| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 491,489 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 491,489 | 0 | A | T | 99.3% | 343.5 / NA | 145 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 491,490 | 0 | G | C | 100.0% | 340.8 / NA | 145 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (56/89); total (56/89) | |||||||||||
| * | CP042583 | 491,491 | 0 | C | G | 100.0% | 344.6 / NA | 145 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (56/89); total (56/89) | |||||||||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CTTGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGTCTGGACCCGGAAGTGCTGGCGGAGATTAACCGCGAACGCGAGGCCTTCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTAGTACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGAGCCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGATATTATCTCTCCAGGGACGTTTGAAAAAATTGGGCCGATTATTCGCGCAACGCTAAACAGGTAAATTAATATTATTTATAAACCCATAATTACAGAAAATAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAATTATCACCAACTGGTAAA > CP042583/491209‑491768 ||| ttGCTGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGTCTGGACCCGGAAGTGCTGGCGGAGATTAACCGCGAACGCGAGGCCTTCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGa > 1:1772170/1‑289 (MQ=255) tGGATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGTCTGGACCCGGAAGTGCTGGCGGAGATTAACCGCGAACGCGAGGCCTTCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAg < 2:819710/288‑1 (MQ=255) gataacctgccgccAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGGCTGGACCCGGAAGGGCTGGCGGAGATTAACCGAGAACGCGAGGCCTTCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCg < 2:2006080/280‑1 (MQ=255) gATACCTGGCCGCCAGAAACGCAAAACTGGCAGGAAAAAGAAGCTAATGGTCTGGACCCGGAAGTGCTGGCGGAGATTAACCGCGAACGCGAGGCCTTCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGGTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCg < 1:1582277/288‑1 (MQ=255) 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tAATGGTCTGGACCCGGAAGTGCTGGCGGAGATTAACCGCGAACGCGAGGCCTTCCTGGCAGCACAGCAGGTAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTCAGGATTGTGCGCATGTGGAtattat < 1:506028/288‑1 (MQ=255) tAATGGTCTGGACCCGGAAGTGCTGGCGGAGATTAACCGCGAACGCGAGGCCTTCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAg > 2:303184/1‑242 (MQ=255) tAATGGTCTGGACCCGGAAGTGCTGGCGGAGATTAACCGCGAACGCGAGGCCTTCCTGGCAGCACAGCAGGGAAGTACTTCAACGGAGTTGTTTACCACCATTGAAGGCAACTACGCTGATGCTGTGCGCCTGCTGACGACTGCTCATAGCGTACCGTTTGACGGTAAAGCGACGCTGTTTGTTGCTGAACGCACACTTCAGGAAGGTATGAGTCCCGAACGCGCCTGGTCGCCGTGGATAGCGGAGCTGGATATCTATCGTTAGGATTGTGCGCATGTGGAtattat < 1:1526266/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |