTGACTTATTGACTAACGGTAAGTATTACGACTTGCAGAAGCCTGGCGAGTATGACAACCTGGGTCATACTTGAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTAGTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTg < 2:1171202/288‑1 (MQ=255) aTGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTg < 1:1528291/288‑1 (MQ=255) cTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGat > 1:1117772/1‑289 (MQ=255) tGACCAACGGTCAGTATTACGCCGTTAAGAAGCTGAGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTTCGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGaa < 2:455218/289‑1 (MQ=255) cAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGAGATATGAACAAt < 1:586381/289‑1 (MQ=255) aTTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCAAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGGGATATGAACAATCTCTATAAAt < 1:1023263/288‑1 (MQ=255) ttCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCt < 2:13498/134‑1 (MQ=255) ttCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACCGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTa > 1:1731154/1‑215 (MQ=255) ttCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTa < 2:1731154/215‑1 (MQ=255) ttCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATTTCTCTAAATGGATGTTGa > 2:1607014/1‑288 (MQ=255) ttCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCtata > 2:2000308/1‑276 (MQ=255) ttCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGa > 2:1276266/1‑288 (MQ=255) cgaaacggggCGGTTAGTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTTATTTACGCCATTGCGAATCCCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCACGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCt < 2:1269804/282‑1 (MQ=255) gggCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGAt < 1:82582/216‑1 (MQ=255) gggCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGAt > 2:82582/1‑216 (MQ=255) gggCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGAct > 1:52770/1‑235 (MQ=255) gggCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGAct < 2:52770/235‑1 (MQ=255) gggCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCt < 1:922228/282‑1 (MQ=255) ggCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGTCCGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTg > 1:1379543/1‑245 (MQ=255) ggCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATTGCTGTTGAACCTTAAttcgg > 2:2084077/1‑285 (MQ=255) cGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAAttcggta > 2:696071/1‑283 (MQ=255) aGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAAttcggtag < 2:1976692/288‑8 (MQ=255) acaTGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCt < 2:469933/289‑1 (MQ=255) caTGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGTTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCt > 2:292973/1‑288 (MQ=255) tGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGTATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGGTTAAAGTGTTCTTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTTCAGCCAGTTTATGT‑CGTATCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGAGTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGATGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCg > 1:1483888/1‑289 (MQ=255) tGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCa > 2:1064637/1‑225 (MQ=255) tGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCg > 1:2173092/1‑289 (MQ=255) tGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCg < 1:2128624/289‑1 (MQ=255) tGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCg > 1:970345/1‑289 (MQ=255) tGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCg < 1:1803240/289‑1 (MQ=255) agggaaTACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCTTTGGAAAAGTAGCGGAGCTGGTATTCTCGATAGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCACGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCg < 2:1713634/284‑1 (MQ=255) ggTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTg > 1:1921404/1‑226 (MQ=255) ggTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGtt > 1:2102302/1‑289 (MQ=255) ggTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGtt > 1:1328153/1‑289 (MQ=255) gTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATg > 2:1551515/1‑165 (MQ=255) gTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGtta > 1:1384247/1‑289 (MQ=255) aCTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGttatttat > 1:751386/1‑289 (MQ=255) tAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCCCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCAGCTGCGTTATTTAGGGGt > 2:576184/1‑289 (MQ=255) tGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCTCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCt > 2:2020082/1‑163 (MQ=255) tGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGttattta < 1:2018004/278‑1 (MQ=255) aTTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGGGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATttgttg > 2:521057/1‑289 (MQ=255) aTTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATttgttg > 2:1382283/1‑289 (MQ=255) aCGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCAtt > 2:1484070/1‑289 (MQ=255) ttGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCg < 1:1060271/259‑1 (MQ=255) tGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCa < 2:1109402/280‑1 (MQ=255) tGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCa > 1:1109402/1‑280 (MQ=255) tGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCa > 1:424312/1‑289 (MQ=255) cTGGGACAAGTAGCGGGGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCt < 2:1055413/289‑1 (MQ=255) cTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGATACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCt < 1:122619/289‑1 (MQ=255) tGGGACAAGTATCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTg < 2:179630/218‑1 (MQ=255) gACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGGGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTgg < 1:521057/288‑1 (MQ=255) aGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTTAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCGGCGTTATTTATGGGTATTTGTTTCATTTATTGCAGTCGtttggtttgcccaa > 2:927848/1‑277 (MQ=255) aGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCt > 2:86144/1‑216 (MQ=255) aGTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAg < 2:1697483/289‑1 (MQ=255) gTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGa < 1:1167125/130‑1 (MQ=255) gTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACa < 1:281169/190‑1 (MQ=255) gTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCa > 1:1671215/1‑270 (MQ=255) gTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCa < 2:1671215/270‑1 (MQ=255) gTAGCGGCGCTGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGa > 1:1706993/1‑289 (MQ=255) tGGTATTCTCGATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATTCGGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAAc < 1:469638/288‑1 (MQ=255) ||| GCAGAGAAGATTTCTCCTTACGTTAATCAAACGCGCAACCCAGGAAAAGAATTTCCAAAAGGGATGTTATGCCTGGCGGTGATGGTTGCGGTTTGTGCCATTCTGGGCAGCCTGGCGATGGGGATGATGTTTGATAGCCGTAATATCCCGGATGACTTAATGACCAACGGTCAGTATTACGCCTTTCAGAAGCTGGGCGAGTATTACAACATGGGTAATACTTTAATGGTGATTTACGCCATTGCGAATACCCTGGGACAAGTAGCGGCGCTGGTATTCAGCATTGATGCCCCGCTTAAAGTGCTATTAGGTGATGCTGACAGCAAATATATTCCAGCCAGTTTATGT‑CGTACCAACGCTTCTGGTACGCCCGTTAATGGCTATTTTCTGACCCTGGTACTGGTGGCGATTCTGATTATGCTGCCGACTCTCGGCATTGGTGATATGAACAATCTCTATAAATGGCTGTTGAACCTTAATAGCGTAGTGATGCCGCTGCGTTATTTATGGGTATTTGTTGCATTTATTGCAGTCGTTCGCTTGGCGCAGAAATATAAAC > CP042583/810774‑811332 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |