Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 894,380 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 894,381 | 0 | C | G | 99.6% | 576.9 / NA | 242 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (112/129); total (112/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 894,382 | 0 | T | A | 99.6% | 580.6 / NA | 242 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (111/130); minor base C (1/0); total (112/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.63e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
TTCCGGCAGACAGATAGGTGTTCAGAATAGGTCCGAGGATATAACCCAGAAAACCGGTAAAGGCGAATGCGGAGATAATCCCGGTCGGCTTATTCGCCGTTTTATAGGTCAGGAACATCAAACCATACATACCCACCAGCGTCAGAATCAGACCCGGAGATGGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCGCTAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATAGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGACTTGTACGGTCATGACTAGAACTAACAATACGATCCATTGAGTCACTCTCTATGACAGATGTAATTAATTAAGCAGCATAATGATAATGCGTAAGGGCACCCAGAAGTTTTACCCATCTTTACGCATTTGATCTGGAACAGGTTTAACAGCGGATTATCAGGTCATTAAGCAAATATAACGCCCTGAGAATTTCGACAGGCAAAAGAAAAAGGGGTTAGCATTTAGCTAACCCCTTATCTTATTTGGCGGAAGCGCAGAGATTCGAACTCTGGAACCCTTTCGGGTCGCCGGT > CP042583/894100‑894658 ||| taccGGGAGACAGAGAGATGTTCAGAGAAGGTCCGAGGGAAAAACCAAGAAACCCGGGAAAGGCGAATGCTGAGATAATCCCGGTCGGCTTATTCGCCGTTTTATAGGTCAGGAACATCAAACCATACATACCCACCAGCGTCAGAATCAGACCCGGAGATGGCAGCATCAGCACCGTACTGGCAGTTGCGGTAATCGCCGAAAAGGCCAGCGTCAGGCTCAGCAGAAAATGGGTATTACGCAGCACCTTATGGGTGCTAAGCAGTGATGTACGGTCATGTGAAGAACt < 2:1695699/287‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |