Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 1,567,665 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | CP042583 | 1,567,665 | 0 | G | C | 99.6% | 609.7 / NA | 258 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,567,666 | 0 | C | G | 100.0% | 611.6 / NA | 258 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (122/136); total (122/136) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,567,667 | 0 | T | A | 99.6% | 605.5 / NA | 258 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base A (121/136); total (122/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
TTTTAGCGATGAAGAGCGTGCCAGCCAGCAAAGTATGTTGATCTGTTGTAGCCGTGCGAAGGGTAAACGCCTGGTGTTGGATTTGTAATTTGCCGAAGCCGGATGTGGCGCTGAGCGCGCCCAGTCCGGCTTCGGAAGATTTTACTGCGGATATTCCTGCAATAAATTGTGTAATGCTTCCGCCATCAGCTCACCACGCCAGCCGGAAATCAGCTCCGGCAAATTGTTCTGCGGTTTCAGTTTCCAGTGCCAGTTCAGCAGTTGGTTGATTTGCCGACGGCTTGCCAGCAATTCGGCGCTGATCTTATGCGTTTCGCTCACGTCAGTAATCAGGCTCTTAATCGCTTTAAACGCTTTACGATAACCCGGCATGTCCATCAGGTTAAGCATCGGCTGCGGTAAGGCATCTTCCGGCAATGTCTGCGCTTTTTCCACCAGCGCTAGCAGCGTTTTACCGTGAAAGCGGATTTCGCTACCGGATAAACCCAGGCTGTCCAGTTCGCCTAAACTTCCCGGCATATAACGCGCTACGCTCCACAAATGCTCTTCACGCA > CP042583/1567386‑1567939 ||| ttttAGCGATGAAGAGCGTGCCAGCCAGCAAAGTATGTTGATCTGTTGTTCGCGTGCGAAGGGTAAACGCCTGGTGTTGGATTTGTAGTTTGCCGAAGCCGGATGTGGCGCTGAGCGCGCCCAGTCCGGCTTCGGAAGATTTTACTGCGGATATTCCTGCAATAAATTGTGTAATGCTTCCGCCATCAGCTCACCACGCCAGCCGGAAATCAGCTCCGGCAAATTGTTCTGCGGTTTCAGTTTCCAGTGCCAGTTCAGCAGTTGGTTGATTTGCCGACGCGATGCCAGc < 1:1456713/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |