Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 836,121 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 836,121 | 0 | G | C | 99.6% | 575.2 / NA | 243 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 836,122 | 0 | C | G | 100.0% | 574.1 / NA | 243 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (121/122); total (121/122) | |||||||||||
* | CP042583 | 836,123 | 0 | T | A | 100.0% | 578.5 / NA | 243 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (121/122); total (121/122) |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
AGCTTCTTCTTCGGTATCTTTTGGCAAATCCAGGGTGATAATTTGCTCGCGCGGCACGCCCAGGCTTTGCGCAACTCTGGCACCTACTTCCGCTGTACTCACCGTATTGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTACTTCCCGGATTTTCGCGCCATAAGCGAATACCTTCATTCAGGCGTGGCAGACTGTTATTGATTAAATTAGAGCTCGGTGCCCACTGCGGGTTCCAGGTATAACCACCTCCGAGCACCACGATATAGTCCACTTTTTGGCTATTATTCCATGTCGGATAGGTGCTTTCGATGGGACGCAGCAGGCGGTCGGCTACCGGTTGCAAACTCAATAACAAGAGCGCCAGCCACCCAATGCTAATAAAAATCTTCCCGGTTTTTTGAAAACGGCTAAACCACAGCAGCGCCAGGCCAGCGCCAATAATCAACAACATCAGCGGAAGTGGCAGCAACATATTGCCAATCACTTTTTTCAGTGTAAAAAGCATCCTTTCTGGTTCCTTTTTTAACCATATAGCAAGGGATCGCCAGCGATATTACAC > CP042583/835842‑836402 ||| tgCTTCTTCTTCGGTAGCTTTGGGCAAATCCAGGGTGATAATTTGCTCGCGCGGCACGCACAGCGATTGCGCAACTCTGGCACCTACTTCCGCTGTACTCACCGTATTGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATAAGCGAATACCTTCATTCAGGCGTGGCAGACTGTTATTGATTAAATTAGAGCTCGGTGCCCACTGCGGGTTCCAGGTATAACCACCTCCGAGCACCACGATATAGTCCACTTTTTGCGAattatt < 2:2215539/287‑1 (MQ=255) cttcttcGGTATCTTTTGGCAAATCCAGGGTGATAATTTGCTCGCGCGGCACGCCCAGCGATTGCGCAACTCTGGCACCTACTTCCGCTGTACTCACCGTATTGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATAAGCGAATACCTTCATTCAGGCGTGGCAGACTGTTATTGATTAAATTAGAGCTCGGTGCCCACTGCGGGTTCCAGGTATAACCACCTCCGAGCACCACGATATAGTCCACTTTTTGCGAATTATTCCATGt < 1:1451116/289‑1 (MQ=255) aTCCAGGGTGATAATTTGCTCGCGCGGCACGCCCAGCGATTGCGCAACTCTGGCACCTACTTCCGCTGTACTCACCGTATTGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATAAGCGAATACCTTCATTCAGGCGTGGCAGACTGTTATTGATTAAATTAGAGCTCGGTGCCCACTGCGGGTTCCAGGTATAACCACCTCCGAGCACCACGATATAGTCCACTTTTTGCGAATTATTCCATGTCGGATAGGTGCTTTCGATGGGa < 1:649527/289‑1 (MQ=255) tCCAGGGTGATAATTTGCTCGCGCGGCACGCCCAGCGATTGCGCAACTCTGGCACCTACTTCCGCTGTACTCACCGTATTGGTTTTTGCTACGCCTCCCGTGAAGATCAGTTTTGATCCCGGATTTTCGCGCCATAAGCGAATACCTTCATTCAGGCGTGGCAGACTGTTATTGATTAAATTAGAGCTCGGTGCCCACTGCGGGTTCCAGGTATAACCACCTCCGAGCACCACGATATAGTCCACTTTTTGCGAATTATTCCATGTCGGATAGGTTCTTTCGATGGGa > 2:2073280/1‑288 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |