| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,763,507 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,763,507 | 0 | A | T | 100.0% | 754.9 / NA | 314 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (164/150); total (164/150) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,763,508 | 0 | C | G | 100.0% | 754.0 / NA | 314 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (164/150); total (164/150) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,763,509 | 0 | T | A | 99.0% | 746.0 / NA | 314 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (163/148); minor base C (1/2); total (164/150) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
TATAACATGCCGCATAGCTCACAGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCAACTAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACGCTTGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAAACTTTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGGCTCACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTGGCGCATTCATCACAGCAAA > CP042583/1763227‑1763782 ||| cGCATAGCTCACAGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCtt > 1:1495812/1‑289 (MQ=255) cGCATAGCTCACAGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCtt > 1:2020010/1‑289 (MQ=255) cGCATAGCTCACAGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCtt > 1:838765/1‑289 (MQ=255) cGCATAGCTCACAGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCtt > 2:456422/1‑289 (MQ=255) cATAGCTCACAGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTa > 1:1118827/1‑288 (MQ=255) tAGCTCACAGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACg < 2:164995/289‑1 (MQ=255) tAGCTCACAGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACg < 1:557790/289‑1 (MQ=255) aGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTtata > 2:1179615/1‑289 (MQ=255) tAACCATCGTCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCa > 2:373228/1‑289 (MQ=255) tAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAAcc > 1:1766751/1‑288 (MQ=255) tAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCa > 1:1229746/1‑289 (MQ=255) tAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCa > 2:1414873/1‑289 (MQ=255) tAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTACCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCa > 2:841821/1‑289 (MQ=255) catcatcatTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGc < 1:476646/289‑1 (MQ=255) catcatcatTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGc < 1:1336546/289‑1 (MQ=255) catcatTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCtt > 1:922773/1‑288 (MQ=255) tcatTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTgcg < 2:1122664/289‑1 (MQ=255) aaTAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTAt < 2:1865159/289‑1 (MQ=255) aTAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGc > 2:1379015/1‑272 (MQ=255) aTAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATc > 1:1917115/1‑289 (MQ=255) cATTATGAGAATTTCCAAAGAACCACCTGACTATTACAGGCAAATATAATTTCTACTTTCTTCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTTCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCaaaa < 2:1759643/289‑1 (MQ=255) aTTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAAt > 1:1244168/1‑289 (MQ=255) tATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTa < 2:577568/289‑1 (MQ=255) tGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGCAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGTTGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAAACAAACTCTCATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCTTGTCTTTAGCTGATCCGTATCTAAATTAAc > 2:1901423/1‑289 (MQ=255) tGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGc > 2:212135/1‑247 (MQ=255) tGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATc < 2:1522559/274‑1 (MQ=255) tGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTaa > 2:630988/1‑288 (MQ=255) tGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTa > 1:1560769/1‑287 (MQ=255) tGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTa < 2:1560769/287‑1 (MQ=255) tGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAAc < 1:105333/289‑1 (MQ=255) tGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAAc < 2:32369/289‑1 (MQ=255) tGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAAc < 2:916716/289‑1 (MQ=255) accatcTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAAccgcgc < 2:1112991/287‑1 (MQ=255) ccaccTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACg < 2:20965/229‑1 (MQ=255) ccTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTtat > 1:409195/1‑233 (MQ=255) ccTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGAt > 1:366267/1‑289 (MQ=255) ccTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTACGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAGTATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGGGCTGTTCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCCGTCCGCGAt > 1:880757/1‑289 (MQ=255) ccTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATAAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACACAGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGTCTTCTGCTGACCGGTATCAAAATTAATCAGTAAAAccgcgccgcgca > 2:1834812/1‑287 (MQ=255) ttACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGggcg > 1:1969659/1‑289 (MQ=255) gCAAATATAATTTCTACTTTCATTAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTa < 2:1243854/253‑1 (MQ=255) gCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGTCGGTACTTCATTGGTGCGCATAAATCACTGACTTCCCTGGCCCACAACCCAAATATTATGACCATGGATATCATTAATTTCATAACCAAACGTTACTGATTGCCCATCTGCCCTTAACGCTTTTTTAAACCCAGCCGTGCGTTGATCGGTATCAAAATTAACCATTACAACCGCGCCGCGTAAAGGTGCGGAAAtt > 2:1201492/1‑289 (MQ=255) gCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAGCGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAAtt > 1:1651057/1‑289 (MQ=255) gCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGc > 1:2104500/1‑213 (MQ=255) tttCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCCAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTg > 2:1579536/1‑288 (MQ=255) aCTTTCCTCAATCTTTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCCTATCAATTGCCACATTAACTGATGGCGGTACTTCATCGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGTCCGACAACGCCAATATTATGACCATGCCTATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGCTTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAATCATGGCTTCCGCTCATCGGTATCAACATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTCACTGGTGCCACGt > 2:522222/1‑289 (MQ=255) atcaATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTa < 1:1162779/232‑1 (MQ=255) caATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCACTTGCACCATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGc < 2:2195767/289‑1 (MQ=255) ttACCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCGGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTa > 2:1073188/1‑288 (MQ=255) aCCGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATc > 1:1547478/1‑288 (MQ=255) cGAAGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCTTGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCt < 2:1324852/289‑1 (MQ=255) aaGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTAt < 2:1814815/283‑1 (MQ=255) aGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCttt > 1:658138/1‑288 (MQ=255) aGGTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCttt < 1:255258/288‑1 (MQ=255) gTGATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTgcg < 1:2146045/194‑1 (MQ=255) gATTGTGCATGAAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTgcga < 2:214479/288‑4 (MQ=255) atgaaaGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCa > 1:800860/5‑288 (MQ=255) tgaaaGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAg > 1:1069105/4‑288 (MQ=255) tgaaaGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGc > 2:1222769/4‑289 (MQ=255) tCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACg < 1:1183471/155‑1 (MQ=255) tCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTAt > 1:1578470/1‑188 (MQ=255) gttgCTTATCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGc > 1:1134842/1‑278 (MQ=255) aTCAATTGCCACATTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAg > 2:1067754/1‑270 (MQ=255) acaTTAACCGATGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCa > 2:1955121/1‑289 (MQ=255) attaaccgatGGCGGTACTTCATTGTGGCGAATAAATACCTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCAtt < 2:810909/280‑1 (MQ=255) attaaccgatGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCAtt < 1:630988/280‑1 (MQ=255) accgatGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTCGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCcg > 1:1744156/6‑288 (MQ=255) tGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTTACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCCTGCGCTGATCGGTATCAAAAGTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGta < 1:1220305/288‑1 (MQ=255) tGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCcgtcgtct > 1:1697415/1‑287 (MQ=255) ttCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTGATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACt < 1:1387336/289‑1 (MQ=255) ttGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTGTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCAt > 1:1292174/1‑289 (MQ=255) tGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATCGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCAtt < 2:881791/289‑1 (MQ=255) gTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTgcga > 1:1092169/1‑221 (MQ=255) gCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATACCCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCCCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTCCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGACTTTCCCGAAAAGGTGTCATTCcgtcggtta > 2:690949/1‑268 (MQ=255) gCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATcac > 1:1593629/1‑276 (MQ=255) ccTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCCCCACCCCATTAAGGTTTGTTGTTCGATAttttt > 2:1702618/1‑288 (MQ=255) ccTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATAttttt > 1:143686/1‑288 (MQ=255) cTGGCCGCAAACGCCAATATTATGCCCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTACTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGc < 2:1611322/289‑1 (MQ=255) cGACAACGCCAATATTATGTCCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCAtt < 1:1007088/289‑1 (MQ=255) cGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCAt < 2:143686/288‑1 (MQ=255) cAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCcg < 1:304822/236‑1 (MQ=255) ccAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATcac > 2:2257617/1‑242 (MQ=255) cAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGc < 2:2187042/289‑1 (MQ=255) aatccATGTATATCATTGACTTCATAACCATACGTTAATGCTTGCCCCTTTGCTCTTAACCTTTTTATAAACCATGGCTTTCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCCGTACACCCTAGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCAATCGCTTTGCGACACATCCATCATCAGGTGATTTTCCCGATAATGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCAGTACGGTTTGTTGGGCGATATTTTTGCTCATTGACATAAGCATCttt < 2:292841/284‑1 (MQ=255) tGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAg > 1:2124337/1‑188 (MQ=255) tGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCAt < 2:203278/265‑1 (MQ=255) tGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCAt > 1:203278/1‑265 (MQ=255) tGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTg < 1:1728195/289‑1 (MQ=255) tGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTg < 2:1160371/289‑1 (MQ=255) tGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTg > 1:1413499/1‑289 (MQ=255) ggATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTg > 1:2236967/1‑288 (MQ=255) atatCATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTGgc < 1:982950/288‑1 (MQ=255) cATTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATcac < 2:485348/220‑1 (MQ=255) aTTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTTCGTCCTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGTTATTTTTGCCCTTTGACATAAGCCACTTTAATTCCTGGCGCAtt > 2:1031602/1‑288 (MQ=255) aTTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCcgtcg > 1:1833450/1‑211 (MQ=255) aTTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTACATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTGgc > 1:292841/1‑283 (MQ=255) aTTGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGCATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCTCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCa > 1:507723/1‑256 (MQ=255) tGACTTCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTGGCGCATtca > 1:529972/1‑288 (MQ=255) ttCATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTGGCGCATTCATcaca > 1:1857954/1‑289 (MQ=255) cATAACCAAACGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGCCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTTCGATATTTTTGCCCATTTACATAAGCATCTTTAATTCCTGGCCCATTAATCACAGc > 2:267396/1‑289 (MQ=255) aaCGTTAATGATTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGCGACACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGc < 1:1616124/251‑1 (MQ=255) ||| TATAACATGCCGCATAGCTCACAGGCATAACCATCATCATTAATATAAATAGCATTATGCGAATTTCCATAGAACCACCTGACTATTACTGGCAAATATAATTTCTACTTTCATCAATCTCTTTACCGAAGGTGATTGTGCAACTAAGTCCTTGTTGCTTATCAATTGCCACATTAACGCTTGGCGGTACTTCATTGGTGCGAATAAATAACTGACTTCCCTGGCCGACAACGCCAATATTATGACCATGGATATCATTGACTTCATAACCAAACGTTAAACTTTGCCCATCTGCTCTTAACGCTTTTATAAACCATGGCTTGCGCTGATCGGTATCAAAATTAACCAGTACAACCGCGCCGCGATAAGGGGCGGCAATTTTCCGGTTGCCACGTAATTCTGCTTCGCTATCGCTTTGGCTCACATCCAGCATCAGGTGATTTTCCCGATAAGGTGTCATTCCGTCGTATATCACCACTCCATTACGGTTTGTTGTGCGATATTTTTGCCCATTGACATAAGCATCTTTAATTCCTGGCGCATTCATCACAGCAAA > CP042583/1763227‑1763782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |