| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 442,475 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 442,475 | 0 | A | T | 99.6% | 585.3 / NA | 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (136/110); total (136/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 442,476 | 0 | G | C | 99.6% | 579.4 / NA | 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (136/111); total (136/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 442,477 | 0 | C | G | 99.6% | 581.4 / ‑4.9 | 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (134/112); minor base A (1/0); total (136/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TTTATCGACTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTAGCACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACGGGGGAGTTAATTCGTCATGCG > CP042583/442200‑442756 ||| tttATCGACTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTcc < 1:1994525/289‑1 (MQ=255) aCTCGCATTGCCGTTATTTATCGCCATATTGTTAATGGCATTACCGCCTGTGGATCTGCAAGACCTTCCAGTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTACCGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGTCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCg < 2:1712445/289‑1 (MQ=255) aTTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTAAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGttt > 2:1503659/1‑288 (MQ=255) gTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGa < 1:126154/289‑1 (MQ=255) tCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATg > 2:978145/1‑267 (MQ=255) tatTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGa < 1:921736/289‑1 (MQ=255) tAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATggcgg < 2:57678/289‑1 (MQ=255) aTGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATg < 1:1012949/253‑1 (MQ=255) ggcaggaCCGCCTGTGTATCTGCAAGACCGTCCAGTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGaa < 2:905005/283‑1 (MQ=255) ggCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTACCGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGaa < 1:1206990/289‑1 (MQ=255) aTTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAgg < 1:127834/288‑1 (MQ=255) ttACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGa < 1:35003/289‑1 (MQ=255) tACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGAc < 1:652569/289‑1 (MQ=255) tgtgTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAATGGCAGGTggtt > 2:1765190/1‑287 (MQ=255) tgtgTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCACCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGAAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACATTATTTGTTTTGTGCTAGCGGATGTCGGCGAAGGGTCGGTGGag > 2:1037455/1‑288 (MQ=255) gtgtATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGCACTATAGCTGTTGGCCGGTAGTGGATGGCGGCGACGGGACGGTGGaag > 2:2076078/1‑287 (MQ=255) gtgtATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATg > 1:272179/1‑289 (MQ=255) gCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTc > 2:128649/1‑289 (MQ=255) cAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGt < 1:416346/287‑1 (MQ=255) aGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATTTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTCCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGCTGGTcgcc > 2:1465150/1‑289 (MQ=255) aGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGTGAACTATATCTGTTTGCCGATATCGGATGGCGGCGCTGGTCCGGCGGATGCGATGGTctcc > 2:116508/1‑289 (MQ=255) aGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGACGCGCGGGTcgc > 2:1087889/1‑288 (MQ=255) cTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGa < 2:1977718/289‑1 (MQ=255) tCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTcc < 2:726555/216‑1 (MQ=255) tCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACg > 2:1698404/1‑289 (MQ=255) tCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACg > 2:189565/1‑289 (MQ=255) tCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCGGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACg > 2:432705/1‑289 (MQ=255) tCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCAACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACg > 1:1669811/1‑289 (MQ=255) aCGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCa < 1:2154700/289‑1 (MQ=255) tCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACtata > 2:187610/1‑218 (MQ=255) cGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACg > 2:605790/1‑276 (MQ=255) gTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGTCGGGCGGCAACATCGt < 2:1004382/289‑1 (MQ=255) tGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGTCGAGAGCGGCTGGCGGCGTAGGGACGGTGGCTGCGAGGGTCGCCGCGAGGGGGGGCACCAGCGGGActc > 2:1899182/1‑286 (MQ=255) gCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGAc < 2:1280291/243‑1 (MQ=255) gCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCtt > 2:657475/1‑289 (MQ=255) cAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGaa < 2:498035/289‑1 (MQ=255) cAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGaa < 2:1358524/289‑1 (MQ=255) aCGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg < 1:128649/289‑1 (MQ=255) gCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCgg > 1:197186/1‑289 (MQ=255) gCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACAGCGTGACGCTTGAAGTCTGCgg > 1:297498/1‑289 (MQ=255) tATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCGACAGCGTTACGTCTGCACTCTGCGGGcc > 2:58954/1‑289 (MQ=255) tACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGaa < 1:503179/175‑1 (MQ=255) gCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAAt > 1:699290/1‑288 (MQ=255) tGTTCTTTTGGTTAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGATGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAAAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGc < 1:945719/288‑1 (MQ=255) ttCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCAGCGACGGGCGGCAACATAGGGACGCTTGAAGTCTGCGGGACGGTGGCCCACAAAGTAAGTGCatt > 2:1420707/1‑289 (MQ=255) tGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAACAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGCCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGCAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGCCTGCGGGCGGATGGGCGAAAAAGTGAACGCTTTTTATgg > 2:755716/1‑289 (MQ=255) tGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCGGCGGGCAGATGGGCGAAAAAGGGAAGGCTCTTTATgg > 2:121918/1‑289 (MQ=255) tGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAAGTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGAGCCTCTGTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGAGACGCTTGAAGGCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTGTTATg > 1:566795/1‑288 (MQ=255) gATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTGGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCTGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTTCGGTCCGTTGGTCGAAAAAGTGAATGCTGTTTATGGct > 1:399746/1‑288 (MQ=255) tAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGAt > 2:1195879/1‑258 (MQ=255) tAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCtt > 1:1329187/1‑289 (MQ=255) tAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCtt > 1:1523058/1‑289 (MQ=255) ccTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTAcc > 1:1199812/1‑289 (MQ=255) ccTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTAcc > 1:1365212/1‑289 (MQ=255) ccTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGAGGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGGGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGGGAAAAGAGGAATGCCTTTTATGGCCTTAcg > 2:415130/1‑288 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCg > 2:868299/1‑141 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGCAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCCGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATTGCCTTACCGGCGCCgggc > 2:2173951/1‑288 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATgg > 2:1571104/1‑272 (MQ=255) cgcgttgAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCTCCAGACTCTTTTAAAGAGAGTTTAAGTGCAGAAAAATGTTTTCAGGCAATGAAAGCCGGGTTTTTGACCCTTTTTCCCGATGGGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcgg < 1:1108868/283‑1 (MQ=255) cGCATCGAATAATTTGTTGAAAAGGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcgg < 2:562498/289‑1 (MQ=255) cGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGa > 1:813352/1‑253 (MQ=255) cGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGa < 2:813352/253‑1 (MQ=255) cGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcgg < 1:1430345/289‑1 (MQ=255) cGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcgg < 1:1560930/289‑1 (MQ=255) cATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGTGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGTGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcggcg < 1:2076078/289‑1 (MQ=255) aTCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcggcg < 1:90200/288‑1 (MQ=255) tCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGc > 2:303341/1‑216 (MQ=255) tCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGc < 1:303341/216‑1 (MQ=255) ttgttgAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGAt > 2:958567/1‑289 (MQ=255) aTTGATAATGAGGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAg < 2:123291/288‑1 (MQ=255) aTTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAg < 1:1837634/288‑1 (MQ=255) gATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGATTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGc < 2:287987/289‑1 (MQ=255) gcgcCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTg > 1:1086570/1‑289 (MQ=255) cgcCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTGGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAGAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGCTTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCGGATGCTGGTCGCGCCttg > 2:74594/1‑287 (MQ=255) gcCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGaa < 1:1891287/289‑1 (MQ=255) aGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGcc < 1:753262/215‑1 (MQ=255) ctctTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCg < 1:1765190/288‑1 (MQ=255) tctTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTa > 1:22744/1‑289 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGa > 1:1862171/1‑226 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGGGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTg > 1:662577/1‑288 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTg > 1:583734/1‑288 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTg > 1:1253055/1‑288 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTg > 1:859586/1‑288 (MQ=255) cTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGCAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTTACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGCCCTTACCGGCGACGGGAAAACGCGGGTGCTTGAGATGGCGGCAGCAACTGGCCTGCTGCTGGTCGCGCCTGCAAAGCTTAATCCGTTGCTgt > 2:1804487/1‑286 (MQ=255) cTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTcg < 1:797124/260‑1 (MQ=255) cTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTcg > 2:797124/1‑260 (MQ=255) cTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTgg > 1:1104042/1‑287 (MQ=255) ttaatgtcAGAAAAATGTGGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTGGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGGGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCt < 2:583734/282‑1 (MQ=255) aaGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAg < 1:59412/83‑1 (MQ=255) aaGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTc > 2:363586/1‑288 (MQ=255) cAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTa > 2:234744/1‑184 (MQ=255) cAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGttt > 2:1082048/1‑289 (MQ=255) aGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGttt < 2:1365212/288‑1 (MQ=255) aaaTGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGt > 1:1744987/1‑288 (MQ=255) aaaTGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTa < 1:121727/289‑1 (MQ=255) gtCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACGGGGGa < 1:1179021/289‑1 (MQ=255) cAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCCGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACGGGGGAGtt < 1:1420707/286‑1 (MQ=255) aaTTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACGGGGGAGTTAAt < 1:1069407/288‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACGGGGGAGTTAATTCGTCATgcg < 1:1899182/289‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACGGGGGAGTTAATTCGTCATg < 1:1625928/287‑1 (MQ=255) ||| TTTATCGACTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTAGCACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACGGGGGAGTTAATTCGTCATGCG > CP042583/442200‑442756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |