| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 912,684 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 912,685 | 0 | G | C | 100.0% | 845.6 / NA | 357 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (178/179); total (178/179) | |||||||||||
| * | CP042583 | 912,686 | 0 | C | G | 99.4% | 849.0 / NA | 357 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (177/178); minor base T (1/1); total (178/179) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
CTCGCCGTAACGGAAACGGTATACCCCTCCTGAGTGAAGTAGGATTGTAATCGCGCCTGGGTAACCGGCTCATCTTCAACAATAACAATGTGATGTGGCATCAGAGGGTTTTACTCATTCTGTTCATATCTGTTCATATTCTGCCGTAAGCCGTTCATCCTGACCAGTGCCGCTGTTCATATTTGCTCATTAAGATCGCTTCACTAAACCATAATTCTACAGGGGTTATTATGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGAGCGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGCATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAACCGGTGTATGAAGAATATAAACAGAGCGTGCATTTCCAGAACGCCTCCGGCGTGCGAGCTGAATGCCATGACTGTCATATCCCGCCGGATATTCCAGGCATGGTGAAGCGCAAACTGGAAGCGAGCAATGATATCTACCAGACCTTTATTGCTCAC > CP042583/912409‑912959 ||| cTCGCCGTAACGGAAACGGTATACCCCTCCTGAGTGAAGTAGGATTGTAATCGCGCCTGGGTAACCGGCTCATCTTCAACAATAACAATGTGATGTGGCATCAGAGGGTTTTACTCATTCTGTTCATATCTGTTCATATTCTGCCGTAAGCCGTTCATCCTGACCAGTGCCGCTGTTCATATTTGCTCATTAAGATCGCTTCACTAAACCATAATTCTACAGGGGTTATTATGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGgc > 2:1122584/1‑286 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |