| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 820,649 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 820,649 | 0 | A | T | 99.6% | 540.1 / NA | 229 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (130/98); total (131/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 820,650 | 0 | G | C | 99.6% | 539.5 / NA | 229 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (130/98); total (131/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 820,651 | 0 | C | G | 99.6% | 541.4 / ‑4.4 | 229 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (130/98); minor base . (1/0); total (131/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
TAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGAGCGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGT > CP042583/820372‑820927 ||| taatagTCCGGGAGATTCTTTTGTGGGATGCAAGCCAAATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGaa < 2:673732/289‑1 (MQ=255)taatacTCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGaa < 1:416317/289‑1 (MQ=255) ataatCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGt > 1:1012783/1‑289 (MQ=255) cGAGAGATTCTTTTGTTTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACTGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCa < 1:9663/289‑1 (MQ=255) ttCTTTTGTGTGATGCAAGCCACA‑TTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCa < 1:1742138/289‑1 (MQ=255) tCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGCGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGCACGGTCTTGGTAGTGAG‑GGGATGGAAGGGAGTCACCGTGGCa > 2:1206686/1‑289 (MQ=255) gtgATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGttc > 1:26810/1‑289 (MQ=255) tGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTTAGTCACCGTGGCAAAGAGttcattc > 1:1960615/1‑289 (MQ=255) tGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTCCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTCAACAGGCGCAACAGGAACGGCGCGACTGGAACGGTCTCGGTA‑CGTCGGTGATGGTAGTGAGTGACCGTGGAAAAGAGtccactc > 1:2035036/1‑289 (MQ=255) gaaggtcacaTTTTTGCCCTCAACGTGTTTTCTAATTGCGGTGTGGGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGGATGACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGttcattc < 2:5062/282‑1 (MQ=255) gCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGttcattca < 2:1137708/289‑1 (MQ=255) aGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGt < 1:2188147/289‑1 (MQ=255) ttttGGCCTCAACGGTTTTACTCATTTCGATGTGGTTTACTGAATGAAAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTGGAAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAgg < 2:1556720/289‑1 (MQ=255) aaCGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGATTCACCGTGGCAAAGAGttcattca > 1:1967167/1‑268 (MQ=255) tACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTc > 1:113456/1‑289 (MQ=255) cTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTcgc > 1:818143/1‑289 (MQ=255) cATTTCGATGTGTTGCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGAAATAGTGTATGACCTGTGGTCGAAATCGATTGACAGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTTTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCTAGAAGGATTTTCGCGa < 2:1993932/289‑1 (MQ=255) ttcGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTCTTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGGGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAGGTGAGTCATCGTGGCAAAGAGTTCATTAAGATTGCAGACGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGAtct > 1:1327655/3‑289 (MQ=255) tgtCACTGAATGTTAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGACATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGt < 1:915826/289‑1 (MQ=255) tgtCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATg < 2:1012783/288‑1 (MQ=255) gAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTcc < 2:1324106/289‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCa > 2:562836/1‑289 (MQ=255) aaTGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCa > 1:1833248/1‑289 (MQ=255) gATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGGCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGGGAGTAACCGTGGAAAAGGGTTCATTCGGTTTGCGTGGGCAGCCGATAAGGGTTTTCGCGATCCTCTCAAGGTtcctccacacc > 2:1551779/1‑281 (MQ=255) tAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTa < 2:1171982/288‑1 (MQ=255) aaaaCCTATAGTCAAAGAAATAATGGATTACCTGTGGTCACATGCGATTGACCGCGGGTTAAGAGAAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAATTCTGGTCCGGAAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACa < 2:1961381/289‑1 (MQ=255) ccGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGt > 1:760987/1‑289 (MQ=255) gAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACaacgaa < 1:1662936/277‑5 (MQ=255) aataatGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGcc < 1:1206686/286‑1 (MQ=255) ttACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATg > 2:268633/1‑247 (MQ=255) ccTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCCTGGCGGTGGTcgcg > 2:968232/1‑289 (MQ=255) gtgGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGttcattca > 1:585066/1‑197 (MQ=255) gtgGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTc > 2:1079884/1‑289 (MQ=255) gtgGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTc > 1:1710265/1‑289 (MQ=255) ggggTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTc > 1:1504338/3‑289 (MQ=255) ggTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTcgcg > 2:670598/1‑227 (MQ=255) ggTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTcgcg < 1:670598/227‑1 (MQ=255) ggTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACCAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTCGTCGCCGTccg > 2:1653723/1‑287 (MQ=255) ggTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGCGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTAACAGTGATTATTCTGCCCTGGCGGTGGTCGCGGTCAg > 2:1673899/1‑289 (MQ=255) ggTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACATGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAg > 1:1177539/1‑289 (MQ=255) cGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGtt < 2:1803686/288‑1 (MQ=255) aaaTCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAg < 2:2023846/161‑1 (MQ=255) gATTGACCGCGGGTTAATATCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCgg < 1:2139725/289‑1 (MQ=255) aTTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGt > 2:1871791/1‑289 (MQ=255) aTTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGt > 1:363094/1‑289 (MQ=255) gTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAata > 1:72889/1‑289 (MQ=255) aTAGCAACGAAACGTGGTGAGGGGAAAGTGCTCAAATCTTCAATTTGAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAACCAGGCTCAACAGGAGCTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATtct < 2:1839260/289‑1 (MQ=255) aGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCg < 2:442914/289‑1 (MQ=255) aacgcagcgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTg > 2:92111/1‑289 (MQ=255) aacgcaacgTTGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGt < 1:157139/288‑1 (MQ=255) aacgcaacgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGt < 1:1079884/288‑1 (MQ=255) acgcaacgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACa > 1:981512/1‑222 (MQ=255) acgcaacgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGa > 1:1820646/1‑289 (MQ=255) acgcaacgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGa > 1:1313096/1‑289 (MQ=255) acgcaacgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGa > 2:2161073/1‑289 (MQ=255) acgcaacgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGa > 1:1759685/1‑289 (MQ=255) caacgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATaa > 1:29510/1‑289 (MQ=255) acgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATaaaa < 1:1784740/289‑1 (MQ=255) acgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATaaa > 1:2098660/1‑288 (MQ=255) cgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGTAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATaaaa > 2:425550/1‑288 (MQ=255) cgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTAGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATaaaa > 2:1967800/1‑288 (MQ=255) cgTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGCTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTTGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCCATGAATATTCCCGGTGATacaa > 2:2235484/1‑288 (MQ=255) tgAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAaccacc < 1:1995640/288‑1 (MQ=255) gAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATGTTGGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGGACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCg < 1:491920/288‑1 (MQ=255) caagcTTCAATTTTAGTGCTGGTCCGGAAAAGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGc < 2:297094/285‑1 (MQ=255) aaTCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGcc < 1:2252276/289‑1 (MQ=255) tCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAACACCACCGCAGATTAGGTTGTTGCCGGtt > 2:739654/1‑288 (MQ=255) ggTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGt > 2:77493/1‑288 (MQ=255) gCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATGCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTACTGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCCGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTTAATATTCCCGGTGGTCAACCCCCCGCCGATTCTGTTGATGCCCGTTACTGGGAGGCAAGTGCCACTAaagac > 2:1589267/1‑288 (MQ=255) tACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAaagaag < 1:312414/288‑1 (MQ=255) agagGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATtctc < 1:1631232/217‑1 (MQ=255) agagGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATtctc > 2:1631232/1‑217 (MQ=255) agagGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGaaaaaa > 1:1238619/1‑289 (MQ=255) agagGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGaaaaaa > 1:1917449/1‑289 (MQ=255) agGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCTCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTAcc > 2:11195/1‑202 (MQ=255) tGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACa > 1:1266883/1‑150 (MQ=255) tGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACa < 2:1266883/150‑1 (MQ=255) gCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTg < 1:1871791/288‑1 (MQ=255) gatagggagaggcAAAAGGAATTGCGGGCCGAGAACGGTTTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGCTTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCa < 2:1723077/277‑1 (MQ=255) tAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCAc > 1:1350512/1‑288 (MQ=255) ggCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAAt > 1:579299/1‑289 (MQ=255) gCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATg > 1:1446774/1‑289 (MQ=255) gCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATg > 1:93886/1‑289 (MQ=255) gCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTAAGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCCAGTGCCATTAAAGAAGCGAAATAATACTGCAAGCGTAATg > 2:37218/1‑289 (MQ=255) cTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCg > 2:317618/1‑188 (MQ=255) cTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATg > 1:460738/1‑288 (MQ=255) aaCAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCtt < 1:525108/289‑1 (MQ=255) gcgcGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGcc > 2:236189/1‑220 (MQ=255) gcgcGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGt > 1:1723077/1‑276 (MQ=255) gcgcGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCaaa > 2:142273/1‑289 (MQ=255) gcgcGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCaaa > 1:1131787/1‑289 (MQ=255) gcgcGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCaaa > 1:1686381/1‑289 (MQ=255) cgcgACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGCCAGATTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTAAGTTGATTCCGGTTACTGCGCGACAAGTGCCATTAAAGAAGGGAAAAAATACTGCACGCACAATTCCTTTGACGCCaacg > 2:1243679/1‑287 (MQ=255) cgACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTg < 1:142273/289‑1 (MQ=255) gACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTg < 2:1759685/288‑1 (MQ=255) gACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTg < 2:1459746/288‑1 (MQ=255) cTGGAACGGTCTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGAc < 1:160749/288‑1 (MQ=255) cTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCg < 2:2051248/187‑1 (MQ=255) cTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATgg > 1:1597416/1‑287 (MQ=255) cTTGGTA‑CGTCGGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGt < 2:1704565/288‑1 (MQ=255) ||| TAATAATCCGAGAGATTCTTTTGTGTGATGCAAGCCACATTTTTGCCCTCAACGGTTTTACTCATTGCGATGTGTGTCACTGAATGATAAAACCGATAGCCACAGGAATAATGTATTACCTGTGGTCGCAATCGATTGACCGCGGGTTAATAGCAACGCAACGTGGTGAGGGGAAATGGCTCAAATCTTCAATTTTAGTTCTGGTCCGGCAATGCTACCGGCAGAGGTGCTTAAACAGGCTCAACAGGAACTGCGCGACTGGAACGGTCTTGGTA‑CGAGCGTGATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGT > CP042583/820372‑820927 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |