Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 517,873 | 0 | C | G | 99.7% | 719.9 / NA | 303 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (162/138); total (163/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 517,874 | 0 | T | A | 99.3% | 715.5 / ‑6.6 | 303 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (162/139); minor base G (1/1); total (163/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
ACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAAACTGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATGCTGATCTGAATTTCAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTCCGCCAGC > CP042583/517597‑518147 ||| aGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCGAGATCTGAATTTCAGTCa > 1:1027975/1‑289 (MQ=255) 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