| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,944,975 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,944,975 | 0 | A | T | 99.7% | 671.2 / NA | 284 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (146/136); total (148/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,944,976 | 0 | C | G | 99.7% | 669.8 / NA | 284 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (147/136); minor base T (1/0); total (148/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,944,977 | 0 | T | A | 100.0% | 683.3 / NA | 284 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (148/136); total (148/136) | |||||||||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
CCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCAGCTTTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGACTAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATACCCTCTCCGCCACTGAAGAATAGATTGTCTAAACGTCCGACAATGGT > CP042583/1944700‑1945256 ||| ccACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATa > 2:347658/1‑288 (MQ=255)ccACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATa > 2:1400030/1‑288 (MQ=255) aCTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATAcc > 2:2068687/1‑288 (MQ=255) tttCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATAccgcc > 1:510329/1‑289 (MQ=255) ggCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGtttt > 1:1352009/1‑288 (MQ=255) cACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTc < 1:563656/287‑1 (MQ=255) ctTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCcggcgg < 1:2229088/289‑1 (MQ=255) ctTCACTTCGGCGATCATTTGTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCcggcgg < 1:1619743/289‑1 (MQ=255) ttCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCggcggc > 1:1685845/1‑289 (MQ=255) tCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCa < 2:1352009/289‑1 (MQ=255) cACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCag > 2:1768170/1‑289 (MQ=255) ggCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTa > 1:1325801/1‑288 (MQ=255) cGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGCGGGCAGAGTTAGcc > 1:1041208/1‑289 (MQ=255) tATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATACGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTCCAGCACGATTTTTTGACTAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTCTCACCGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCATTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACGCCCGTTTTGCAGCTCAGGCGGCAGATTTAGCCAGCGCACCgt > 2:1621673/1‑288 (MQ=255) cATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCagag < 1:1413233/259‑1 (MQ=255) cATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCCCCGGCGGCagag > 2:1413233/1‑259 (MQ=255) aTCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACggg < 1:1165410/288‑1 (MQ=255) cATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCAccc > 1:679660/1‑289 (MQ=255) tGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCCCGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTACGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAACACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCAt > 1:1926722/1‑289 (MQ=255) tGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCcggcgg < 2:1827084/234‑1 (MQ=255) tGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCcggcgg < 2:809006/234‑1 (MQ=255) tGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCcggcgg > 1:809006/1‑234 (MQ=255) tGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCAt > 2:927563/1‑289 (MQ=255) gTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGaa < 2:2092752/262‑1 (MQ=255) gTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGaa > 1:2092752/1‑262 (MQ=255) tCTGTTAGCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCa < 1:780666/286‑1 (MQ=255) cTGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATAc < 2:69026/209‑1 (MQ=255) tGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCt > 1:1538770/1‑271 (MQ=255) tGTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTTACCCATTc > 1:1241488/1‑287 (MQ=255) gTTATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCATCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACt > 2:279590/1‑289 (MQ=255) ttATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTa > 2:777967/1‑289 (MQ=255) ttATCTTGTTTATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTa > 2:215697/1‑289 (MQ=255) ttATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACg < 1:728361/289‑1 (MQ=255) ttATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACg < 1:25462/289‑1 (MQ=255) tATTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACgg < 2:129086/252‑1 (MQ=255) aTTGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGct < 1:927563/289‑1 (MQ=255) tGCAGCACGATTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGctc > 2:788455/1‑288 (MQ=255) cagcacgattttttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAACTTTTAATCCCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCCGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAATAGGGCCAGCTTATCTTTCCCCCATTCACTAAACACAACGcctccg > 2:2021467/9‑284 (MQ=255) ggcacgattttttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGATTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCg < 1:760088/281‑1 (MQ=255) agcacgattttttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCg < 2:175501/281‑1 (MQ=255) cacgattttttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCTAGCGCACCGGTTGTTGAAAGCGGGACAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGCgg > 2:361763/6‑289 (MQ=255) gattttttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCa < 2:1325801/287‑1 (MQ=255) gattttttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCa < 1:1400030/287‑1 (MQ=255) gattttttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCa < 1:2068687/287‑1 (MQ=255) gattttttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCa < 1:2051542/287‑1 (MQ=255) ttttttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATa < 2:730664/289‑1 (MQ=255) ttGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTcc < 1:422660/289‑1 (MQ=255) tGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCt < 2:470685/246‑1 (MQ=255) ttATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGa > 2:306998/1‑289 (MQ=255) tATCCTGTTTGTTAAGCGTTTGCACATCAATTTACAGAGTAACAGATAAACTCTTTATCAACTGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTGAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGAc < 2:1926722/289‑1 (MQ=255) tCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGt < 2:63364/257‑1 (MQ=255) tCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCa > 1:1871753/1‑289 (MQ=255) tCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCa > 1:276868/1‑289 (MQ=255) tCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCG‑TTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCaa > 1:1732951/1‑289 (MQ=255) tttGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACggg > 2:1109359/1‑207 (MQ=255) tttGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACggg < 1:1109359/207‑1 (MQ=255) tttGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCCCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACt > 1:873738/1‑288 (MQ=255) tAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTACGACCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCAACACCCCCACCGGTCGATGACCAAAccccctt > 2:38821/1‑285 (MQ=255) tAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGAt > 2:1070373/1‑274 (MQ=255) tAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGAt < 1:1070373/274‑1 (MQ=255) tAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGACGATGACCAAACTCCTTg > 1:1296773/1‑288 (MQ=255) gTTTTCACGTCAAGTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCACCGGCAATGGAATGGAAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCa < 2:150030/289‑1 (MQ=255) ttCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACg > 1:1750585/1‑289 (MQ=255) caTCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTTACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGa < 2:1241488/289‑1 (MQ=255) tCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACggg < 2:1219025/285‑1 (MQ=255) aTTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATa < 1:225426/289‑1 (MQ=255) aTTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCCCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATa > 2:1158968/1‑289 (MQ=255) aGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGCATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCACACTCCTTTTCTGCAACGGGCACGAGAAacac > 2:576311/1‑288 (MQ=255) aTTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCt > 1:1468176/1‑288 (MQ=255) ttAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTCTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGc < 2:700382/289‑1 (MQ=255) tAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCcggcgg > 1:1637357/1‑140 (MQ=255) tAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCAt < 2:1001940/195‑1 (MQ=255) tAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCAt > 1:1001940/1‑195 (MQ=255) tAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCa < 1:279590/289‑1 (MQ=255) cAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGctct < 2:1676508/211‑1 (MQ=255) aaaCTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCa < 2:144848/289‑1 (MQ=255) aaaCTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCa < 1:1829207/289‑1 (MQ=255) aCTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAgg < 1:2157519/289‑1 (MQ=255) ctTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCa < 1:372608/181‑1 (MQ=255) tttATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGAtgt > 1:979379/1‑289 (MQ=255) tttATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGAtgt > 1:605375/1‑289 (MQ=255) tATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCa > 2:2219309/1‑273 (MQ=255) aCGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCg < 1:695682/195‑1 (MQ=255) gCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCa < 1:331333/174‑1 (MQ=255) gaatggCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGAGGTGCAGCAATTAcgctc > 1:478460/1‑286 (MQ=255) cAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTAGCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGCCCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGCAAAACACATGGAAAACCGCAGGCAGTCAAGCAATTAcagccagaactt > 2:1902512/1‑278 (MQ=255) tGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCg < 2:1871753/289‑1 (MQ=255) gagaAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCgg < 1:2014338/289‑1 (MQ=255) gagaAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCgg < 2:874689/289‑1 (MQ=255) agaAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCgg < 2:9715/288‑1 (MQ=255) ggTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCGGCAAAACCACAGAAGGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTCATTCCGCCGGCATACCCCCTcc > 2:171971/1‑288 (MQ=255) gCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATa < 2:197042/269‑1 (MQ=255) cGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGTTAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATACCCTCTCCGCCACTGAAGAATAGAt > 1:1816879/1‑289 (MQ=255) tGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATACCCTCTCCGCCACTCAATAATCGATTg > 2:2003992/1‑288 (MQ=255) cccACTCTTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATACCCTCTCCGCCACTGAAGAATAGATTGTCTaa < 1:96741/289‑1 (MQ=255) ctctTTTAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATACCCTCTCCGCCACTGAAGAATAGATTGTCCAAACg > 1:355154/1‑288 (MQ=255) tAGCGCCTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATAcc > 2:2174920/1‑249 (MQ=255) ccTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATAcc > 1:1808160/1‑244 (MQ=255) ccTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATACCCTCTCCGCCACTGAAGACTAGATTGTCTAAACGTCCGACAATgg > 1:915296/1‑288 (MQ=255) ccTGACGTGAAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATACCCTCTCCGCCACTGAAGAATAGATTGTCTAAACGTCCGACAATgg > 2:2048853/1‑288 (MQ=255) ||| CCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCATAAGTACATGTCTGTTATCTTGTTTATTGCAGCAGCTTTTTTTGACCAGCCATTCCATTGCATTATCCTGTTTGCTAAGAGTTTTCACATCAATTTACAGATTAACAGATAAACTCTTTATCAACGGCAATGGAATGGCAGAAATGAGAAGTGAAACGGAGGGTTAATTATTGCTGACGTTGCACCCACTCTTTTAGCGCCTGACGACTAATTTTAATACCGCCGTTTTTCAGCTCCGGCGGCAGAGTTAGCCAGCGCACCGGTTGTTGAAAACGGGCCAGCTTATCTTTCACCCATTCACTAAGATCAACGCTCTCGTGGTCATACTCCATCACCGCCACCGGTCGATGACCAAACTCCTTGTCGGCAACGGGGACGATAAACACCTGCAAAACCGCAGGATGTGCAGCAATTACGCGCTCGACTTCTTCCGGCTGAATACCCTCTCCGCCACTGAAGAATAGATTGTCTAAACGTCCGACAATGGT > CP042583/1944700‑1945256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |