| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,730,919 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,730,919 | 0 | A | T | 99.3% | 675.8 / NA | 287 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base T (150/135); total (151/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,730,920 | 0 | G | C | 98.6% | 664.0 / NA | 287 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/3); new base C (150/133); total (151/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,730,921 | 0 | C | G | 99.0% | 667.8 / NA | 287 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base G (149/135); total (151/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
GGCATTTTTGATATGGGTACTGAGTGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGAGCCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTAGCATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGAGC‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTACAGTCAGG > CP042583/1730642‑1731198 ||| ttttGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCcgc < 1:415000/289‑1 (MQ=255) ggTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGAtccctc > 2:504147/1‑288 (MQ=255) actgtccgAATCGATCGGCGCTCTGGCACTGGGGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACTCTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATccctccct < 2:2159947/281‑1 (MQ=255) actgtcagAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATccctccct < 2:1742871/281‑1 (MQ=255) actgtcagAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATccctccct < 1:1156377/281‑1 (MQ=255) tcagAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCtgctt > 2:857970/4‑288 (MQ=255) gAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTgatgat > 1:286650/1‑263 (MQ=255) aTCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTTATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCCGTGAACCCTCCCCTCTTGCTAc > 2:1960989/1‑288 (MQ=255) aTCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGAtccctcc < 1:1422225/277‑1 (MQ=255) tCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgc < 2:573196/289‑1 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGCAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCcgcg > 2:746266/1‑289 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGAtccctcc > 1:2163287/1‑272 (MQ=255) cgcTCTGGCACTGGTTCCGCTTGGATTGTTATTTAAACCACACTCTCTGCTGCGCCATCGCAAACCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGcgtac < 2:886760/288‑1 (MQ=255) gcTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGcgtacgt < 2:299418/289‑1 (MQ=255) tctGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTTTCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCGTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGcgta < 1:1052822/284‑1 (MQ=255) tctGGCACGGGTGCCGCTGGTATTGTTATTTATACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGcgtacgta < 2:1517851/288‑1 (MQ=255) aCTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCtgat < 2:1594253/288‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGcc > 1:1610330/1‑289 (MQ=255) gATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTg > 2:580057/1‑289 (MQ=255) ttGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGc < 2:2094421/289‑1 (MQ=255) tGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCt < 1:509025/289‑1 (MQ=255) ccACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGc < 1:1237577/289‑1 (MQ=255) acTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATccctccct > 1:2208489/1‑229 (MQ=255) acTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATccctccct < 2:2208489/229‑1 (MQ=255) acTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGa > 1:571163/1‑288 (MQ=255) tCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGc > 2:204619/1‑269 (MQ=255) tCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGAAGGTGTCG‑CTGAGGATGGCCGCGGATCCCCCCCTCCTTGCTACGCCGCCTACGTACCTGATGAGCCATTGGCGGTGGCTGCCGTTTTTGCTGATCct > 2:557070/1‑288 (MQ=255) ctgctgCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGGTACGCCGCGTACGTACATGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGGTTTTGCTGAACct > 2:911789/1‑287 (MQ=255) tgcGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATTATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTTCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTTGCTACCGGTTTTTCTGATCctgct > 1:908903/1‑286 (MQ=255) tgcGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCtgctgc > 2:818005/1‑288 (MQ=255) cgtCGCAACCTACGTTTTCTTTTTGGGTCGCTGCTCACGTTAGCCTTCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGcc < 2:1619667/286‑1 (MQ=255) cATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGcc < 1:818005/288‑1 (MQ=255) aaCCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAAcatca < 1:1508023/289‑1 (MQ=255) cACGGTTGCTTTTTGCGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGTCGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGACCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCACCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGAc < 1:1991747/289‑1 (MQ=255) tGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCAGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGt > 1:366950/1‑289 (MQ=255) cTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGCGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGAGCCTGCTGCCCCCCAACATCCTGACCATGGGGa > 2:1285126/1‑289 (MQ=255) cTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGa > 1:1710540/1‑289 (MQ=255) ttgagtcgcTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTa < 1:2172607/281‑1 (MQ=255) agtcgcTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATg > 1:205385/6‑288 (MQ=255) aGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGtttt < 2:1930982/227‑1 (MQ=255) aGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGAc < 2:519935/258‑1 (MQ=255) aGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTTCGGAACg > 1:2249263/1‑288 (MQ=255) aGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCCACCGTTTTTGCTGATCCTGCCTCCCGCCAACCTCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGGACgg > 2:1047479/1‑288 (MQ=255) acacTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCtgat > 2:2055438/1‑194 (MQ=255) acacTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAAcaca > 1:664156/1‑289 (MQ=255) aCGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGGCTTTCGTGCGGAACGc < 1:854607/276‑1 (MQ=255) aaGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGAcc > 1:546874/1‑241 (MQ=255) cgttcgaTGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGGGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAAcc < 1:1896155/282‑1 (MQ=255) cgaTGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAATATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGACGGCAAACACCTTTCCGCAAGCGAAACCAACtt > 2:1092097/3‑289 (MQ=255) tATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgcc > 2:232991/1‑149 (MQ=255) gCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCa < 2:771717/206‑1 (MQ=255) gCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATg < 1:746266/289‑1 (MQ=255) cGTGGCCTTTGACTTTGATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGCTGATGGT‑AGCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACCCCGCGTACGTACCTGATGTGACATATGCCGTGGCTACCGTCTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCATCATCATTACCTTTGTCATGTATGCCTTTCGTGCGGAACTCAAACACATTTCTGACAGCGAAACACACATGCGTAACGCGCTgta > 2:359249/1‑287 (MQ=255) gTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGaa < 2:1153361/289‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCgtacgtac < 2:1058235/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGa > 1:684152/1‑186 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGcc < 2:660163/200‑1 (MQ=255) ttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTTCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCg > 2:630314/1‑288 (MQ=255) ttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCg > 1:1126481/1‑288 (MQ=255) aCTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTa < 1:755666/289‑1 (MQ=255) cTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTAt < 2:149908/289‑1 (MQ=255) cATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGt < 1:993954/289‑1 (MQ=255) attattGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa < 1:580057/289‑1 (MQ=255) attattGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa < 1:1345533/289‑1 (MQ=255) attattGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTACTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa < 1:967570/289‑1 (MQ=255) attattGTGCTGTTGATGGGGAGCGCCGGGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa < 1:1765457/289‑1 (MQ=255) atgtttGGGCTGTTGCTGTGGAGTGCGGGGGGTTTGCGACGAAGGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGAGGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa < 2:1407348/285‑1 (MQ=255) tGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACAGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGt > 1:1873422/1‑289 (MQ=255) ttGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTTGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAATCGAAACCCACTTTCGGAACCCGATGGACAATTCCTCTAACGGTATGGCGTTAGTgg > 2:1802722/1‑289 (MQ=255) ggAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCg < 1:202857/288‑1 (MQ=255) gAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCg < 1:404512/274‑1 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAggg > 1:1033263/1‑289 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAggg > 1:175312/1‑289 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAggg > 1:717631/1‑289 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAggg > 1:478628/1‑289 (MQ=255) tGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCTCTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATg > 1:1541385/1‑289 (MQ=255) tGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCg < 1:1838127/266‑1 (MQ=255) tGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATg > 1:2123783/1‑289 (MQ=255) tGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATg > 1:317833/1‑289 (MQ=255) tGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAAAGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATg > 2:445037/1‑289 (MQ=255) tGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTACTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATg > 2:1458807/1‑289 (MQ=255) tGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCa < 2:276890/289‑1 (MQ=255) ggCCAGGAATGTAAGCCTTTTTGACTTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCa < 2:411580/288‑1 (MQ=255) ctgggtgCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGGGTCG‑CGGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGACGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACcaaca < 2:963362/283‑1 (MQ=255) tGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa > 1:933138/1‑246 (MQ=255) aGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAgcg < 2:1876584/289‑1 (MQ=255) tttttGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCGATCGGTATGGCGTTAGTCGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGctc > 1:781706/1‑288 (MQ=255) cTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGttt < 1:1069558/289‑1 (MQ=255) ccTTACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTggg > 2:2125997/1‑240 (MQ=255) tACCACGGTTATGTTGGTGTCG‑CGGGTGATGGCCGCGGATCCCTCCCGGCTTGTTACACCTCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTTGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCACGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGTCGTTCGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCggg < 2:1762196/289‑1 (MQ=255) tACCACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCggg < 1:1940649/289‑1 (MQ=255) ccACGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTa < 1:630314/289‑1 (MQ=255) ccACGGGGATGATGGGGTCG‑CTGATGAGGGCCGCGGTTCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTa < 2:807798/289‑1 (MQ=255) cGGTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTACAg > 2:84155/1‑289 (MQ=255) ggTGATGATGGTGTGG‑CGGATGGTGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTCCGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTACAg < 2:717631/288‑1 (MQ=255) ggTGATGATGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa < 1:867929/218‑1 (MQ=255) tgatgaTGGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAAt > 1:837921/1‑243 (MQ=255) atgatgGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTTGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCCACAAAGCGACCGGCCAGTTTCTCGCGTCCAGTCAgg > 2:385863/1‑289 (MQ=255) atgatgGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTACAGTCAgg > 1:1282046/1‑289 (MQ=255) atgatgGTGTCG‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCCCGGGTACACGCAgg > 2:830288/1‑289 (MQ=255) ||| GGCATTTTTGATATGGGTACTGAGTGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGAGCCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTAGCATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGAGC‑CTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTACAGTCAGG > CP042583/1730642‑1731198 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |