Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,718,682 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,718,682 | 0 | A | T | 99.6% | 581.7 / ‑5.2 | 247 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (117/128); minor base C (0/1); total (118/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,718,683 | 0 | G | C | 99.6% | 579.9 / NA | 247 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (117/129); minor base T (1/0); total (118/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,718,684 | 0 | T | A | 99.6% | 587.2 / NA | 247 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (117/129); minor base C (1/0); total (118/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CGTCTCCATCAGGGCGATTACGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAAAGTCAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACAGCGGCGTTAGTCTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCAGCCGCGACGGCACGCTGGCAGGCTCTAACGTCTCTTTATATGAAGAAGTGTGCGCCAGATATCCGCAGGTGGCATTTCAG > CP042583/1718403‑1718960 ||| cGTCTCCATCAGGGCGATTACGGCAAGCAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGata > 2:244746/1‑289 (MQ=255) ccATCAGGGCGATTACGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGGGCGTAGTGGGCGGCTCCACCGCGGTGAAATTACACGATCTGGTg > 2:2090414/1‑289 (MQ=255) ccATCAGGGCGATTACGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTg > 2:445693/1‑289 (MQ=255) gCGATTACGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCt < 1:445693/288‑1 (MQ=255) cGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGaa < 1:2090414/289‑1 (MQ=255) ttACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGa < 1:803631/288‑1 (MQ=255) ggTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCt < 1:1616423/289‑1 (MQ=255) gTAGCGACCGGCTGCGGCAGTTGGAGGATTACGCGGGGGAGGGGGCCGAAGTGATGCACCTGGGGGATATGGCCGGGGCAAAGGATCCGGCTAAACGTGAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGGGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGGGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCt < 2:2106192/288‑1 (MQ=255) cGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCCCCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGGTTAATACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTg < 1:1640841/289‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTgg < 1:2070591/289‑1 (MQ=255) gCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTg < 1:1936890/289‑1 (MQ=255) gCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTg < 1:1660773/289‑1 (MQ=255) cgcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGa < 1:1304062/289‑1 (MQ=255) cgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCtt < 1:1116192/272‑1 (MQ=255) cgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCtt > 2:1116192/1‑272 (MQ=255) cgccgcGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCAGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTGACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGGAGTGGTCGGCTCCACCGCGGGGAAATCACAAGATAGGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGACTCCCTAGTTCGGGCGGTGGGGGTCCGTTTTGACggg > 2:1377178/1‑287 (MQ=255) cgcgCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGTAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACACGATATGGTGAAAGGCG‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCaa > 2:1631656/1‑289 (MQ=255) gcgcAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCt > 2:1756772/1‑260 (MQ=255) cAGGGTGCCGACGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTCCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGCCGTTCCTGGAATCGGTCGTTGCGCGCGTAGTGGGCGGCGCCGGCGCGGTGACGTCACACGATATGGTGACAGGTG‑CGTGTCCACGCTTGGCGGCCGACGACTGATGGCTGTCGCTGGATGTACGTACGGACGAGCGAGGca > 2:17015/1‑289 (MQ=255) cAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATATGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGa > 2:1800517/1‑245 (MQ=255) cGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAg > 2:635056/1‑289 (MQ=255) aGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGAGGCCTTAGTGCTGGCGCGGGATGTCCGTATTTACGAGCCAGGCAAAAATCAgggt > 2:1004660/1‑287 (MQ=255) tgctgcACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTCAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGc > 1:917840/1‑289 (MQ=255) ctgcACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGATACAGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCCGTGACATCACAAGAGATGGTGCGAGGCT‑GGCTGGAACCCGTCGGTGCTGATGCCCTGGTGCTTGTGCTGGCTGTGCGTATTTACTAGCAATCCAACACGCAtgtgacgg > 2:1906956/1‑285 (MQ=255) aCCTGTTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACTTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAg < 1:249586/289‑1 (MQ=255) cTGGGGGATCTGACCGGGGGAAAAGACCCGGCTAACCGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCg < 2:577621/289‑1 (MQ=255) tggtggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCgg < 1:209554/289‑1 (MQ=255) ggtggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGata < 1:1249681/188‑1 (MQ=255) ggtggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGata > 2:1249681/1‑188 (MQ=255) ggtggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCg > 1:1016548/1‑287 (MQ=255) ggtggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCg > 1:1829765/1‑287 (MQ=255) ggtggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCCTCGGTGCCg < 1:2009841/221‑1 (MQ=255) ggtggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCCTCGGTGCCg > 2:2009841/1‑221 (MQ=255) tggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTGCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAGAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTg > 1:1337766/1‑289 (MQ=255) tggATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCt < 1:948942/288‑1 (MQ=255) cTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAag > 1:1350286/1‑289 (MQ=255) tGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCCAGGCAACAAGCCGGTGGCAGTCAGGGGCTgggacag > 2:754169/1‑284 (MQ=255) aCCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGATGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTTACGAGCGAGGCAACAAGCAGGTTGCATGCACAGGATGGCCAgaga > 2:1772778/1‑289 (MQ=255) aCCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAgaga > 1:2184386/1‑289 (MQ=255) cGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAgaga > 1:2157119/1‑287 (MQ=255) ggCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAActcg > 2:807234/1‑286 (MQ=255) ggCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAActcg > 1:71957/1‑286 (MQ=255) ggCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAActcg > 1:614130/1‑286 (MQ=255) aaGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAActcgggcgt < 1:1410404/289‑9 (MQ=255) ccGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGATGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGTGGCGGGCAAGAGAACGCGGGCGtttc > 2:1369328/1‑285 (MQ=255) cGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTc > 1:14895/1‑257 (MQ=255) cTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGtttcactgg < 1:52755/288‑8 (MQ=255) cccTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGATGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGt < 1:1369328/289‑1 (MQ=255) tGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTTGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCa < 2:1222541/221‑1 (MQ=255) tGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTg < 1:875488/173‑1 (MQ=255) tGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAAc > 1:1231172/1‑274 (MQ=255) tGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCg > 1:1714726/1‑288 (MQ=255) tGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCg > 1:496008/1‑288 (MQ=255) tGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCg > 1:2220619/1‑288 (MQ=255) ggTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCgg > 1:1965659/1‑288 (MQ=255) gTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGAGGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCgg > 1:1165143/1‑287 (MQ=255) gTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGaa < 1:737776/270‑1 (MQ=255) gTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGc > 2:1481368/1‑288 (MQ=255) gcgGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGa < 1:590534/289‑1 (MQ=255) cgGGCGTTAACGGTCCGGGGCAGGTTGGAGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGAGTAGTGGTCGGCTCAACCGCGGTGAAATCACAAGAGATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGa < 2:1554901/288‑1 (MQ=255) ggCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCgg > 1:288525/1‑281 (MQ=255) gTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGTTGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑t < 1:473157/288‑1 (MQ=255) taggggtcaggTGGAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTGGCGAAGAAGTGGTGGCGGGGTTACGGGAGGCGGGGGTTGGGCGCGTATTGGTCGGCTCGACGGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGGT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGGCGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCGGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑tgtg < 2:2210334/280‑1 (MQ=255) taaagggtggggggaGGTTGGGGGCGGCGTGGGTAGCGAAGGGGAGGTGGCGGCGTGTCTGGGAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑tgtg < 2:600369/275‑1 (MQ=255) tAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑tgtg < 1:1126010/289‑1 (MQ=255) tAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑tgtg < 1:213292/289‑1 (MQ=255) tAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑tgtg < 1:176802/289‑1 (MQ=255) tAACGTTCCGGGGCAGGTGGGCGGGGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGGTGCGTTACTGGAAGCGGGGGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑tgtg < 2:931729/289‑1 (MQ=255) gaaCGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGGAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑tgtg < 2:1820523/288‑1 (MQ=255) aCGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCt < 1:1171847/289‑1 (MQ=255) aCGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGAGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCt < 2:254073/289‑1 (MQ=255) aCGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGAGAAGAAGATGTGGCGGCGTGACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCt < 1:1798401/289‑1 (MQ=255) aCGTTCCGGGGCATGTTGGCGGAGGCGTGCGTAGGGAGGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCCTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAACCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCt < 1:854518/289‑1 (MQ=255) cGTTCGGGTGCAGTTGGGGGGGTGGGTGCGGAGTGGAGAATAGGGGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGGGGGGAAATCACAAGATAGGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCt < 2:1288500/288‑1 (MQ=255) tCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGCGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGCAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGAGATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCATTAGTTCTGGCGCTTGATGTCCGTATTTACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGCCCGCGGCCGGCCTGAGAACTCGGGTGTTTCACTGGTACAACTGGTTGAAACCTCTCTTACCGTCGTCCTGatgcagtcgccgtgt > 2:1070990/1‑275 (MQ=255) tCCGGTGAGGGTTGGGGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAGAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCtgtg < 2:286420/288‑1 (MQ=255) tCCGGGGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCtgtg < 1:235365/288‑1 (MQ=255) cGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGTAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCt > 2:2077258/1‑210 (MQ=255) aGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGTCTGGCAAGAAGACCCGGGCGGTTCACTGGGACAACCGGGGGAAACCCATCTGCCCGCCGGCCGGAAACA‑TGTACTTTGTACCGagat > 2:1175746/1‑289 (MQ=255) cggcggcgTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCTGGCGTTTCACTGGAACAACACGTGTAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGCAACACTGT‑CTGCGTACCGATGTctccgcc > 2:1501449/1‑283 (MQ=255) cgtgcgtAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGc > 1:400141/1‑289 (MQ=255) aGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTgg < 2:1350286/289‑1 (MQ=255) gaagaaGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTATTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCTACGGCACGCTGGCa < 1:1972423/288‑1 (MQ=255) agaTGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCAGGctct < 1:635056/289‑1 (MQ=255) gcggcgTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGcaac < 2:2003697/147‑1 (MQ=255) ggcgTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAACGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCATGAGAACTCGGGCGTTGCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGGGTACCGATATCTCCCGCGACGGCACGCTGGCAGGTGCCAACGGctct > 2:291024/1‑289 (MQ=255) cgTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCAGGCTCTAACGGCTCttt > 2:942869/1‑289 (MQ=255) gTTACTGGAAGCGGGCGGTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCAGGCTCTAACGTCTCttt < 2:2157119/288‑1 (MQ=255) cGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTTAAACC‑TGTGCTGTGTACCGATGTCTCCGCCGACGGCACGCTTGCAGGCTCTAACGTCTCTTTATTTTAAGAAgt > 2:327064/1‑289 (MQ=255) cGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCa > 1:697672/1‑260 (MQ=255) cGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCa < 2:697672/260‑1 (MQ=255) ttGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCTGGGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCAGGCTCTAAc > 2:1336643/1‑264 (MQ=255) tAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGt > 2:1734206/1‑193 (MQ=255) tAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGt < 1:1734206/193‑1 (MQ=255) gTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCAGGCGCTAACGTCTCTTTATATGAAGAAGTGTGCGCCAGATATCCGc > 1:2211761/1‑289 (MQ=255) ggTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCAGGCTCTAACGTCTCTTTATATGAAGAAGTGTGCGCCAGATATCCGCa < 1:327064/288‑1 (MQ=255) ggTCGGCTCCACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCAGGCTCTAACGTCTCTTTATATGAAGAAGTGTGCGCCAGATATACGCAg > 1:1208471/1‑289 (MQ=255) cACCGCGGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCt > 2:874501/1‑198 (MQ=255) cgcgGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGCAGGCTCTAACGTCTCTTTATATGAAGAAGTGTGCGCCAGATATCCGCAGGTGGCATTTCAg > 2:891782/1‑289 (MQ=255) cgGTGAAATCACAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACTCGGGCGTTTCACTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCTCGCGCGACGGCACGCTGGc > 1:1554060/1‑226 (MQ=255) ||| CGTCTCCATCAGGGCGATTACGGCAAACAGCGCGATTACGGTAACGACCCGCTGCCGCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTGCACCTGGTGGATCTGACCGGGGCAAAAGATCCGGCTAAACGTCAAATCCCGCTGATTAAAACCCTGGTCGCGGGCGTTAACGTTCCGGTGCAGGTTGGCGGCGGCGTGCGTAGCGAAGAAGATGTGGCGGCGTTACTGGAAGCGGGCGTTGCGCGCGTAGTGGTCGGCTCCACCGCGGTGAAAAGTCAAGATATGGTGAAAGGCT‑GGTTTGAACGCTTCGGTGCCGATGCCTTAGTGCTGGCGCTGGATGTCCGTATTGACGAGCAAGGCAACAAGCAGGTGGCAGTCAGCGGCTGGCAAGAGAACAGCGGCGTTAGTCTGGAACAACTGGTGGAAACCTATCTGCCCGTCGGCCTGAAACA‑TGTGCTGTGTACCGATATCAGCCGCGACGGCACGCTGGCAGGCTCTAACGTCTCTTTATATGAAGAAGTGTGCGCCAGATATCCGCAGGTGGCATTTCAG > CP042583/1718403‑1718960 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |