| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,466,140 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,466,140 | 0 | A | T | 98.5% | 471.3 / NA | 202 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (99/100); minor base G (1/2); total (100/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,466,141 | 0 | G | C | 99.5% | 469.0 / NA | 202 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (99/101); minor base T (0/1); total (100/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,466,142 | 0 | C | G | 99.0% | 470.8 / NA | 202 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (98/102); total (100/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
GTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTAGTGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTAGCCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGAGCCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCAGCCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGAAGTTGCGCTTATGTC > CP042583/1465861‑1466421 ||| gTACCAGAGAAACAACCCGCGGACCTGTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGCACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAATTGTTTATCGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCATACCGATGGTTACGCTGCACCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCTCGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGcc < 1:1369978/289‑1 (MQ=255) tACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGcc > 2:1749029/1‑288 (MQ=255) agaAACAACCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTCACCCCAAGGTTGGGCAGGTGAAGAAGCAGAGCGTGGCCCCCAtgc > 2:2173507/1‑288 (MQ=255) acaacCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGttt > 1:1520066/1‑289 (MQ=255) acaacCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGttt > 1:1421728/1‑289 (MQ=255) acaacCCGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACAGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGttt > 1:1823753/1‑289 (MQ=255) ccGCGGACCTTTCAGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATggg < 2:1966960/289‑1 (MQ=255) ttcagcgcTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtgat < 1:1286909/285‑1 (MQ=255) cgcTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGaa > 1:681175/1‑287 (MQ=255) cgcTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAAc < 2:643943/288‑1 (MQ=255) cgcTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAAc < 2:165923/288‑1 (MQ=255) gcTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGaa < 2:432298/286‑1 (MQ=255) tGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCACGACCTTACCGCCAGGTTGCGATGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCGCCAAGCTGTTTCTGGGGTATTTTGATGAACCTGa > 2:1710797/1‑289 (MQ=255) tGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCa > 1:1713668/1‑258 (MQ=255) cGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAAt > 1:839322/1‑289 (MQ=255) cGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGGATAGATTAAAGTGGTCGATGATGCACCCAAGACCTTAGCGCCAGGTCTCGAAGGTGAAGAAGCCTCCCGTGGCCCCAATGGGTCTATGGGGTATTTTGATGAACCCGAAt > 2:919391/1‑289 (MQ=255) tctttcttTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAAc < 2:1850924/289‑1 (MQ=255) ttatttGCGCGGGAACGACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTAGCCGCATGCGTTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCGTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGc < 2:2129566/286‑1 (MQ=255) ctttGCGGCGGAACCGCAAGACCCACAAAAGTGGGGGGTGAATGCCCGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGccc < 2:660874/289‑1 (MQ=255) ctttGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGccc < 2:1207505/289‑1 (MQ=255) tttGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGGCCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGGTTATGGGGAATTTGGATGAACCTGAATTAACCGCTCg > 1:1104463/1‑289 (MQ=255) ggcggAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGcc < 2:1773893/288‑1 (MQ=255) agcggAAACACATTGCGCAAAAGAGTGGGGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCAACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGGCGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGcc < 2:1286351/287‑1 (MQ=255) ggAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTTGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTgg < 1:240032/289‑1 (MQ=255) acaATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATgaag < 2:681175/289‑1 (MQ=255) ccccAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc < 2:320180/289‑1 (MQ=255) ccccAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc < 1:51919/289‑1 (MQ=255) tGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACa > 1:1645033/1‑288 (MQ=255) gAATGTCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGAt < 1:285356/288‑1 (MQ=255) aaTGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGAtct < 2:1396747/289‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTg < 1:2173507/289‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTg < 1:1246952/289‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCAACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATGTCGATGATCCTTTGGCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTg < 2:1389355/288‑1 (MQ=255) ggaaTTAAGTTTTTAAGTGTTTATGGTTCCACGGAAAGTTGGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTCTGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGAt < 2:1104463/285‑1 (MQ=255) aTTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAg < 2:580786/288‑1 (MQ=255) aaTTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTg < 1:1827373/271‑1 (MQ=255) aaTTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCCGCGATCTCTGCCGTATGGAAGGggcggg > 2:528959/1‑289 (MQ=255) ttaAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGc < 1:2082558/177‑1 (MQ=255) ttaAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCGGGTCTTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCGGGCtata > 2:1340675/1‑289 (MQ=255) tgtTTATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCGCGGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATaaaa > 2:906113/1‑289 (MQ=255) ttATGGTTCCACAGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAAtt > 1:408384/1‑289 (MQ=255) cacaGAAAGTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGc > 1:621377/1‑289 (MQ=255) aagttcgccGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCaaaaa < 1:1096228/281‑1 (MQ=255) aagttcgccGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCaaaaa < 1:528959/281‑1 (MQ=255) agttcgccGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGc > 1:1755004/7‑153 (MQ=255) ccGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAggctgg < 2:224759/254‑1 (MQ=255) ccGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAggctgg > 1:224759/1‑254 (MQ=255) gCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATattatt > 1:1677339/1‑289 (MQ=255) aTCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCCCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGATGCAAAAAAGAAATTATTGTCCGCGGGGGCGa > 2:744163/1‑289 (MQ=255) ctcGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCGGGTATTCCAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGATGCTGGCTATATATAAATTACCGGCCGCAAAAAAGATATTATTGTCCTCTGCGGCGaaa > 2:2017300/1‑289 (MQ=255) tCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCGGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGAGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTag < 1:2077607/288‑1 (MQ=255) tggCTTTATGACCACCGATGGTTACGCTGCGGCAGGTGTGGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCGCGCGTGGCTCCACTGTGTTTATGGGGTATTTTGAGGAACCTGAGTTAACCGCCCGTGCCGTGGATGAGGAAGGCTGGTAAGAAGGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATGAAAATTACCGGACGAAGAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAGATAGTAGCAGCCGTGaa < 2:2065968/287‑1 (MQ=255) cGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCg < 1:777671/158‑1 (MQ=255) cGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCg > 2:777671/1‑158 (MQ=255) acCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGt < 2:1364950/192‑1 (MQ=255) ccGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAAAATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAAGTAtttt > 2:292806/1‑289 (MQ=255) ccGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTAACGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCAGCGAAAATAATAGCAGGCGTGACGTGGAAGATAtttt > 2:726220/1‑289 (MQ=255) gATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACTGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGAAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTAt > 2:237475/1‑289 (MQ=255) tGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAgg > 1:1390265/1‑197 (MQ=255) tGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTg > 2:63835/1‑289 (MQ=255) ttaagaggCCGCGAGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTTCCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCGCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTgca < 2:1520066/281‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGata > 2:1082152/1‑270 (MQ=255) tAGAGAGTAAGGTGGTCTATGACGAACGCAAGGCCTGACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCATCGCGTGGCCCCCATGTGTTTATGGGGTATTGTGATGAACCTTAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACg < 2:1915590/288‑1 (MQ=255) agagATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGAt > 1:270922/1‑289 (MQ=255) agagATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCAGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGAt > 1:294091/1‑289 (MQ=255) aTTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGa < 1:638811/167‑1 (MQ=255) ttAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCtg < 1:573958/289‑1 (MQ=255) tAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTTCAGGGGAAGCTATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATTCCcgt > 2:1045569/1‑289 (MQ=255) tAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACg < 2:346752/281‑1 (MQ=255) tAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCtgt > 2:1825281/1‑289 (MQ=255) tAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGGGGAAGATAATTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCtgt > 2:705376/1‑289 (MQ=255) tAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGAACTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGGTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAGAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAAATCACGATGCCtgt > 1:1915590/1‑289 (MQ=255) aaaGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCtgtg > 1:592024/1‑289 (MQ=255) aGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCATCCGTGAAGTGGAAGTTATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCCCGATGCTtgtgtg > 1:1776384/1‑289 (MQ=255) gTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCa > 1:204277/1‑272 (MQ=255) gTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCa < 2:204277/272‑1 (MQ=255) tCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACg < 1:727255/273‑1 (MQ=255) tCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGAt > 1:877744/1‑275 (MQ=255) acgcaAGACCTTACCTCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTGCCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGAt < 1:2204237/289‑1 (MQ=255) acgcaAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACg > 1:467921/1‑263 (MQ=255) ccTTACCGCGAGGTTGCGAAGGTGAAGTAGCCTCGCGTGGCCGCCATGTGTTTATGGGGTATTTTGAGGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGAAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGttt < 2:1575945/289‑1 (MQ=255) tACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTagcag > 1:1537775/1‑208 (MQ=255) tACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTagcag < 2:1537775/208‑1 (MQ=255) tACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAgg > 2:2227561/1‑289 (MQ=255) aCCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCgcggcggcg > 1:1056399/1‑194 (MQ=255) aGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGCTGCCCGTGTGGTTGCAATGTCCGATGACCGTTTAGGTTAACGa > 2:1597526/1‑289 (MQ=255) aGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGGGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGa > 2:50149/1‑289 (MQ=255) ggTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAg < 1:1462604/166‑1 (MQ=255) ggTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAg > 2:1462604/1‑166 (MQ=255) tggaaaGGTAACGAAGCCTCGCGTGGCCCGTATGTGTTTATGGGGATTTTGGATGAACCGAAATTAACCGCCCGTGCCATGGATGAAAGAGGCTGGTATTACAGCGGCGATACCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGatca < 2:2080274/284‑4 (MQ=255) tGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGatca < 1:326617/288‑4 (MQ=255) tGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGatca < 1:2017300/288‑4 (MQ=255) tGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGatca < 2:621377/288‑4 (MQ=255) tGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGatca < 1:1340675/288‑4 (MQ=255) gCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGatcatg < 2:1645033/289‑6 (MQ=255) aGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGatcatgcgc < 1:692743/288‑9 (MQ=255) gaagaaGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc > 1:871899/1‑84 (MQ=255) gaagaaGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGc < 2:871899/84‑1 (MQ=255) aagaagCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGATCATGCGCTTATGt > 2:514857/1‑289 (MQ=255) agaagCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGATCATGCGCTTATGt < 2:2178647/288‑1 (MQ=255) ||| GTACTAGAGAAACAACCCGCGGACCTTAGTGCGCTGCGTTTCTTTCTTTGCGGCGGAACCACAATCCCCAAAAAAGTGGCGCGTGAATGCCAGCAGCGCGGCATTAAATTATTAAGTGTTTATGGTTCCACAGAAAGTAGCCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGAGCCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCAGCCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGATGAACCTGAATTAACCGCCCGTGCCCTGGATGAAGAAGGCTGGTATTACAGCGGCGATCTCTGCCGTATGGATGAGGCTGGCTATATAAAAATTACCGGACGCAAAAAAGATATTATTGTCCGCGGCGGCGAAAATATTAGCAGCCGTGAAGTGGAAGATATTTTATTGCAGCATCCTAAAATTCACGATGCCTGTGTGGTTGCAATGTCCGATGAACGTTTAGGTGAACGAAGTTGCGCTTATGTC > CP042583/1465861‑1466421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |