Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,924,599 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,924,599 | 0 | A | T | 99.3% | 663.9 / NA | 282 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (122/157); minor base C (2/0); total (124/158) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.94e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,924,600 | 0 | G | C | 100.0% | 670.9 / NA | 282 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (124/158); total (124/158) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,924,601 | 0 | C | G | 99.7% | 666.1 / NA | 282 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (123/158); total (124/158) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
GCGCGGTGAAAGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGAAGCCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTAGCCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGATGACGACCCGAG > CP042583/1924321‑1924879 ||| tGAAAGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCCCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATCTGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCCGTGCCGCTCATgca > 2:2158298/1‑287 (MQ=255) aaGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCa < 2:1275908/289‑1 (MQ=255) aaGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCa < 2:2092840/289‑1 (MQ=255) ccGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCa < 2:1540338/289‑1 (MQ=255) tGGGACCGTTGGTCCATTTCGTCTGACCGCAGCAACCATGCTGGATGCCAAAGAACAGGGTGGCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAAc < 2:1856700/289‑1 (MQ=255) tGGAACCGTTGATCCATTGCGTCTGACCGCAGCAAACAGGCTGAATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAGGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAAc < 2:102657/289‑1 (MQ=255) cGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCAt < 1:216784/289‑1 (MQ=255) gTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCAtg < 2:818388/289‑1 (MQ=255) ttGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCAtgt > 2:179133/1‑289 (MQ=255) tttCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAAcc > 1:443255/1‑289 (MQ=255) tttCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAAcc > 1:190225/1‑289 (MQ=255) ttCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCg < 1:179133/289‑1 (MQ=255) tCGTCTGACCGAAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGc < 1:56605/289‑1 (MQ=255) cGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGACCACGGTGCCGTGATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGAGCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCt < 2:778754/289‑1 (MQ=255) ccGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCCCCGCATTAAACAACCTGGGAATAACCGCCGCCGTaa > 2:1198547/1‑289 (MQ=255) aaccATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGTCGTTATCCCTACCGCTCATGAAGTTACGGTGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGTGGAAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTcc < 1:1005843/286‑1 (MQ=255) acaaggtGGAGGTCACAGAAAACGGGGGCGGAATCCTTGCCGCTCATGAAGTCGCGGGGCTGGTTCGGGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCACCTCACCGGGGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGa < 2:1296129/283‑1 (MQ=255) aCATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGa < 1:741719/289‑1 (MQ=255) aTGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGa < 1:180376/287‑1 (MQ=255) ggATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATTTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCAt > 2:1611594/1‑243 (MQ=255) ggATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTACCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGat > 1:527720/1‑289 (MQ=255) ccAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGCAGGCGCGCCGGCGTGCGGTGTTCGTGTACGTAGCCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTTATGCCGCTGAGCTCTGGGGGCAACACATTGCCGTCTATGCCGATCTGCGCACTCGCATGTTCCGGGCCAATGGACCGCTGCTCATCATGGAACACCGCATTAACCAACATTGGATCAACCGATGCCGTAAACCTTCCGACCCGGatat > 2:272382/1‑286 (MQ=255) aGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTg < 2:1448304/289‑1 (MQ=255) aaCACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTACGACGCCGATATTCTggcg > 1:1956926/1‑285 (MQ=255) acGGTGCCGTTATCCTTACGAGTCATGAAGTCACGGGGCTGTTTCGTGAAGGAGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTgg < 2:1098516/289‑1 (MQ=255) ggTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCg > 1:793153/1‑289 (MQ=255) tGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCTCTGCCGTAAACCATCCGACGCCGATATTCGGGTCCCTGGCGAt > 2:1487997/1‑289 (MQ=255) tGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGAt > 1:2134009/1‑289 (MQ=255) gTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCa < 2:527418/289‑1 (MQ=255) ccTTACCGTTCAGGAAGTGCCGGGGCCGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGGTCGGTGTTCGTGTACGGAAACATCGAACCGGGGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcg < 2:405971/289‑4 (MQ=255) ccTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcg < 1:884876/289‑4 (MQ=255) ccGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGAGCCTGGCGATACCAtttcgctgat < 2:2114594/289‑9 (MQ=255) acGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcgctgat > 1:1276041/2‑281 (MQ=255) cGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcg > 1:225993/1‑280 (MQ=255) cGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcg < 2:225993/283‑4 (MQ=255) cTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTgg > 2:1724617/1‑289 (MQ=255) cTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTgg > 2:2032523/1‑289 (MQ=255) tCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGt > 1:1880731/1‑289 (MQ=255) aTGAGGTCACGGGGCTGATTCGGGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTac < 1:296538/289‑1 (MQ=255) aTGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTa > 2:63579/1‑234 (MQ=255) aTGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTac < 1:1198547/289‑1 (MQ=255) aTGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTac < 1:1154223/289‑1 (MQ=255) tgaggcaaCGGGGCGGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTGGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTAAGGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATGTGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTac < 2:1392770/281‑1 (MQ=255) gTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGc < 1:161665/242‑1 (MQ=255) gTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcgctg < 1:2069909/276‑7 (MQ=255) cACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACctct > 2:506171/1‑289 (MQ=255) aCGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAAcc > 2:379434/1‑202 (MQ=255) aCGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCtt > 1:670900/1‑289 (MQ=255) ggggCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcg < 2:92060/268‑4 (MQ=255) ggCTGATTCGTGAGGGCGCGAGGGTGAGGGGGGTTCGTGACCGTAACCATCTCACCGGCGACACTCAGGCCCGTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAAGACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTAc < 2:1695098/288‑1 (MQ=255) gATTCGTGAAGGCACGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTAtt > 1:1331722/1‑289 (MQ=255) tGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTCATTGGTACCACCTTCTTACGGATTGATTAc > 2:1149426/1‑289 (MQ=255) aGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACaa < 1:1023026/288‑1 (MQ=255) gcgACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACgaga < 2:670900/289‑1 (MQ=255) ggTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAAt < 2:1921061/288‑1 (MQ=255) ttCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCa < 2:5656/228‑1 (MQ=255) ttCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGCGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCAGATTGGTACCACCCATTTACGTATttatta > 2:293404/1‑265 (MQ=255) tCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCCCCCCTTTACGTATTGATTACAACCAGCTTGACGATAATcaggtg > 2:37307/1‑284 (MQ=255) tCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGt < 1:37307/288‑1 (MQ=255) gtgtACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGAc < 1:1487997/289‑1 (MQ=255) gtgtACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGAc > 1:2213921/1‑289 (MQ=255) gtACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGCGCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAAACGCTGCCGTCAACCTTCCGACGCCGATAATCTGGTGCCTGGCGCTACCATTTCGCTGCTTGGTCCCACCTCTTTATGTATTGATTACACCGAGATTGACGATAATCGAGTGACgg > 2:145582/1‑289 (MQ=255) cGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCag < 1:1836516/289‑1 (MQ=255) caCCAACTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCagaa < 2:1197400/287‑1 (MQ=255) atctacccGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCCCCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGt < 2:443255/283‑1 (MQ=255) aTCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTAc < 1:156906/240‑1 (MQ=255) aTCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGt < 1:506171/289‑1 (MQ=255) tctcACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATCTTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTTATTACAACCAGATTGACGATACTCGAGTCACGGCTGAAGAGGtt > 2:1421367/1‑289 (MQ=255) ctcACCCGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGTGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTg < 2:2219792/289‑1 (MQ=255) aCCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGata > 1:2030350/1‑289 (MQ=255) gAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTctg < 2:1969603/288‑1 (MQ=255) cTTCATGCACCTGTAGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAgggg < 2:1763124/289‑1 (MQ=255) tGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGTGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACt > 2:261661/1‑285 (MQ=255) tGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGTGGTTGATATTCTGCTGTGTGAAGGGGAAAAACTGGc > 2:711248/1‑288 (MQ=255) tGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAgggg < 1:1372358/278‑1 (MQ=255) tGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACt < 1:261661/285‑1 (MQ=255) gTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCg < 1:271339/131‑1 (MQ=255) tCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAAc < 2:1712641/113‑1 (MQ=255) tCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAAc > 1:1712641/1‑113 (MQ=255) tCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATAtt > 1:1114211/1‑260 (MQ=255) gTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGa > 2:1647804/1‑289 (MQ=255) tCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCa < 1:874598/288‑1 (MQ=255) tCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCa < 1:1724617/288‑1 (MQ=255) ggggCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGata > 2:1346321/1‑233 (MQ=255) ggggCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCAtttt > 1:1931194/1‑288 (MQ=255) gggCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTg < 1:1527174/288‑1 (MQ=255) gggCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTg < 2:1805820/288‑1 (MQ=255) gggAAACGCATTGCCGAATTTGCCGTTCTGCGCATTTGCATGGTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCTGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCCTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGAATACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTg < 2:2068458/288‑1 (MQ=255) cAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCCGAAGAGGTTGATATTTTGCTGCGTGAAGGGGAAAAAATGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCCCATTTGTCggg > 2:1743640/1‑289 (MQ=255) cAACACATTGCCGAAGACGCCGATCTGCGCAGTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCgg < 2:1880731/288‑1 (MQ=255) aaCACATTGCCGAATATGCCGCTCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTTGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGc < 2:879923/289‑1 (MQ=255) aaCACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGc < 2:1518197/289‑1 (MQ=255) aTTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCgg < 1:1463308/282‑1 (MQ=255) gCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGCAAACGCGTATTTTGCGGGCCTATCCTGGCGTgcgc > 2:1560088/1‑288 (MQ=255) tCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGt < 1:1557144/201‑1 (MQ=255) gcATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTg < 1:1647804/288‑1 (MQ=255) ttCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAg < 1:1299142/289‑1 (MQ=255) aTGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGAt < 1:2044027/288‑1 (MQ=255) cGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGATGACGACCCGa > 1:1773448/1‑288 (MQ=255) gAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGATGACGACCCGAg < 1:987705/288‑1 (MQ=255) ||| GCGCGGTGAAAGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGAAGCCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTAGCCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGATGACGACCCGAG > CP042583/1924321‑1924879 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |