Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,954,769 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,954,770 | 0 | G | C | 100.0% | 172.4 / NA | 74 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (37/37); total (37/37) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,954,771 | 0 | T | A | 100.0% | 172.2 / NA | 74 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (37/37); total (37/37) |
TCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCAAGTTGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTAGCCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAACAGTTTGCGTGCACTAGGCTATGATAAAGAAAATAGTCTTAAGCGTGTCATTAATAGTTTTAATTCTGAACTCATGGGAGAAATGAGCAATAATAATATAAAAGTTCATTTAAATGAACCAGAGATAATATTTTTACATGCCGATCTTCAGCAATACTTAAGCCAAAGTTGCGGTGCATTTGTGTGCATGGCAGCCCAGGAAGTGATTGAACAAAGGGAAAGCAATTCTGACAGCGCCCCCTATACGTTATTAAAAAACCATGCTGACAGATTTAAAAAATAT > CP042583/1954492‑1955050 ||| tCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACTGGATATTAGTTTCGCTACAGAAAATAGTAAATAAAAAAAATAATAAACTACAAATAAAATGCGTCATATTCAACTCATTGCGTGc > 1:2142382/1‑288 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |