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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 497,696 | 0 | T | A | 98.8% | 557.8 / NA | 247 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); major base A (120/121); minor base C (2/1); total (123/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
TTCCAGCATCTGCCCTTGTGCACTTTCTGGCGTCCAGAGATTGGCACTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTGCGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGGCTCTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCGCTATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGCCGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGACTGCCGGTCAGGGTGACGCTGGTGGAAACAATACGCTGCGGCTGGCTTTCCAGTGTATGTGTGCCACGGCTGT > CP042583/497418‑497974 ||| ttCCAGCATCTGCCCTTGTGCTGATTCTGGCGTCCAGAGATTGGCACTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTGCGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCccgccg > 2:1916326/1‑289 (MQ=255) 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TTCCAGCATCTGCCCTTGTGCACTTTCTGGCGTCCAGAGATTGGCACTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTGCGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGGCTCTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCGCTATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGCCGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGACTGCCGGTCAGGGTGACGCTGGTGGAAACAATACGCTGCGGCTGGCTTTCCAGTGTATGTGTGCCACGGCTGT > CP042583/497418‑497974 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |