Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,677,451 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,677,451 | 0 | A | T | 99.5% | 437.4 / NA | 183 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,677,452 | 0 | G | C | 100.0% | 433.5 / NA | 183 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (91/92); total (91/92) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,677,453 | 0 | C | G | 100.0% | 437.7 / NA | 184 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (91/93); total (91/93) |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
CGCCCCCGCCGGAAAAGCGCTGGAGTTCAGCAAGCCTGCCGCCTGGCAAAATAACCTGCCACTGACGCCAGCAGATAAAGTTTCCGGTTATAATAACT‑TCTATGAATTCGGGCTGGATAAAGCCGATCCCGCCGCTAATGCTGGTAGCCTGAAAACCGATCCATGGACACTGAAAATCAGCGGCGAAGTGGCAAAACCATTGACCCTCGATCATGATGACTTAACCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGAGCATGGTGGTGCCGTGGATTGGTTTTCCGCTGCACAAATTGCTGGCGCTTGCCGAACCTACCAGCAATGCGAAGTATGTCGCTTTCGAAACAATTTATGCACCGGAACAGATGCCAGGCCAGCAGGACCGCTTTATCGGCGGTGGGCTGAAATATCCTTATGTCGAAGGATTGCGTCTCGACGAAGCAATGCATCCGCTCACACTGATGACCGTAGGTGTTTATGGCAAGGCGTTACCGCCACAAAATGGCGCGCCGGTGCGACTGATTGTGCCGTGGAAATA > CP042583/1677171‑1677734 ||| aaaaGCGTTGGATGTAAGAAAGCCTGCCGCCTGGCAAAATACCCTGCCACTGACGCCAGCAGATAAAGTTTCCGGTTATAATAACT‑TCTATGAATTCGGGCTGGATAAAGCCGATCCCGCCGCTAATGCTGGTAGCCTGAAAACCGATCCATGGACACTGAAAATCAGCGGCGAAGTGGCAAAACCATTGACCCTCGATCATGATGACTTAACCCGTCGCTTCCCGCTGGAAGAGCGTATTTATCGTATGCGCTGCGTGGAAGCGTGGTCGATGGTGGTGCCGTGGAt < 2:278693/288‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |