Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 490,454 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 490,454 | 0 | A | T | 99.1% | 510.4 / NA | 221 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (92/125); minor base C (2/0); total (94/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 490,455 | 0 | G | C | 99.1% | 513.4 / NA | 221 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base C (92/127); total (94/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 490,456 | 0 | C | G | 99.1% | 510.7 / ‑6.2 | 221 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (91/127); total (94/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
CGCCAGCCGCTTTATTGCCGATCCTTTTGCCCCAGGTGAACGGATGTACCGTACCGGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑AGCCAAAGCGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTCAGCAGCTTGCTGGGGTGTGACGTGCAGGATGCCGATGCTGATTTCTTCGCGCTTG > CP042583/490183‑490730 ||| cGCCAGCCGCTTTATGGCCGATCCTTTTGCCCCAGGTGAGCGGATGTACCGTACCGGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCg < 1:130847/289‑1 (MQ=255) gCTTTATTGCTGTTCCTTCTGCCCCAGGTGAACGGATGTACCGTACCGGTGACGTTGCCCGCTGGCTGGATACCGGCTCGGTGGCGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGATGATGCTCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATAc < 1:578375/289‑1 (MQ=255) tttATTGCCGGTCCTTTTGCCCCAGGTGAACGGATGTACCGTACCGGAGACGTGGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCa < 2:1059285/289‑1 (MQ=255) gtCCTTTTGCCCACGTGGACCTGATTTACCTTTCCGAGGACGTTGCCCGCTGGCTGGGTAACGGCGCGGTTGAGTACCTCGGGCGCAGTGAGAATCAGCTAATAATTCGCGGTCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGAGCGCGTGATGCAGTCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCCCGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTTATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGc < 2:1815673/287‑1 (MQ=255) aTCCTTTTGCCCCAGGTGAACGGATGTACCGTACCGGGGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTg > 2:761803/1‑272 (MQ=255) gttggCCCCAGGTGAAGGGAGGTCCCGTACCGGGGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGgcg < 2:2246886/285‑1 (MQ=255) ccccAGGGGACCGTATGTCCCGTACCGGGGACGTTGCCCGCTGGCGGGATAACGGGGGGGTGGAGTACCGCGGGCACAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCt < 2:588956/289‑1 (MQ=255) cAGGTGAACGGATGTACCGTACCGGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCg > 1:749270/1‑289 (MQ=255) aaCGGATGTACCGTACCGGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAgcg < 1:1113701/264‑1 (MQ=255) aCGGATGTACCGTACCGGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAAc < 1:711975/288‑1 (MQ=255) gtaccgtaccGGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGcca < 1:583571/289‑1 (MQ=255) taccgtaccgGAGACGTTGTCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGAACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACGGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGAGTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGcca < 1:1389890/288‑1 (MQ=255) accgtaccgGTGACCTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGGGCGGTGGAGAACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGccacc < 1:823355/289‑1 (MQ=255) accgtaccgGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGccacc < 1:1869998/289‑1 (MQ=255) accgtaccgGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGccacc < 1:501492/289‑1 (MQ=255) accggaccggGGCGGTGGCACGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGAAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCCCGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGccacc < 2:1246795/289‑1 (MQ=255) gtaccgGGGCGGTTGCCCGCTGGCTGGATACGGGCGCGATGGAGTACGTCGGGGGAAGTGAGGATCAGCTAAGAATGCGCGGGCAGCGTAGCGAACTGGGCGGAAGCGCTCGCGTGATGCAGGCGCTGCGGGCTGTCGAACATGCCGGTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGGGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAAGCGGGCCTGCCGGTGGAGACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACcaca < 2:73160/289‑1 (MQ=255) taccgGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATAc > 2:2040538/1‑246 (MQ=255) taccgGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACat > 1:1246795/1‑289 (MQ=255) taccgGAGACGTTGCCCGCGGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCCGCCACCGGTGGTGATGCCCGGCAATTGGTGGGCTATCTGGTGTCGCCATCG‑GTCCTGCCGTTGTAGCCCATGCCATTGCATGCGCAGCCTCGTAAAACAtccgccccacgc > 2:1669275/1‑278 (MQ=255) ccgGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCCGCGCATTGCCGGCCCCGCTTCGTGAAACCTTGCCCCCCCatat > 2:1223101/1‑289 (MQ=255) ccgGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACAtt < 2:882941/277‑1 (MQ=255) ccgGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACatat > 1:1106837/1‑289 (MQ=255) ccgGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACatat > 1:886963/1‑289 (MQ=255) ccgGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACatat > 1:2165264/1‑289 (MQ=255) gggggaCGTTGCCCGCTGGCTGGATAGCGGGGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAACATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATg < 2:1412876/285‑1 (MQ=255) aCGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGccacc < 1:77165/277‑1 (MQ=255) aCGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCCGGTT‑TCGCAATCGGGCCTGCCGCTTGATACCAGCCCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGCATCATTGCCACCACACATTGTAc > 2:1928266/1‑288 (MQ=255) ctggctggATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCTCAGCTGCGTGAAACATTGCCCCCACATATGGTa > 2:77165/1‑277 (MQ=255) aCGGGGGGGTGGAGTACCTGGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTcc < 2:932895/289‑1 (MQ=255) aCGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTcc < 1:1697364/289‑1 (MQ=255) cgcgGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTcc > 1:151491/1‑285 (MQ=255) cgcgGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTcc < 2:151491/285‑1 (MQ=255) cTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTTCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGCTACCACTTAgc > 1:1030032/1‑288 (MQ=255) cGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTGCTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGGCTCAACGTCCACAGTTACCatctatcgc > 2:567273/1‑280 (MQ=255) cGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGcc > 1:1074453/1‑289 (MQ=255) cGGGCGCAGTGATGATCAGATAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGcc < 1:294862/289‑1 (MQ=255) ggCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGCGTGATTAACCAGGCGGCTCCCCCCGGTGCTGATGCCCGCCAACTGGTGGGCTATCTGTTG‑TCTCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCCTTGCAGGCGCAGCTCCGTTAAACATTGCCACCCTATATGTTA‑CGGTCGTCTCCGCTCCTACTGCCCCAGTTACCACCTAGCGccc > 2:2090856/1‑287 (MQ=255) gcAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACg < 1:1682688/288‑1 (MQ=255) gcAGGGGTGACCAGCTAAAAATGCGGGGGCGGCGTATCAAACTGGGCGAAATCGATCGCGGGAGGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACg < 2:32607/288‑1 (MQ=255) aGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTCACCACTTAGCGCCAACGGCa > 1:399425/1‑289 (MQ=255) aGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGGGGT‑TCTGGTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACCGCa > 2:1112097/1‑289 (MQ=255) gTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGccacc < 2:1949429/229‑1 (MQ=255) gTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGccacc > 1:1949429/1‑229 (MQ=255) gatCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTgg > 1:669631/1‑289 (MQ=255) gcaggcacaaaaTCCGGGGGCTGCGAAGCGAACTGGGCGAAACCGCTCGCGTGATGCAGGACCTGCCGGATGTCGCACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTgg < 2:10164/280‑1 (MQ=255) aGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCTGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCggtgg > 2:284473/1‑237 (MQ=255) gcgGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTAcc < 1:1420396/289‑1 (MQ=255) ggggacgagtttCGAACTGGGGGAAATCGATCGCGGGATGCAGGAGCTGCCGGTTGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTAcc < 2:1074453/277‑1 (MQ=255) cgGGCAGCGGATCGAACGGGGCGAAGTCGATCGCGGGATGCAGGGGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTAcc < 2:978413/288‑1 (MQ=255) accgggCGAACTCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCCCGCCTGTGTGATTACCCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAg < 1:1669275/286‑1 (MQ=255) tGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATAGGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTACCGCCAACGGCAACATGGACCCCCAAGCCTTACCGTTACCTGAACCGAAAGc > 2:2151868/1‑289 (MQ=255) gCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGcac < 1:1928266/288‑1 (MQ=255) gCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGcac < 1:2151868/288‑1 (MQ=255) gCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGcac < 1:1567258/288‑1 (MQ=255) gCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGcac < 1:2008707/288‑1 (MQ=255) gCGAAAGCGGTCGCGTGATGCAGGCGCGGCCGTCGAGCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCTGCGGCCTCCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGcac < 2:1087626/288‑1 (MQ=255) ctgaagtagtgcgcgTGGTGGAGGCGCGGCCGGTTGTCGAGCAAGCGGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGGG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGcac < 2:645479/277‑1 (MQ=255) gAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACaa < 1:1223101/288‑1 (MQ=255) gCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTTGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACCAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCggg > 1:1484767/1‑288 (MQ=255) gCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCggg < 2:749270/288‑1 (MQ=255) ccGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCtgctgc > 2:1855614/1‑184 (MQ=255) gCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTgg < 1:1763220/208‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTgg > 2:1763220/1‑208 (MQ=255) gCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGc > 1:1746428/1‑213 (MQ=255) cGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGACGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGTATACCAGCGCATCGCAGGCGCCGCTTCCTGCAACATTGCCACCACATACGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACCTCCACAGTTACCACTTAGCTCCAACGTCAAGCTGGATCTCCAAGCCTTACCGTTTACTGTACTGAAGGCACAAGCGCCAGGTCGCGCGCCCCATTCGACCA‑CTTAAACGATAATCTCcgcgccgtc > 2:1695803/1‑283 (MQ=255) gcgtgggggATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGGGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTct < 1:2134946/281‑2 (MQ=255) ccTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGa < 1:248496/88‑1 (MQ=255) tgtgtgATTGACCAGGCGGAGCCCACCGGGGGTGATGCGCGTAAATTGGGTGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgt < 2:368731/289‑5 (MQ=255) tgtgATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGccacc < 1:756546/126‑1 (MQ=255) tgtgATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑Tctgct < 2:357497/150‑1 (MQ=255) tgtgATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑Tctgct > 1:357497/1‑150 (MQ=255) tgtgATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCCACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTCCCTGAACTGAGGGCCCAACCGCCAGGGCGTGCTCCTAAACCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcg > 2:48676/1‑283 (MQ=255) tgtgATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTCCCGTTGCCTGAACTTAAGGCCCAAGCCCCCGGGCCTGCGCCGCAAGGCGGCAGGTGAAA‑GACTATCGGCGCGGCCTTctcctcg > 2:2134946/1‑283 (MQ=255) tgtgATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGcac > 2:1624023/1‑227 (MQ=255) tgtgATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgccg > 1:1802539/1‑283 (MQ=255) gtgATTAGCCAGGCGGCTGCCACCGGGGGGGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgtcg < 2:1282501/288‑7 (MQ=255) tgATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTACATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTCACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgtcgt < 1:637959/288‑8 (MQ=255) aTTAACCAGGCGGGTGGCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGGG‑GCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCTAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgtcgttg < 2:517801/288‑10 (MQ=255) ttAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgtcgttgct < 1:867215/289‑12 (MQ=255) aaCCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgtcgttgctgg > 1:1282501/1‑276 (MQ=255) aCCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgtcgttgctggg < 1:15606/289‑15 (MQ=255) aCCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgtcgttgctggg < 1:1621445/289‑15 (MQ=255) gcggcTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCCCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCctgaa > 1:171931/1‑204 (MQ=255) cgggTGCCACCGGTGGGGAGGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGGG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTCTCGTCGTTGCTGGGGtgtg < 2:669631/288‑1 (MQ=255) cggcTGCCACGGGTGGAGATGCGCGTCATGTGGTGGGCTATCTGTTG‑TCGCAATCGGGCGTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTCTCGTCGTTGCTGGGGtgtg < 2:1404069/288‑1 (MQ=255) cggcTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑Tctgct > 2:1635405/1‑136 (MQ=255) cggcTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑Tctgct < 1:1635405/136‑1 (MQ=255) cggcTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCct < 1:571934/200‑1 (MQ=255) tggcACCGGTGTTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTCTCGTCGTTGCTGGGGTGTGACGTg < 1:1043289/286‑1 (MQ=255) tGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAAGCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTCTCGTCGTTGCTGGGGTGTGACGTg < 1:476970/289‑1 (MQ=255) ggacACCGGGGGTGGTCGGTGTCACGTGGTGGGCTGTCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGGAGCTGCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACATAGCGCCAACGGCAAGCTGGATTGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTCTCGTCGTTGCTGGGGTGTGACGTg < 2:1326713/286‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgtcgttgct < 1:1730574/272‑12 (MQ=255) tggtgATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAg > 2:1579581/1‑173 (MQ=255) cgcgTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGccacc > 1:1852473/1‑91 (MQ=255) cgTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgtcgttg > 1:2074767/1‑246 (MQ=255) cgTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTctcgt > 2:1730323/1‑246 (MQ=255) ttGGTGGGCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTCTCGTCGTTGCTGGGGTGTGACGTGCAGGATGCCGATGCTGATTTCTTcg < 1:940535/289‑1 (MQ=255) gggCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑Tctgct < 2:854594/102‑1 (MQ=255) gggCTATCTGGTG‑TCGCAATCGGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCG‑‑AGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTCTCGTCGTTGCTGGGGTGTGACGTGCAGGATGCCGATGCTGATTTCTTCGCGCTTg > 2:1560711/1‑288 (MQ=255) ||| CGCCAGCCGCTTTATTGCCGATCCTTTTGCCCCAGGTGAACGGATGTACCGTACCGGAGACGTTGCCCGCTGGCTGGATAACGGCGCGGTGGAGTACCTCGGGCGCAGTGATGATCAGCTAAAAATTCGCGGGCAGCGTATCGAACTGGGCGAAATCGATCGCGTGATGCAGGCGCTGCCGGATGTCGAACAAGCCGTTACCCACGCCTGTGTGATTAACCAGGCGGCTGCCACCGGTGGTGATGCGCGTCAATTGGTGGGCTATCTGGTG‑AGCCAAAGCGGCCTGCCGTTGGATACCAGCGCATTGCAGGCGCAGCTTCGTGAAACATTGCCACCACATATGGTACCGGTGGT‑TCTGCTGCAACTTCCACAGTTACCACTTAGCGCCAACGGCAAGCTGGATCGCAAAGCCTTACCGTTGCCTGAACTGAAGGCACAAGCGCCAGGGCGTGCGCCGAAAGCGGGCA‑GTGAAACGATTATCGCCGCGGCATTCAGCAGCTTGCTGGGGTGTGACGTGCAGGATGCCGATGCTGATTTCTTCGCGCTTG > CP042583/490183‑490730 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |