| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 906,389 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 906,390 | 0 | G | C | 99.6% | 615.2 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (113/145); total (113/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 906,391 | 0 | T | A | 100.0% | 627.6 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (113/146); total (113/146) | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
ATTCCGCACGCTGAACGAAAATCAGAAAGTTGAATTTTCTATTGAGCAGGGGCAACGTGGCCCCGCGGCAGCGAACGTTGTTACGCTCTAAGGTTGCCATTATTACTCAACATCTCCATTTCCGCTGTCCATGTTGTCATGGTTCACAGTACCGCACATCGGCATTCGATGTGACGGAGCGAAACCCTTTGGGCGCTAAGTGTATTTTTTGTAAATCGACGATGATCACCTTTGATAACGTCGCGCTGCAAATACGCACTGACCATGCGCCGCTGGATTAGTCAAAATAATATCAGGCTCCCTCGTGGAGCCTTTTTTATATCTGCCTTATTTTTCTTCAACGCTGTATGTATAGTAAGCGATAACCTGTTGATTATTGAATCTTTCGGGGAGATGGCTTATAACATTTCTTACCTGACCAGGGTACCGGGAACCAACACCTTACTGGCGTGTTGCTGTCTTTTAAGACCAGAAGAGGTTAACAGTGAATATTGAAGAGTTAAAAAAACAAGCCGAAACGGAAATCGCCGACTTTATCGCGCAAAAAATCGCCGAGCTGAA > CP042583/906110‑906670 ||| cGCACGCTGAACGAAAATCAGAAAGTTGAATTTTCTATTGAGCAGGGGCAACGTGGCCCCGCGGCAGCGAACGTTGTTACGCTCTAAGGTTGCCATTATTACTCAACATCTCCATTTCCGCTGTCCATGTTGTCATGGTTCACAGTACCGCACATCGGCATTCGATGTGACGGAGCGAAACCCTTTGGGCGCTAAGTGTATTTTTTGTAAATCGACGATGATCACCTTTGATAACGTCGCGCTGCAAATACGCACTGACCATGCGCCGCTGGATTTCACAAAATAatat < 2:198084/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |