Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,552,906 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (159/119); total (159/119) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,552,908 | 0 | C | G | 99.3% | 646.1 / NA | 278 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base G (158/116); total (159/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
TTGCTGACGTTAATTTTATTTTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGAGCAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTTTTATTTGTTTAACCAGCCTGGCGCTCTTTTGTTATGGAAAAGACAACATCCTTGACAACAATAAGAAAAAAACGGGAATCCTGTTGCTGGCGCTGATCCCTTTTTTAGTTTTTCCCCTTCTGGCACACAATCTGAGCAGTTATAACGCTGACTATTCTTTGTATGTCGTCGATTACTGTCCGGACAACCATACTGCGACCTGGGGAATCAACTATACAAAAATATTGGTTTGTCTGTGG > CP042583/1552630‑1553187 ||| ttttGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTcc > 1:327789/1‑289 (MQ=255) 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