Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,681,945 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,681,945 | 0 | A | T | 98.1% | 602.2 / ‑2.1 | 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); major base T (113/142); minor base C (4/1); total (119/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,681,946 | 0 | G | C | 98.1% | 590.3 / ‑4.5 | 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/1); new base C (114/142); total (119/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,681,947 | 0 | C | G | 98.8% | 610.3 / NA | 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/0); new base G (114/142); total (119/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.09e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
TATTCCGTTGCGTGAGGTTGCTGGCTGGGAACACGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTAGTTTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACAGCTTTAGCGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTT > CP042583/1681674‑1682223 ||| tATTCCGTTGCGTGAGGTTGCTGGCTGGGAACACGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAAt > 1:1368249/1‑289 (MQ=255) cGTTGCGTGAGGTTGCTGGCTGGGAACACGATCTTCATGCTGCACTGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCa > 1:177376/1‑289 (MQ=255) gTTGCGTGAGGTTGCTGGCTGGGAACACGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCat < 2:299002/289‑1 (MQ=255) ttGCGTGAGGTTGCTGGCTGGGAACACGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCatt > 1:591199/1‑289 (MQ=255) cGTGAGGTTGCTGGCTGGGAACACGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGAGCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCattaat > 1:970430/1‑289 (MQ=255) ctggGAACACGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCa < 1:1630841/288‑1 (MQ=255) tggGAACACGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGa > 2:1304518/1‑289 (MQ=255) cGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGattaatta > 1:434160/1‑288 (MQ=255) cGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGAttaattaa < 1:1032099/289‑1 (MQ=255) aTCTTCATGCGGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAGTCGAATTGGTTGGGGAGAAGGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAAc < 2:1454454/288‑1 (MQ=255) tCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAAtt > 1:1837492/1‑289 (MQ=255) tgctgcAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGaa > 2:1260201/1‑289 (MQ=255) tgctgcAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGaa < 2:434160/289‑1 (MQ=255) ctgcAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTaac < 1:40879/259‑1 (MQ=255) tgcAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAAt < 1:1304518/288‑1 (MQ=255) gcAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATg > 1:1980237/1‑288 (MQ=255) gcAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATg > 1:108971/1‑288 (MQ=255) cAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATg > 2:1949616/1‑287 (MQ=255) aTGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACtt > 1:2028596/1‑289 (MQ=255) tGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCCCGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCCACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTa > 2:626565/1‑289 (MQ=255) tGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGtt > 1:994166/1‑242 (MQ=255) aacaacATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATg > 2:1180238/1‑289 (MQ=255) aacaacATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATg > 1:1463302/1‑289 (MQ=255) aacaTTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGaaa > 1:1872859/1‑289 (MQ=255) tCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAg > 2:2238009/1‑289 (MQ=255) aGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAgtg > 1:883603/1‑289 (MQ=255) aGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAgtg > 1:2023701/1‑289 (MQ=255) gaagaaATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGtt > 1:1420021/1‑289 (MQ=255) aagaaATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAgtgt < 1:532051/287‑1 (MQ=255) gaaATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTgac > 2:1576940/1‑289 (MQ=255) aaTCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTgac < 2:1368249/287‑1 (MQ=255) tggCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCg < 2:1158474/288‑1 (MQ=255) ggtgagaATGCGGCGAGCATTCATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGATGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTATTTAGCGACCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTACCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATGAATTAACAAATTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCt < 2:336209/286‑1 (MQ=255) ggCGGGATTGCGGCGTGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCt < 2:1987279/289‑1 (MQ=255) cGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGATAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTaa > 1:1523185/1‑289 (MQ=255) aaTGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTAt < 2:2077292/252‑1 (MQ=255) gCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCTTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCacac < 2:1629884/289‑1 (MQ=255) gCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCacac < 2:577145/289‑1 (MQ=255) ttATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGa < 1:22575/289‑1 (MQ=255) ttATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGa > 1:1671884/1‑289 (MQ=255) tGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTc < 1:851776/289‑1 (MQ=255) tGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTCTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTc < 2:1404195/289‑1 (MQ=255) agccagcGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCct < 2:2028596/288‑1 (MQ=255) ccagcGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTcc > 1:601547/1‑285 (MQ=255) ccagcGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTcc > 1:207091/1‑285 (MQ=255) tCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTACAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCa < 2:271417/289‑1 (MQ=255) ctgAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCgg > 1:1539395/1‑289 (MQ=255) ctgAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCgg < 2:676691/289‑1 (MQ=255) aaTGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAAt < 1:980932/214‑1 (MQ=255) tGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGaa < 1:1940294/289‑1 (MQ=255) cGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGa < 1:1748385/288‑1 (MQ=255) tACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCaa > 1:2177709/1‑183 (MQ=255) aCTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGt < 2:949264/289‑1 (MQ=255) tCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCg > 1:3164/1‑221 (MQ=255) atatTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTa < 2:883603/289‑1 (MQ=255) atTTCTTTTCCTCTCCACAACTTTTTTCTCCTCGTCTCCCTTCTATGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGAATGCATCAAGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACGTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATg < 2:2022127/289‑1 (MQ=38) tttCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATg > 1:1233504/1‑288 (MQ=255) ttCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGTTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCt > 2:403681/1‑214 (MQ=255) tAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCgg < 2:982050/255‑1 (MQ=255) cgcCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTgacaga > 2:1040501/1‑194 (MQ=255) cgcCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAAcggcg < 1:2233290/262‑1 (MQ=255) cctgAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTTGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGt < 1:1610783/286‑1 (MQ=38) ccAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTGTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGt < 2:108971/289‑1 (MQ=38) ccAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCAATGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGt < 1:154830/289‑1 (MQ=38) aCTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAATGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGt < 1:1354381/289‑1 (MQ=38) aCTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGt < 1:1112159/289‑1 (MQ=255) tttGCTCCTCGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCaga < 2:70765/289‑1 (MQ=255) ctcGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTCATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTACCAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAACTGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTATGTAATTCAGTCGGTAGAACGGTGGACTGTTAACACTTAGGTCACTTGTTCGAGTCCATGCAGACGAGCCa > 2:753189/1‑289 (MQ=255) ctcGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCa < 1:378164/289‑1 (MQ=255) cGTTTCCCTTCATTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCa < 1:671819/225‑1 (MQ=255) attGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGCCTGTTAATCCGTATGTCTCTGGTTCGCGTTCAGTCAGAGGAGCCAACATTTAAAAAtt > 2:1324426/2‑289 (MQ=38) gtgGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGc < 2:1894423/289‑1 (MQ=255) aCGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCt < 1:819237/164‑1 (MQ=255) aCGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACGGTTAATCCGTATGTCACTGGTGCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAATATTCGCtttgtt > 2:2061454/1‑289 (MQ=38) gTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAg < 1:1260201/289‑1 (MQ=255) tCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTg < 2:92332/142‑1 (MQ=255) tCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTg > 1:92332/1‑142 (MQ=255) cTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCa < 1:37065/289‑1 (MQ=255) tcccAATTTGATCACCAAGATCCTTTGCAGAAATTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGACGACTAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGAGTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCaa < 2:177376/287‑1 (MQ=37) tGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCaa < 1:1956310/289‑1 (MQ=255) aTTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCa < 2:129500/289‑1 (MQ=255) aGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGtt < 1:1707821/289‑1 (MQ=255) tttGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACAt < 2:1852049/289‑1 (MQ=255) tttGAAGAGACTGCATCACGATAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACAt < 2:1523185/289‑1 (MQ=255) aCTGCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTa > 1:753712/1‑289 (MQ=255) atggaTCACGCTAATCATACAGATTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTaa < 2:2174570/285‑1 (MQ=255) gCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAAt > 2:46665/1‑188 (MQ=255) gCATCACGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAAt < 1:46665/188‑1 (MQ=255) cgatAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGGCTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGTGGCCAAATTCTAAAAATTCGCTGTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGc < 1:1159264/286‑1 (MQ=37) cGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGc < 2:1463302/289‑1 (MQ=255) cGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGc < 2:1225650/289‑1 (MQ=255) cGCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGc < 1:277259/289‑1 (MQ=255) gCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGt > 2:1673603/1‑119 (MQ=255) gCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCg > 2:212870/1‑289 (MQ=255) gCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCg > 1:1498248/1‑289 (MQ=255) gCTAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCg > 1:105184/1‑289 (MQ=255) tAATGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTa < 1:1195852/184‑1 (MQ=255) aTGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGtt > 2:276315/1‑289 (MQ=255) aTGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGtt > 2:1592355/1‑289 (MQ=255) tGATACAGACTCGTTTTCGGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGttt > 1:686061/1‑289 (MQ=255) ||| TATTCCGTTGCGTGAGGTTGCTGGCTGGGAACACGATCTTCATGCTGCAATGAACAACATTCAGGAAGAAATCGAATTGGTTGGCGAGAATGCGGCGAGCATTGATGCTTATGCAGCCAGCGATCCTGCTGAATGTTTTGCCGTACTTTCTGAATATTTCTTTAGCGCCCCAGAACTTTTTGCTCCTCGTTTCCCTAGTTTGTGGCAACGTTTCTGCCAATTTTATCAACAAGATCCTTTGCAGAGACTGCATCACGCTAATGATACAGACAGCTTTAGCGCGACGAATGTTCATTAATTAACAACTTTGCAGATTAATTAACCAATTGAAATGACTTATGAAATTTAGTGTTGACAGACAAGGTACCGCTAAGTAATATTCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTT > CP042583/1681674‑1682223 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |