| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 487,222 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 487,222 | 0 | A | T | 99.6% | 555.0 / NA | 237 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (139/97); minor base C (1/0); total (140/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 487,223 | 0 | G | C | 99.6% | 546.4 / NA | 237 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (140/95); total (140/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 487,224 | 0 | C | G | 100.0% | 556.8 / NA | 237 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (140/97); total (140/97) | |||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
CCTGACCCATCGTCAGCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGAGTGGAAGCTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCTAATCGACCTCTGGCAACCACTTTTCCATGAC > CP042583/486954‑487497 ||| gcTGACGCATCGTCAGCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACGACGCACCGAGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGATTTGCGCGCTGTATGCCGGACGGCACTGGACTGAACGCTTTTGCTGTGTATTAAGGCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGctacgg > 1:2140507/2‑284 (MQ=255) tGACCCATCGTCAGCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCgggg < 2:1689383/289‑1 (MQ=255) cAGCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGAGCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTGGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGCTCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAag < 2:1637904/289‑1 (MQ=255) cAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGgcaacgaaggg > 1:725333/1‑281 (MQ=255) aaCTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCTACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAagag < 1:47616/287‑1 (MQ=255) gATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGaaaagctaaaa > 1:1076757/1‑286 (MQ=255) gATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGaaaagctaaaa > 1:1751884/1‑286 (MQ=255) gATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGaaaagctaaaa > 2:482258/1‑286 (MQ=255) gATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGGGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGaaaagctaaaa > 1:1923527/1‑286 (MQ=255) accacGCACCGCGCCCACGAACTGCCGCGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCg < 1:1200242/289‑1 (MQ=255) gCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGgggcg > 1:650151/1‑230 (MQ=255) gCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAgg > 1:494169/1‑288 (MQ=255) cgcCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGaa > 1:1257523/1‑280 (MQ=255) gcCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCa < 1:1480752/289‑1 (MQ=255) gcCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCa > 1:368499/1‑289 (MQ=255) ccACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTGGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTTGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCAt < 1:109557/288‑1 (MQ=255) aCTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCt < 2:639921/288‑1 (MQ=255) ccGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGaa < 2:2250655/237‑1 (MQ=255) ccGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGaa > 1:2250655/1‑237 (MQ=255) gtgtAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGCTCGTACTGGTGTCCGCATCGGGGCGGGCAGCGATAGGGCGTGTTACGTGAAAAGCTAAAAGCATGTGAATTTAGCGGCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAggg > 2:1866104/1‑287 (MQ=255) cGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCa < 1:947730/267‑1 (MQ=255) cGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCa > 2:947730/1‑267 (MQ=255) cGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTc > 1:2151052/1‑288 (MQ=255) cGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGGGAGGTTAGCGCCGAGGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTc > 2:2109537/1‑288 (MQ=255) ggATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTcgc < 1:921296/289‑1 (MQ=255) aTTTCAGGCTGTCAGTACAGCGAGCGTTATTGCCCCCGGTGACAGTTATTGGCCCTTTTGTCTATCGTGCCGTTCGCACCGTGGTTGCAGGGCAGAGTGTTGGTGGGCTTTCGGCGCTGTATGCCTGACTGCACTGGTCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGATGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTcgcg < 2:1979359/288‑1 (MQ=255) tCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCgatga > 1:2212444/1‑288 (MQ=255) cGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATc > 1:1402125/1‑289 (MQ=255) cAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCAt > 1:542329/1‑289 (MQ=255) tACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCt < 1:1324267/244‑1 (MQ=255) cgCAAGAGTTATTACCCCTGGTTAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGGTCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGc < 2:2212444/288‑1 (MQ=255) aggacgagTTATTACCCCTGGTGAAAGCGTTTGCCCCTTTTAGCGGTCGGGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGGGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGc < 2:1749611/284‑1 (MQ=255) aaGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGc < 2:650578/286‑1 (MQ=255) gagTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGAGCATGCGGGCCAATc > 1:195800/1‑289 (MQ=255) gTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGTTCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGTGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGGTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAg > 1:1671484/1‑289 (MQ=255) gTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCAt < 2:1500042/240‑1 (MQ=255) gTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCAt > 1:1500042/1‑240 (MQ=255) gTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTGTTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAg > 1:891276/1‑289 (MQ=255) gTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAg > 2:1771229/1‑289 (MQ=255) gTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGAGCGGCTGGCAAGCGGGCGTGTTACGTTACAAGCGACAAGGTGGTGGAGGTAGCGCTGTAGGTCTGCGCATTGTGTCGGTAACGGGTATGCGCGTGTCGATGATGCTGCGGGcacctcat > 2:680701/1‑282 (MQ=255) ccTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCg > 2:1416451/1‑218 (MQ=255) cTGGTTAAAGCATTTGCCCCTTTGGGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGGCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATg < 2:1606233/289‑1 (MQ=255) cTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATg < 2:1276959/289‑1 (MQ=255) tGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCa > 2:1392898/1‑228 (MQ=255) tGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCt > 1:990309/1‑235 (MQ=255) tGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTcg > 2:531326/1‑250 (MQ=255) tGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGc > 1:2094495/1‑255 (MQ=255) tGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGc < 2:2094495/255‑1 (MQ=255) tGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATTCGGGCCAATCAGGCGCTGTATgc > 1:1984947/1‑289 (MQ=255) tGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGACTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTcgc > 2:91091/1‑251 (MQ=255) ggTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGGTGTATgc > 1:2020663/1‑288 (MQ=255) ggTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATgc > 1:1805622/1‑288 (MQ=255) ggTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATAAGGCGCTGTATgc > 1:168825/1‑288 (MQ=255) gggtgaGCTATTGCGCCTTTTGGCGCTCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCGGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTTTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATgcg < 2:1840686/283‑1 (MQ=255) aGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAAtt > 1:314850/1‑288 (MQ=255) tATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCTGGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTTTGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTaca < 1:705818/288‑1 (MQ=255) ttGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGCTGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTaca > 1:1607359/1‑286 (MQ=255) ttGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACAcc > 1:1572562/1‑288 (MQ=255) cccTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATa < 1:565120/289‑1 (MQ=255) tttAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAg > 1:1016361/1‑289 (MQ=255) aTCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAGGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTa > 1:831471/1‑259 (MQ=255) aTCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGACTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAGGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTa < 2:831471/259‑1 (MQ=255) cGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCCGAAAAGAAACCCttt > 1:2083294/1‑289 (MQ=255) cGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCAttt > 1:579550/1‑289 (MQ=255) tGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAAGCAGGCGCTGTCTGCGCAATTACACCCCATAAAAGCAACCAttt > 2:43158/1‑287 (MQ=255) ggtctgaCCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGGGGGCTTTCGCGGCTGTATGCCGGACTGAACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAGGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGGATCGGGGGGGGCAGGAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGGTCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGc < 2:2148976/283‑1 (MQ=255) tggtcccGGGGTGGCCGGGCAGAGGTTTGGTGGGCTTTCGCGGCGGTAGGCGGGACTGCACGGGCCTGAGCGCTTTGGCGGTGAATTAGGCCAGGACGGGTCGTACTGGTGGCCGCATGGGGGCGGGCGGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGt < 2:124726/284‑1 (MQ=255) cGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGgggcg < 2:1476871/124‑1 (MQ=255) cGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGgggcg > 1:1476871/1‑124 (MQ=255) cGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATACAAGAATCCATTTTCTGGCGTc > 1:676036/1‑289 (MQ=255) aCCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACGGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAgg < 2:1923136/289‑1 (MQ=255) gTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTg > 1:1396777/1‑289 (MQ=255) tGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTaca < 2:858034/253‑1 (MQ=255) tGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTaca > 1:858034/1‑253 (MQ=255) ggTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGAc > 1:210400/1‑289 (MQ=255) cGGGCGGAGTGTTGGTGGTCTGTCCCCGGTGTATGCCGAGCTGCACTGGCCTGAGCTCTGTGTCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACGGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTGAGCGCCGGAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGAcggcgg < 2:542329/288‑1 (MQ=255) gCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCggg > 2:1072541/1‑189 (MQ=255) gCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACat > 1:488100/1‑289 (MQ=255) gagTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAAt < 1:170413/217‑1 (MQ=255) tCCGCGCTGTGTGCCGGACTGCACTGGACTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGGGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGcgcg < 2:374406/289‑1 (MQ=255) ccGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCgg < 1:2111232/289‑1 (MQ=255) ccGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCGTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCgg < 1:1851136/289‑1 (MQ=255) tGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCt < 1:1866104/288‑1 (MQ=255) ggTATGCCGGACTGCACTGGCCTGACGGCTTTGGCTGTGTATTAGGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCGGCAGCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCt < 2:314850/287‑1 (MQ=255) cGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATaa > 2:1952458/1‑218 (MQ=255) aCTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAgggg > 1:1162470/1‑289 (MQ=255) aCTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAggg > 1:1352108/1‑288 (MQ=255) tGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCa > 1:2010688/1‑135 (MQ=255) tGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCt > 1:2186008/1‑289 (MQ=255) tGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCt > 1:79142/1‑289 (MQ=255) tGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAAGCAGGCGCTGTATGCGCAATTAAACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCt > 1:644230/1‑289 (MQ=255) cACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGcgcg < 2:1481184/268‑1 (MQ=255) cACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCTaa > 2:2007284/1‑289 (MQ=255) ccTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTcgc > 1:250735/1‑150 (MQ=255) ccTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTcgc < 2:250735/150‑1 (MQ=255) aaCGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCTAATCGACCTCTg > 1:1300164/1‑289 (MQ=255) tttGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCCATCAGGCGCTCTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGGGGGGGCCTTCTGGCTGGGCGAGTCGACCTCTGGccc > 2:1191394/1‑286 (MQ=255) tttGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATg < 1:1481962/178‑1 (MQ=255) tttGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCTAATCGACCTCTGGCaa > 2:839025/1‑288 (MQ=255) tgtATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCTAATCGACCTCTGGCAACCACtttt > 2:2130422/1‑288 (MQ=255) ||| CCTGACCCATCGTCAGCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGAGTGGAAGCTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTACTTGAAAAGCTAAAAGCTGGTGAAGTTAGCGCCGAAGGTCTGCGCATTGTGCTGGAAGCGGGTATTCGCGAGCCGATGATCATGCGGGCCAATCAGGCGCTGTATGCGCAATTACACCCCATAAAAGAATCCATTTTCTGGCGTCAGGTTGACGGCGGACATGATGCGCTTTGTTGGCGCGGTGGCTTGATGCAGGGGCTAATCGACCTCTGGCAACCACTTTTCCATGAC > CP042583/486954‑487497 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |