Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,814,221 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | CP042583 | 1,814,221 | 0 | A | T | 99.6% | 603.5 / NA | 250 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,814,222 | 0 | C | G | 100.0% | 598.2 / NA | 250 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (119/131); total (119/131) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,814,223 | 0 | T | A | 99.6% | 596.3 / NA | 250 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (119/130); minor base C (0/1); total (119/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
AACTCCTGGTGTACCATGCTAATACCATTTTCCAGGGCTTCTTTTGCAGAATGGAAATCGATCTCTTTACCCTGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTGCTTTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTACTGCTGACCATATAATTTTACCTTGTTGGCCATACAATAAGGGCGCAGTAATAGACTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGC > CP042583/1813943‑1814500 ||| aaCTCCTGGTGTACCATCGAAATACCATTTTCCAGGGCTTCTTTTGCAGAATGGAAATCTATCTCTTTACCCTGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAATGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCa > 1:472058/1‑289 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |