Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 901,026 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 901,026 | 0 | A | T | 100.0% | 687.2 / NA | 287 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (146/141); total (146/141) | |||||||||||
* | CP042583 | 901,027 | 0 | G | C | 99.7% | 673.2 / NA | 287 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (146/139); total (146/141) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 901,028 | 0 | T | A | 99.7% | 679.2 / NA | 287 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (145/140); total (146/141) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
TCGGGTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTAAGCCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGAGTTTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGACGTGGCTGGTGGCGTTCGGTAGTAATCTCTCTGCGTTGTGGATATTGAATGCCAACGGTTGGATGCAATACCCGACCGGTGCGCATTTTGATATCGACACCCTGCGTATGGAGATGACCAGCTTCAGCGAGCT > CP042583/900746‑901303 ||| tCGGGTTCTTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCCGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTAt < 2:1760053/289‑1 (MQ=255) tCGGGTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTAt > 1:1557468/1‑289 (MQ=255) cGGGTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTAtt < 1:1839734/289‑1 (MQ=255) ttATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCaa > 2:735810/1‑289 (MQ=255) ttCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGGGGGCGat > 2:697917/1‑289 (MQ=255) aGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGgcg < 1:1286589/287‑1 (MQ=255) gTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTcc < 1:1925796/261‑1 (MQ=255) tGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTTTTTGTACCCCTTACCATGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTACGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACTGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACTATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCATCTATGTGGGCGATATTTTTGGCGAAcc > 1:1785076/1‑289 (MQ=255) tGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCAc > 2:1395785/1‑288 (MQ=255) gcgcATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGCAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCCCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCAcc > 2:240425/1‑288 (MQ=255) 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cgcATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCAcc > 1:2235400/1‑287 (MQ=255) cgcATGTGGGATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCACTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAACACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCTGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCATCTATGTGGGCGATATTTTTGGCTCAcc > 2:1431709/1‑287 (MQ=255) gATGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATg < 1:240425/288‑1 (MQ=255) aTGTCATTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATgg < 2:9793/288‑1 (MQ=255) aTTGATTTATCGCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCa > 2:520574/1‑270 (MQ=255) atcgcGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCt > 1:665972/5‑267 (MQ=255) atcgagCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATgg > 1:784777/6‑287 (MQ=255) cTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGc > 1:771057/1‑264 (MQ=255) cTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGc < 2:771057/264‑1 (MQ=255) ttgttgttttgtctGACCACTCTGTATTTCTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATCTTTGTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACATTGTCACCGTCAAAACAATCTACCGCGATATGTCGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTATCTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTcc < 2:720677/278‑1 (MQ=255) tggacgTTTGCTCTGACCGCTCTGTATCACTTTTTATTTGTCCCCCTTACCCTGGGTCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATTGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTcc < 2:784777/284‑1 (MQ=255) ccGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGt < 1:735810/289‑1 (MQ=255) tATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGTAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCgg < 2:1826574/289‑1 (MQ=255) tATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCg > 1:433195/1‑288 (MQ=255) tATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCg > 2:504107/1‑288 (MQ=255) tATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGAGGGAAGCATTAAGGTCCTTCTTCCCCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTATTCTTggg > 2:810542/1‑289 (MQ=255) tACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTaa > 2:1647403/1‑237 (MQ=255) cccTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGaa < 2:304346/289‑1 (MQ=255) 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gggCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGaataaat > 1:1151862/1‑289 (MQ=255) ggCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGTCTGGCAACGGCTGaataaat > 1:2170276/1‑288 (MQ=255) gCTGATTTTGTTGCTGGCTATTATGGACACCGTTTACGTGGTCACCGGCAAAACTATCTACCGCGATATGACGAGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGTTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGaataaata < 2:1153387/288‑1 (MQ=255) 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aTTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACgg < 1:2202390/273‑1 (MQ=255) ctttattGGAAACCATTTCCGTGTTCACCGGCAAAACATTCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGAc < 2:169769/283‑1 (MQ=255) tattatGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGAc < 1:929434/288‑1 (MQ=255) 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gTACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGACGTGGCTGGTGGCGTTCGGTTCAAATCTCTCTGCGTTGTGGATATTGAATGCCAACGGTTGGATGCAATACCCGACCGGTGCGCATTTTGATATCGACACCCTGCGTATGGAGATGACCAGCTTCAGCGa > 1:1726670/1‑286 (MQ=255) tACTAACTGGTCATTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGACGTGGCTGGTGGCGTTCGGTTCAAATCTCTCTGCGTTGTGGATATTGAATGCCAACGGTTGGATGCAATACCCGACCGGTGCGCATTTTGATATCGACACCCTGCGTATGGAGATGACCAGCTTCAGCGAGCt < 1:408155/288‑1 (MQ=255) ||| TCGGGTTATTTTTCTCTCTTCGCCTACAGGAGTGCGCATGTGGGATGTCATTGATTTAAGCCGCTGGCAGTTTGCTCTGACCGCGCTGTATCACTTTTTATTTGTACCCCTTACCCTGGGGCTGATTTTTTTGCTGGCTATTATGGAAACCATTTACGTGGTCACCGGCAAAACAATCTACCGCGATATGACGCGCTTCTGGGGTAAGCTCTTCGGTATCAATTTTGCTCTTGGCGTGGCTACCGGCCTGACCATGGAGTTTCAGTTTGGTACTAACTGGAGTTTCTATTCCAACTATGTGGGCGATATTTTTGGCGCACCGCTGGCGATGGAAGCATTAATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTCGGGCTGTTCTTCTTCGGCTGGCAACGGCTGAATAAATACCAGCACCTGCTGGTGACGTGGCTGGTGGCGTTCGGTAGTAATCTCTCTGCGTTGTGGATATTGAATGCCAACGGTTGGATGCAATACCCGACCGGTGCGCATTTTGATATCGACACCCTGCGTATGGAGATGACCAGCTTCAGCGAGCT > CP042583/900746‑901303 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |