Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,537,098 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,537,098 | 0 | G | C | 99.6% | 632.2 / NA | 264 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,537,099 | 0 | C | G | 99.2% | 627.4 / NA | 264 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (127/135); minor base T (0/2); total (127/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,537,100 | 0 | T | A | 99.6% | 628.5 / NA | 264 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (127/136); minor base G (0/1); total (127/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
TACCTGAAAAATCCCACTCAAATTACTGACTGTCACCTTTTTATCGTTGGCAACCATTTGCTTAATTGCCTGAATCCTGTCTTTTGCCGCCACGATTACACCCCTGTATCTTTTTACATCACATTAGCGCGATTATCGCATAACCGATGTTTACTTTCAAAATAACCTGTTTGAATCACAGATTTTCATCACAGTTTTCACAGAAACAGAGGTGAATCGTGTTGAGTATTTAACGCTCCAGGGCCTCTGCCATTTCCCTCATCAATGTTGCGTCTGCATCGCTTAAGTTGATATTCAGTGCCGCGACATTTTCGCGTACCTGTTCCGGTGCAGTAGCCCCACTAAGAATGGAGATTAAATCACTCTGTTTTAATATCCACGCCAGTGCCAGAGTGGGAATTGTGCACTGATAACGAGCACAAAGTGGCTGCCACTGTTCAAGCATATCAATCACTTTCAGCATGTTTTCACGCTGGAACCAGACTTTATTTGCCCGAGCGCCGCCCGGAACGTAATCACGAGTGATGGTGCCGGTCAACAATCCCTGCTCTAGCGGGGAAT > CP042583/1536818‑1537378 ||| tACCTGAAAAATCCCACTCAAATTTGAGACTGTCACCTTTTTATCGTTGGCAACCATTTGCTTAATTGCCTGAATCCTGTCTTTTGCCGCCACGATTACACCCCTGTATCTTTTTACATCACATTAGCGCGATTATCGCATAACCGATGTTTACTTTCAAAATAACCTGTTTGAATCACAGATTTTCATCACAGTTTTCACAGAAACAGAGGTGAATCGTGTTGAGTATTTAACGCTCCAGGGCCTCTGCCATTTCCCTCATCAATGTTGCGTCTGCATCCGATAAGtt > 2:431343/1‑289 (MQ=255) 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