Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,928,544 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,928,544 | 0 | A | T | 99.6% | 651.9 / NA | 276 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (134/141); total (134/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,928,545 | 0 | G | C | 99.3% | 645.9 / NA | 276 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (132/141); minor base T (1/1); total (134/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,928,546 | 0 | C | G | 99.6% | 647.3 / NA | 276 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (133/142); total (134/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
ACTGCGCAAGCTTTGCAACCTGCAAACCTTACGCCTGGAACCCACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACAGCGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCAGCCCTTACCCGTACAGTCTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGA > CP042583/1928267‑1928824 ||| aCTGCGCAAGCTTTGCAACCTGCAAACCTTACGCCTGGAACCCACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCg < 1:291998/289‑1 (MQ=255) tGCGCAAGCTTTGCAACCTGCAAACCTTACGCCTGGAACCCACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGCGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGt > 1:621445/1‑288 (MQ=255) gcgcAAGCTTTGCAACCTGCAAACCTTACGCCTGGAACCCACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTAc < 2:1980191/289‑1 (MQ=255) tttGCAACCTGCAAACCTTACGCCTGGAACCCACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTActcactcaa < 2:1684139/289‑9 (MQ=255) tGCAAACCTTACGCCTGGAACCCACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGa > 1:66468/1‑289 (MQ=255) tGCAAACCTTACGCCTGGAACCCACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACCCAACTGGCTGGa > 1:104412/1‑289 (MQ=255) gAACCCACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTTCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTCTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCCCTCAACTCGCCGGATGAGTTTGACGCTCCGc > 2:149841/1‑289 (MQ=255) cACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACtt > 1:737743/1‑289 (MQ=255) aCTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCCCTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCACCtt > 2:1293434/1‑288 (MQ=255) cTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGc < 1:2107004/289‑1 (MQ=255) aGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGGTTTGTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGGCGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGccc < 2:1564839/289‑1 (MQ=255) ttttATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTGGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTCATCACCCAACTGGCTGGCTGGGTTTGACGATCCgaacctcacccg > 2:1900971/1‑277 (MQ=255) tttATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCgg < 1:237361/288‑1 (MQ=255) gcTTACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCtttt < 1:960520/288‑1 (MQ=255) ttACTACTCGGATGTTTTGTGGTCCGTAGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTg < 2:105275/289‑1 (MQ=255) tactactcggATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGCTGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCCGCCGTTGTACACCGCACATTTTCTGt > 2:1387322/10‑289 (MQ=255) tcgccggttGTTTTGGAGTCCGTGGAAACCGGCGAAGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATAAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTtgg < 2:11783/281‑1 (MQ=255) tactcggATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTtgg < 1:426112/283‑1 (MQ=255) ctcggATGTTTTGGGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTtggtg < 2:406070/285‑1 (MQ=255) gATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCgg < 1:1345106/255‑1 (MQ=255) gATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCgg > 2:1345106/1‑255 (MQ=255) gATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGata > 1:1794640/1‑289 (MQ=255) gATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTCCTGTTTGTTGata > 2:25594/1‑289 (MQ=255) tGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGatat < 2:443901/288‑1 (MQ=255) ttttGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCa > 1:2146017/1‑288 (MQ=255) ttttGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTCGACGATCCGCAACTTGCCCgg > 2:1265365/1‑251 (MQ=255) gtttGTGGTACGGGGAAACCAGCGACGGTGACGTCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTAGGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCa < 2:828686/287‑1 (MQ=255) tttGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCGCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCAc < 1:1095595/288‑1 (MQ=255) ttGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGa < 2:237279/230‑1 (MQ=255) gTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGt > 1:1442810/1‑288 (MQ=255) ccGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTAc < 1:774052/288‑1 (MQ=255) cGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCt < 2:1761786/289‑1 (MQ=255) cGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCt < 2:640986/289‑1 (MQ=255) aaCCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGGGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGAt < 2:621445/289‑1 (MQ=255) cGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATc > 1:319229/1‑289 (MQ=255) gACGGTGACTGCTAGATCTACTGCGTGATTGAACAGCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATgaga < 2:1218333/286‑1 (MQ=255) gACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATgaga < 1:1756317/286‑1 (MQ=255) cGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATg < 1:1690552/289‑1 (MQ=255) cGGCGATATCTACTGCATAATTGAACATCAAAGCCCTGCAGAAAAGATAATGGGTTTTCGGCTAATTCGCTATGCCACGGCCGCCATGCAGCGGCACCAGGCCAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACAt < 2:2155124/289‑1 (MQ=255) ggCTATATCGACGGCGGAATTGAACAGCAAAGCGCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAAGGCGCGATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTGGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACAt < 2:2178164/288‑1 (MQ=255) gCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACAt < 2:982423/287‑1 (MQ=255) tataTCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGc > 1:403011/1‑289 (MQ=255) atCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGta < 2:1646062/289‑1 (MQ=255) tGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATCTCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAAGCTCGGCGTATAGc > 2:385336/1‑287 (MQ=255) tGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCt < 1:863946/255‑1 (MQ=255) gCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCgg > 1:2176883/1‑206 (MQ=255) gCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGccct > 2:729308/1‑289 (MQ=255) gCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGc > 1:2029098/1‑286 (MQ=255) gCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGc > 2:874811/1‑286 (MQ=255) gCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGc < 2:693422/286‑1 (MQ=255) cGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTTCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGTAACTTGCCCGGCAGTTGTACCCCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGctct > 1:2231657/1‑288 (MQ=255) gTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAgacct > 1:1031976/1‑283 (MQ=255) gTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGAAGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGATGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGcgct > 1:1403034/1‑287 (MQ=255) tGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGccc > 2:2250003/1‑201 (MQ=255) tGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACAt > 1:2257467/1‑272 (MQ=255) tCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACAt > 1:1813325/1‑262 (MQ=255) aaGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATTATATCATTCAACATCGGAGTATAGCTCGTCTGGAACTGATTCaa > 2:1110702/1‑289 (MQ=255) tctGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGc < 2:2029098/289‑1 (MQ=255) tGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGc < 2:568565/264‑1 (MQ=255) tGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGc > 1:568565/1‑264 (MQ=255) cAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGt < 2:1326141/226‑1 (MQ=255) cAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGt > 1:1326141/1‑226 (MQ=255) aaaGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCATGACAAAGGCTATGCCAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATAATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACGCAACTGGCTGGCTGAGTTTGACGATCCGTAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCTAAGCTTCTATGGTCGTGGATATCCCCATCGTACTTTCCGTGGAGATCATGCTATCACGGTGTATAGCTCTGCTGGTCATCATTCaaaactttcttcc > 2:322869/1‑279 (MQ=255) atatGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGAcc < 1:1687662/288‑1 (MQ=255) tatGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACcgc > 1:445043/1‑289 (MQ=255) ggCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGAt > 1:749600/1‑289 (MQ=255) ttttCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTa < 1:1387322/289‑1 (MQ=255) ttCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTaa > 2:1817776/1‑288 (MQ=255) ggccTATGCCACTGCCGCCAGGCAGCGTCACAAGGACAAAGGCTATGACAGGGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTc < 2:1465256/286‑1 (MQ=255) ccccttcagccTTGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGGTGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAg < 2:1033772/278‑1 (MQ=255) cTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTTAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATca > 1:125598/1‑288 (MQ=255) cTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCa < 2:76483/273‑1 (MQ=255) cATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCtt < 1:171084/289‑1 (MQ=255) cGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGt < 1:146697/173‑1 (MQ=255) tCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTGTGGTTagt > 1:11960/1‑288 (MQ=255) aCCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAACCCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAgg < 1:625661/289‑1 (MQ=255) cAGGGCAAAGGCTATGATAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTGTCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAGCTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCt < 2:2149179/289‑1 (MQ=255) aTGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCt < 1:1621134/276‑1 (MQ=255) aTGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCt > 2:1621134/1‑276 (MQ=255) agTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACAt < 1:723442/172‑1 (MQ=255) agTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCt > 2:1805685/1‑288 (MQ=255) agTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCt > 1:891843/1‑288 (MQ=255) gtaccgaggggggtgCCGTGGCTGTTTTATCTTGGCGAAGCCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAGCTGGCGGGATGGGTTTGAAGATCCGTAACCTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTGGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGACGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCAACCGGGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGAcagcca < 2:1756046/273‑1 (MQ=255) gTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTtg > 2:1882422/1‑129 (MQ=255) gCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAaca < 1:1664079/289‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAaca < 1:423818/289‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAaca < 1:1119422/289‑1 (MQ=255) tcggtggtGCCGTTCTTGTTTTATAATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAaca < 2:1713858/286‑1 (MQ=255) cTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCa > 1:1181815/1‑226 (MQ=255) ggtgCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGttt > 1:36525/1‑289 (MQ=255) gtgCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTAc > 1:1887391/1‑277 (MQ=255) cGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAAtt < 2:746048/288‑1 (MQ=255) tGCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATAAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTa > 1:1905670/1‑286 (MQ=255) gCTGTTTTATCATGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATct > 1:906476/1‑288 (MQ=255) aTGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATgcgg < 1:988712/289‑1 (MQ=255) aTGGCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATgcgg < 1:1545869/289‑1 (MQ=255) gCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGa > 1:2072023/1‑289 (MQ=255) gCGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGa > 1:788582/1‑289 (MQ=255) cGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGa < 1:1985853/288‑1 (MQ=255) cGAAACCTCGCCTTACCCGTACTCACTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGa < 2:523573/288‑1 (MQ=255) ||| ACTGCGCAAGCTTTGCAACCTGCAAACCTTACGCCTGGAACCCACTAGTTTTATTGAAAAAAGTTTACGCGCTTACTACAGCGATGTTTTGTGGTCCGTGGAAACCAGCGACGGTGACGGCTATATCTACTGCGTGATTGAACATCAAAGCTCTGCAGAAAAGAATATGGCTTTTCGGCTAATGCGCTATGCCACTGCCGCCATGCAGCGTCACCAGGACAAAGGCTATGACAGAGTCCCGCTGGTGGTGCCGTTGCTGTTTTATCATGGCGAAACCAGCCCTTACCCGTACAGTCTCAACTGGCTGGATGAGTTTGACGATCCGCAACTTGCCCGGCAGTTGTACACCGAAGCTTTTCTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGA > CP042583/1928267‑1928824 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |