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Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
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cGGCGCGAGTTCCGGTCATATTCGAGCGGCTGTCGCCCTGGTTATCGCTGTAGCCACCAACAATCCCAAGCATCCACTCGCCATCCGTGCCCCAGCGCCCGCTAAACAGATCGCCGCTAAGTTGCACCGTAGAAGTGTCTTCATGTTGAGCCAGTTGCCCCGCTGCTGTGTAATGATAATCTCCGCCGATAACACGTAAATTCAGCGTCTGACCATCGCCACCTGCGTGATCGCGTCG‑CTCCATCATAAACGCCTGATTTGCCGCCCGCAGGTTATTAAGATAACCGcc > 1:1189793/1‑289 (MQ=255) tCCGTTCATATTAGCGCGGCTTTCGCCCTGGTTATCGCTGACGCCACCAACAACCCCAAGCATCCACTCGCCATCCGTGCCCCAGCGCCCGCTAAACAGATCGCCGCTAAGTTGCACCGTAGAAGTGTCTTCATGTTGAGCCAGTTGCCCCGCTGCTGTGTAATGATAATCTCCGCCGATAACACGTAAATTCAGCGTCTGACCATCGCCACCTGCGTGATCGCGTCG‑CTCCATCATAAACGCCTGATTTGCCGCCCGCAGGTTATTAAGATAACCGCCAACTTTGGCa < 2:2085449/289‑1 (MQ=255) ggTCATATTCGAGCGGCTGTCGCCCTGGTTATCGCTGTAGCCACCAACAATCCCAAGCATCCACTCGCCATCCGTGCCCCAGCGCCCGCTAAACAGATCGCCGCTAAGTTGCACCGTAGAAGTGTCTTCATGTTGAGCCAGTTGCCCCg < 1:1928061/149‑1 (MQ=255) ||| GCACGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACTGATACCCCGCCTCCAGGCTGGCGATAAT‑CCCGCTGCTGTGGTAATGATCTGTGCCATCTTCTTGTTCGGAAACATCATTGCTAAACCACGCGTATTGCAGCCAGCTATCCAGCCAGGCCCCTTGCTTCTGATTACCGTGCTGAAACCAGCTACTTGTCAGCCCAACGGCATAACCGTGGTTCTGGTTATCGGCGCGAGTTCCGGTCATATTGCTGCGGCTGTCGCCCTGGTTATCGCTGTAGCCACCAACAATCCCAAGCATCCACTCGCCATCCGTGCCCCAGCGCCCGCTAAACAGATCGCCGCTAAGTTGCACCGTAGAAGTGTCTTCATGTTGAGCCAGTTGCCCCGCTGCTGTGTAATGATAATCTCCGCCGATAACACGTAAATTCAGCGTCTGACCATCGCCACCTGCGTGATCGCGTCG‑CTCCATCATAAACGCCTGATTTGCCGCCCGCAGGTTATTAAGATAACCGCCAACTTTGGCATT > CP042583/1912014‑1912566 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |