Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,036,904 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,036,904 | 0 | A | T | 99.2% | 618.0 / ‑1.4 | 260 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (136/121); minor base . (1/1); total (138/122) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,036,905 | 0 | G | C | 98.8% | 606.1 / ‑2.4 | 260 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base C (136/120); minor base T (2/1); total (138/122) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,036,906 | 0 | C | G | 98.9% | 603.1 / NA | 260 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base G (136/121); total (138/122) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TGTTCAGTGTGGCTTTCCTAGTCCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACAGCCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTAAGCAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTT > CP042583/1036624‑1037185 ||| gTTCAGTGTGGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCAtt > 1:1760384/1‑288 (MQ=255) tCAGTGTGGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTAcc < 2:584458/289‑1 (MQ=255) tCAGTGTGGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTAcc < 1:1435584/289‑1 (MQ=255) tgtgGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTGTTCCCATTAACAGCGCGTACTCGCCCATTACGATCa > 2:2010119/1‑289 (MQ=255) tgtgGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTAcc > 1:947864/1‑285 (MQ=255) tgtgGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCa > 2:1812554/1‑289 (MQ=255) tgtgGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCa > 2:507523/1‑289 (MQ=255) gtgGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTGGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCAt < 1:1743720/286‑1 (MQ=255) gtgGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCag < 1:1002113/289‑1 (MQ=255) gtgGCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCag < 1:1811322/289‑1 (MQ=255) gCTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGGCTACTCGCCCATCACCATCagtag > 2:1436334/1‑289 (MQ=255) cTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACTATCcggagt > 2:1218811/1‑289 (MQ=255) cTTTCCTTCACCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCAGCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCagtag < 1:168867/288‑1 (MQ=255) gcagATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATg > 2:1087685/1‑289 (MQ=255) aTTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCtt > 1:988168/1‑289 (MQ=255) tACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTtg < 2:1689820/289‑1 (MQ=255) aaCAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTGATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGAGGTCTTtggtgtggt > 2:1345943/1‑289 (MQ=255) aCAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTAcc < 2:1495040/250‑1 (MQ=255) gcATCGATCTGAATCCACTTTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACGTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTTGAATTAATGACGTTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGTGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCa < 2:807203/289‑1 (MQ=255) aCTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGa < 2:1392012/252‑1 (MQ=255) aCTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGAt > 1:150507/1‑288 (MQ=255) aCTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGAt > 1:77325/1‑288 (MQ=255) aCTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATg > 2:2119704/1‑289 (MQ=255) cTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCAc > 1:1076135/1‑273 (MQ=255) cTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCAc < 2:1076135/273‑1 (MQ=255) cTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATgc > 1:1206380/1‑289 (MQ=255) gTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTtggtg > 1:555673/1‑260 (MQ=255) gATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGa > 1:877282/1‑289 (MQ=255) gATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATGTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCAAGGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGCGTTTACGGGGAAAAAATTGCAACTACGCGCGACGGTAGAGCTTATTCCCATGAACATCGCTTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGTTGTGGTGATCCACGTCGGTAAGGCGTTGCGCTGa > 2:670181/1‑289 (MQ=255) aTCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGAt > 1:34441/1‑289 (MQ=255) aTCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGTCGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGTTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGc > 1:1956336/1‑288 (MQ=255) aGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCa < 1:2189044/254‑1 (MQ=255) gcgACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCtgtg < 1:261392/288‑1 (MQ=255) gcgACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCtg < 1:2010119/286‑1 (MQ=255) cttacttCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGa < 1:60082/226‑1 (MQ=255) gTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCt < 1:1239042/259‑1 (MQ=255) gTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCt > 2:1239042/1‑259 (MQ=255) aaGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGc < 1:536015/287‑1 (MQ=255) gtggtgATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGc > 2:340152/1‑289 (MQ=255) tCTATGATTGATGGTAGAATTGGTGACGGTGATTTACTGGTTGTCGATTGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGAc < 2:964526/289‑1 (MQ=255) tATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCct > 2:2171385/1‑251 (MQ=255) tgattgatGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCAtt > 1:1395290/1‑170 (MQ=255) tgattgatGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCAtt < 2:1395290/170‑1 (MQ=255) gattgatGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGgtgt > 1:1584551/1‑289 (MQ=255) gattgatGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGgtgt > 1:7200/1‑289 (MQ=255) ttgatGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGtt < 1:1318134/288‑1 (MQ=255) atGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCtg < 1:2127586/246‑1 (MQ=255) atGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCg > 1:847066/1‑288 (MQ=255) ggtggAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGc > 1:329733/1‑287 (MQ=255) ggtggAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGc > 1:1386053/1‑287 (MQ=255) ttAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTa < 1:470036/289‑1 (MQ=255) ttAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCCGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTa < 2:132549/289‑1 (MQ=255) gACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATgggg < 2:360472/289‑1 (MQ=255) aCGGTGGTTTACTGATTGTCGAGAGCGCTGTTACGGCCAGGCGTGGTGATATTGTGATCGCGGCTGTTGACAGCGAGTTTACGGTGAAACAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTGGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATgggg < 2:2113537/288‑1 (MQ=255) cGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGt < 2:775273/288‑1 (MQ=255) ggTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCACGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCATCAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTCTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCTATGCGCTGATTTTTTCCCCCTGTGATGTAAACGCGTTTTCTGCCAGCTATGAGAGTGTTTTTCGCCTGCATTGATGGGGTaa > 2:762076/1‑289 (MQ=255) gTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTCGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGAGTTAAACGGGTTTTATGCCAGCTGTGAGCGGGTGTTTTGCCCTGATTTTTGGGGTaaa > 2:278017/1‑289 (MQ=255) aTTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTtggtg > 1:560472/1‑180 (MQ=255) tCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTa > 2:691186/1‑289 (MQ=255) cGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTAAAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTat < 1:40045/289‑2 (MQ=255) aTTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGa < 1:1260696/289‑1 (MQ=255) ttACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGAc > 1:749998/1‑289 (MQ=255) aCCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACgg > 1:1614442/1‑289 (MQ=255) cGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTACGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGtt < 2:424052/289‑1 (MQ=255) ccagccaTGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAAGGACGGTTGc > 1:2226456/1‑289 (MQ=255) cagccaTGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCa > 1:492051/1‑159 (MQ=255) agccaTGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTa < 2:90141/269‑1 (MQ=255) agccaTGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGt > 1:1019823/1‑289 (MQ=255) agccaTGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATCCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGAc < 2:856874/226‑1 (MQ=255) ccaTGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTAcc > 1:1055609/1‑112 (MQ=255) ggTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCtgtg > 1:1894719/1‑216 (MQ=255) ggTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGtt > 2:1651641/1‑226 (MQ=255) agatTGTCATCGGTTCTGTTGAGGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCATCTACGCCCGTCGGTACAGCTTATGCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGa < 2:416774/287‑1 (MQ=255) tatTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGa < 2:329733/288‑1 (MQ=255) tatTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTACGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGaa > 1:422659/1‑289 (MQ=255) gTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAAc > 2:1889582/1‑287 (MQ=255) gTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGc < 1:86746/289‑1 (MQ=255) aTCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTCTGTGGTAAACAGGTGGCTGTGCTGTCTAATAATGACTGTTGAGTTATTGCCCGAAACGCTgc > 2:1904951/1‑288 (MQ=255) aTCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTTTCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACg > 1:762552/1‑285 (MQ=255) cGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGc < 1:1492857/275‑1 (MQ=255) ctgctgTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCa > 1:2157221/1‑289 (MQ=255) cGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGc < 2:2035505/288‑1 (MQ=255) gAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCg < 1:297097/288‑1 (MQ=255) gTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTtggtgtg < 2:1296947/112‑1 (MQ=255) gTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTtggtgtg > 1:1296947/1‑112 (MQ=255) aaaaaaTTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGt < 2:1942532/135‑1 (MQ=255) tGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCt < 2:557473/264‑1 (MQ=255) cAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGt < 2:1048804/288‑1 (MQ=255) cGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTcaaacaaa > 2:552032/1‑284 (MQ=255) cTTATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtcg > 2:1744296/1‑289 (MQ=255) tATTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtcgtc > 2:1558962/1‑289 (MQ=255) aTTCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtcgtcg < 1:1453427/289‑1 (MQ=255) ttCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCg < 2:1764310/153‑1 (MQ=255) tCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtcgtc > 2:2229726/1‑286 (MQ=255) tCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtcgtc > 1:1783102/1‑286 (MQ=255) tCCCATGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtcgtc > 1:1643788/1‑286 (MQ=255) tGAACAGCGCGTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGc < 1:684585/289‑1 (MQ=255) cgcgTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGGTTTATGGGGTCAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAAGGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGAAAAGGGGCTAGGCGTTAAAATGGGCGATCACTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTTGCTGTGGCGTTGttt > 2:62042/1‑289 (MQ=255) cgcgTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGttt > 1:672554/1‑289 (MQ=255) cgcgTACTCGCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGATGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGGTCCCGGGTTCAAACAAAAAGATCGTTTTCGTCGCTGTGGCGTGGttt > 1:1339635/1‑289 (MQ=255) ||| TGTTCAGTGTGGCTTTCCTAGTCCGGCAGCAGATTACGTTGAACAGCGCATCGATCTGAATCAACTGTTGATCCAGCATCCCAGCGCGACTTACTTCGTCAAAGCAAGTGGTGATTCTATGATTGATGGTGGAATTAGTGACGGTGATTTACTGATTGTCGATAGCGCTATTACCGCCAGCCATGGTGATATTGTCATCGCTGCTGTTGACGGCGAGTTTACGGTGAAAAAATTGCAACTACGCCCGACGGTACAGCTTATTCCCATGAACAGCGCGTACAGCCCCATTACCATCAGTAGTGAAGATACGCTGGATGTCTTTGGTGTGGTGATCCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTAAGCAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTT > CP042583/1036624‑1037185 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |