Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,597,536 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,597,536 | 0 | A | T | 100.0% | 832.7 / NA | 345 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (196/149); total (196/149) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,597,537 | 0 | G | C | 99.7% | 813.0 / NA | 345 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (196/147); total (196/149) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,597,538 | 0 | T | A | 99.7% | 825.4 / NA | 345 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (195/149); minor base C (1/0); total (196/149) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 345 total aligned reads displayed.
GGCGATGCGATAACGGGGAGCATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGAGTCATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGAGTATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACGGCAGGAAGATACA > CP042583/1597257‑1597814 ||| tgcgatAACGGGGTCGATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTc > 2:503006/1‑289 (MQ=255) gatAACGGGGTCGATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCga < 2:314378/288‑1 (MQ=255) tcgaTGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTggg > 1:1002603/4‑289 (MQ=255) cgaTGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGa < 1:1417784/287‑1 (MQ=255) cGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTGTAACGACGGTGACGGTGTCACTTCTTAATGTCTAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATTCGCa > 2:647787/1‑288 (MQ=255) gCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCTAAACTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGGTGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCt < 2:2251542/288‑1 (MQ=255) gCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTa < 2:1401294/289‑1 (MQ=255) gCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCGCGCTACGCGt > 2:209226/1‑289 (MQ=255) gCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGt > 1:1554492/1‑289 (MQ=255) cTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTa > 2:1534817/1‑289 (MQ=255) tCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAg < 1:357675/289‑1 (MQ=255) ccTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACt < 2:615251/289‑1 (MQ=255) tatttatGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGAtttt < 2:928776/241‑1 (MQ=255) tatttatGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCgtg > 1:388170/1‑283 (MQ=255) atttatGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGCCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTgtctgtct > 1:850607/1‑289 (MQ=255) ttatGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTaa > 1:217494/1‑212 (MQ=255) ttatGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCgtgt > 1:92341/1‑281 (MQ=255) gTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTg > 1:1737745/1‑288 (MQ=255) tttGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGc > 2:324426/1‑288 (MQ=255) caCTGCGGATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAACGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCgg < 1:478554/288‑1 (MQ=255) gggAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTa > 1:1012984/1‑288 (MQ=255) tttACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAg < 2:1002603/289‑1 (MQ=255) tACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCgtgt > 1:891643/1‑250 (MQ=255) gctgATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCcg < 1:1527152/289‑1 (MQ=255) ctgATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACtt < 2:2052959/231‑1 (MQ=255) ctgATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCcgc > 1:666713/1‑289 (MQ=255) tgATTCTTGAGCGTGTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATTTCTACCTGGTTGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCcgcg < 2:1737745/289‑1 (MQ=255) tgATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCcgcg < 1:2088580/289‑1 (MQ=255) gATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCcgcg < 2:695709/288‑1 (MQ=255) gCTTGAGCGACTTATAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATCAAGGTACAGGATTATGCCAATATCCAGGCTGGTGTCTGCTTGTACTCTTTTGTGGCGTTTGTGATGTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAGGAACTGTGGGAGCGTTTATATCCGCAGCGCCCGGCTACGCGTAGGAACGAGATATTTCGTGTCTGTTCTTGGTGCCTTTTTACCGGCTATCAAGATCAACGTGGTCGTTGCCCGTGttt > 2:1778254/1‑287 (MQ=255) gCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTg > 1:1853114/1‑288 (MQ=255) tGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCat > 2:438164/1‑289 (MQ=255) cTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATccc > 1:1637735/1‑287 (MQ=255) cTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGc < 1:204624/289‑1 (MQ=255) cTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGCGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGc < 1:1261080/289‑1 (MQ=255) tGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGc > 2:1618831/1‑289 (MQ=255) gggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCa < 2:568595/175‑1 (MQ=255) gggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCTTGGTCGCTGCCCGCCGTGCCTTATCCCCCTACTCCCGc > 2:1837029/1‑288 (MQ=255) gggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCg > 1:1315885/1‑289 (MQ=255) gggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCg > 2:411233/1‑289 (MQ=255) gggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCg > 1:1946069/1‑289 (MQ=255) aaTGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCg < 2:1243827/288‑1 (MQ=255) cTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCAtttt > 1:1065543/1‑222 (MQ=255) tCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGcc < 2:1072608/171‑1 (MQ=255) atatCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCCTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCCGCCTCGcccgcctc > 2:331356/1‑282 (MQ=255) cGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATg < 2:1419793/288‑1 (MQ=255) ggCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAAt > 1:83499/1‑286 (MQ=255) aTTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTggg < 2:1937596/289‑1 (MQ=255) ggCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGggcgg < 1:411233/289‑1 (MQ=255) gCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTa < 1:595205/153‑1 (MQ=255) gCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCtt < 2:187585/185‑1 (MQ=255) gCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAACAATGCTGTGCGGCGCTGt > 1:533046/1‑289 (MQ=255) gCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGt > 2:2162419/1‑289 (MQ=255) aaGGTACATGATTATGCCCATTTCCTGCCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCgtcaa < 2:850607/289‑5 (MQ=255) aaGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCgtcaa < 1:324426/289‑5 (MQ=255) gTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATg > 2:802660/1‑263 (MQ=255) tcctggATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACAGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGggcgg < 1:745723/266‑1 (MQ=255) cAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGCCGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTTTCCAAATCATCGTGGTCGCTGCCCGCGTTTCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGCCGCTGttcgagccaatcgctt > 2:628025/1‑275 (MQ=255) cAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTTGTCGCTGCCCGCGTTGCCTTATCCCGCTACGCCTCCGTCGCCGTCATATCCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCgtcatgctttt > 2:944692/1‑279 (MQ=255) agtagagccATATCCAGGCTGTGGTCGGCTTGTTGTCTTGTGTGGCGGTGGTGATTTGAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGGTATTTAATCAGCAGCGCCGCGCTACGCGGAGGGATGAGAGACTTCGTGTCTGTGTTGGGTGCCATTTTACCGGATATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTa < 2:1951018/280‑1 (MQ=255) aTGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGtt > 1:2007493/1‑289 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTAt < 1:1159158/178‑1 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTAt > 2:1159158/1‑178 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTTGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGGCCTGTTAGCGTCATTCGTTTTATTGtt > 2:1803808/1‑288 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGggcgg > 2:1476581/1‑260 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGggcgg < 1:1476581/260‑1 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGGGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGTAGCTGTTAGCGTCATTCGTTTTATTGtt > 1:1761701/1‑288 (MQ=255) atatCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCatat < 1:1426759/208‑1 (MQ=255) tatCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGcc < 1:2162419/289‑1 (MQ=255) atCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCa > 2:735291/1‑289 (MQ=255) ggCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCCAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCaa > 1:496959/1‑285 (MQ=255) ggCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGGGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCGACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTCACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGggcgg < 2:1056061/248‑1 (MQ=255) gCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAgcg > 1:627069/1‑104 (MQ=255) gCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGt > 1:1334448/1‑216 (MQ=255) gCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGt < 2:1334448/216‑1 (MQ=255) gCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGgcggcg < 1:1124092/249‑1 (MQ=255) gCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGgcggcg > 2:1124092/1‑249 (MQ=255) gCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTg < 2:715812/288‑1 (MQ=255) gCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGGTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCGTAGTCTGCAATAATACTGGGCGGCGCTTTTAGCGTCAATCGTTTTATGGTTACCtctccaccgtg > 2:132332/1‑279 (MQ=255) cTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCt < 2:382229/286‑1 (MQ=255) gtgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCgaag > 1:1623878/1‑72 (MQ=255) gtgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCCTAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTTTTACCTTCCCACCTGTTg > 2:2177607/1‑287 (MQ=255) gtgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTg < 1:231402/276‑1 (MQ=255) gtgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTg > 2:231402/1‑276 (MQ=255) tgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTTGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCt > 1:2249435/1‑289 (MQ=255) tgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCt < 2:768977/236‑1 (MQ=255) tgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCt > 1:768977/1‑236 (MQ=255) tgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCt > 1:715055/1‑289 (MQ=255) tgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCt > 1:1913664/1‑289 (MQ=255) tCGGCTTTTTCTCTTTTTTGGGGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTAt < 2:2007493/289‑1 (MQ=255) ggCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTAttt > 1:278127/1‑289 (MQ=255) gCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCTCGCCACGCCTGCGTCGCCGTCCTAGTCTGCAAAAATGCAGGGCGGCGCCGTTAGCGCGAATCGGTTTATTTTTACACGCCAGCCCGTAGCCTAttgt > 2:294475/1‑287 (MQ=255) cTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTc < 1:119844/288‑1 (MQ=255) ggCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGaa < 1:1837029/288‑1 (MQ=255) cGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACg < 2:871860/288‑1 (MQ=255) ggTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACggagga < 2:1259687/289‑1 (MQ=255) ggTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTCACCTGCTAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACggagg > 1:2082974/1‑288 (MQ=255) gATTTTAACGACGGTGCCGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTTGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACgg < 1:1960470/289‑1 (MQ=255) tAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGc < 2:1515941/165‑1 (MQ=255) cgacgGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACGGCAGGAAGa > 2:1638664/1‑289 (MQ=255) ||| GGCGATGCGATAACGGGGAGCATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGAGTCATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGAGTATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACGGCAGGAAGATACA > CP042583/1597257‑1597814 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |