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Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (171/157); minor base A (1/0); total (172/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 919,297 | 0 | T | A | 99.4% | 784.6 / NA | 329 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (171/156); total (172/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.55e-01 |
Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
TAAAGGTTATTATTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATTGTCTGTTAAGAGCTATACTGGTTTTAAAACAACATGATTATAGTTGGGCGCTGGTCAGTTATAAGATGCAAAAGGAAGTTTACAACGAATTCATTAAAATGGTTGATAAAAAAACGATCGAGGCTCTTGTTGATACGGCATTCTATAATCTCAGGGAAGATGTAAAGACGTTATTTGGCGTTGATCTACAATCTGACAACCAAATTCAGGGGCAGAGTAGTCTTATGAGTTGGAGCTTTCTGTTTTTTAAAAAACAATTCATTGATAGTTGCTTGAATAACGAAAAATGTATCCTGCATTTACCCGAGTTTATA > CP042583/919015‑919567 ||| ttattaTTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATTGTCTGTTAAGAGCTATACTGGTTTTAAAACAACATGATTATTCATGGgcg < 2:1570120/283‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |