Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,850,285 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,850,285 | 0 | A | T | 99.3% | 631.6 / NA | 273 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base T (145/125); total (148/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,850,286 | 0 | G | C | 99.3% | 631.9 / NA | 273 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (147/123); total (148/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.10e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,850,287 | 0 | C | G | 98.9% | 631.3 / NA | 273 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base G (147/122); minor base T (0/3); total (148/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.58e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
CATGTTTTTTACCGGCAGCCTGCTGATTGAGGTGATGTTTAGTCTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCAGCCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGAGCCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGAGCTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCG‑AAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACGGCTGGGTACTGTGGGCACCGATT‑CGCTTTGGTGCTACCAGTATCAACTTTGCTACCAATAAGCCCTTCCCTTCTCCAC > CP042583/1850009‑1850564 ||| cATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGAttt > 1:447507/1‑289 (MQ=255) accggctcgctgctgAGTGAGGTGATGTTTTCACTCAACGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGGACCTTGTTTATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGCATATTGTCAGTTATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGTACCGTCATGTCGCGACTCAGCCCCTGCAATCCGTCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCTTCGCGTCTACTGGTCGGTATTGATTTTCTTCGCCtt > 2:1244672/10‑289 (MQ=255) ccggctcgctgctgATTGAGGTGATGTGTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACGGGGCTACGAAGCGACCGGCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTg < 1:2186524/281‑1 (MQ=255) gctcgctgctgATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTAGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCCCGGCCACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTgtgt > 2:792028/6‑287 (MQ=255) aTTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGttt < 2:434768/289‑1 (MQ=255) ttGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCATCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGttt < 2:399856/288‑1 (MQ=255) tGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTtgt > 1:869352/1‑289 (MQ=255) gAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTtgtg > 2:311945/1‑289 (MQ=255) atgttttcactcAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGAGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTg < 1:725545/279‑1 (MQ=255) tgttttcactcAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGTCTCCTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCATGTTTTGTTTGAGTTTGTGTTTTGa > 1:1437493/9‑288 (MQ=255) aTGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTTAACTTATCGCCacc > 1:1762671/1‑287 (MQ=255) aTGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGaa > 1:1431602/1‑277 (MQ=255) gggCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTCTGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGTGTTTGGGTTCTGAACTTATCGCCAACGATaac > 2:27908/1‑287 (MQ=255) gCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACGGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTTAACTTATCGCTCACGATAAACCg > 1:1790695/1‑289 (MQ=255) aCTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGtt > 1:498736/1‑287 (MQ=255) cTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGt > 2:2244639/1‑235 (MQ=255) aGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATg > 2:1307685/1‑289 (MQ=255) cGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGc > 1:1317118/1‑258 (MQ=255) cGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACGCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGCTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAATCCGTTGCTGGTTCTTTGTGAc > 2:2152138/1‑289 (MQ=255) ccgtctcgcgcgATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACgg < 1:2137032/280‑1 (MQ=255) tctcgcgcgATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGt < 2:1765937/284‑1 (MQ=255) ctcgcgcgATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGtt < 1:311945/285‑1 (MQ=255) ttATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTTCGTTATTACGGCGGTTGGTTTTTc > 2:1124654/1‑288 (MQ=255) tAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTg > 1:1603816/1‑289 (MQ=255) aaTGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTg < 1:194074/288‑1 (MQ=255) tttGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTTAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGTGTTATTACGGGCGTTGGTCTTTCCCGTTATTTaaaaa > 2:785495/1‑289 (MQ=255) tttGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTTTTGaaaaa > 1:1098932/1‑289 (MQ=255) tttGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGaaaa > 1:687993/1‑288 (MQ=255) tGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACt > 2:1941440/1‑289 (MQ=255) tGTATCTTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCGGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGAATCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGCCGCGGCTACTGGACGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGGGTTGGTGTTCTCAGCTTATCGCCTACGATAAAGCGTTGCTCTTGCTTTTTTACCGCAGTGGGTATTCCCCGTAATTGAAAAACTACAGCG‑aa > 2:873470/1‑289 (MQ=255) tGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGTTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTACCGTTATTGAAAAACTACAGCG‑aa > 1:1022372/1‑289 (MQ=255) tGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCG‑aa > 2:1360551/1‑289 (MQ=255) gTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCG‑aaa < 1:1694331/289‑1 (MQ=255) tatTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCG‑AAAGCg > 1:375817/1‑289 (MQ=255) 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tCGCGGCTACTGGTCGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCG‑AAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTCGCTGAAACAAAGGCTGGAAAATAACGGCTGGGTACTGTGGGCACCGATT‑CGCTTTGGTGCTCCCAGTACCCACCTTGCTACCATAATGTccatcccttc > 2:1695854/1‑288 (MQ=255) cgGCTACTGGACGTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGGTATTGATAAACTACAGCG‑AAAGCGATTTTGGCTGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACGGATGGGTACTGTGGGCAGCGATT‑CGCTTTGGTACTACCAGTAACAACCTTGCTACCAATAAGCCCTTCCCTTCAcc > 1:224355/1‑288 (MQ=255) ||| CATGTTTTTTACCGGCAGCCTGCTGATTGAGGTGATGTTTAGTCTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCAGCCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGAGCCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGAGCTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCG‑AAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACGGCTGGGTACTGTGGGCACCGATT‑CGCTTTGGTGCTACCAGTATCAACTTTGCTACCAATAAGCCCTTCCCTTCTCCAC > CP042583/1850009‑1850564 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |