Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 451,710 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 451,710 | 0 | A | T | 99.0% | 697.4 / NA | 300 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (140/155); minor base G (1/2); total (142/158) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 451,711 | 0 | G | C | 98.3% | 682.3 / NA | 300 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/4); new base C (141/154); total (142/158) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 451,712 | 0 | C | G | 99.7% | 702.8 / NA | 300 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (141/157); total (142/158) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
AATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTAGC‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTAAGCCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTAGCCTGTAATCGT‑AGGCATTAGACATTTGTGCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAATTGGTGCACAATGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGGCCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGC > CP042583/451430‑451988 ||| aagtcgcGACAGCGGAGGCATCGAGTTGTTGCTGAAAGAGGGGGATGTGGTGATTGGGAGTGGCGGCGGGGGTGTGCCTGTGACGGAGGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATgggg < 2:360983/283‑1 (MQ=255) aGCCAGTGAGTTGTTGCGCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAGACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAAcggcg < 2:1767643/289‑1 (MQ=255) cATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGt < 1:9093/288‑1 (MQ=255) aTCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGa < 1:277896/289‑1 (MQ=255) tgttgCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGt < 1:712249/287‑1 (MQ=255) aaaGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGGGGTTATGTCAGa‑a > 1:1612900/1‑289 (MQ=255) gATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCcgc < 1:863289/288‑1 (MQ=255) gttgtgaggaggggcggcggTGTGCCGGGGACGGATGACGGGGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGCACTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGGGCAGATTAATGCAGAGGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCcgcg < 2:1058738/276‑1 (MQ=255) aTTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAAGGGCGGTGAGGTGGTACGTCAGACAGCGGTGGTAACCCcggt > 2:852759/1‑287 (MQ=255) aTTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGGGAGGGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGGAAACCCGCGt > 2:1007163/1‑289 (MQ=255) gcggTGGCGGGGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGGGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCCCCATGCCACACCTGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGAt < 2:1281842/286‑1 (MQ=255) gcggcggcgGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGGTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGc > 1:762652/1‑289 (MQ=255) gggggCCGGTGACGGAGGACGGGGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCGGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTatcgc < 2:669406/284‑5 (MQ=255) 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cAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCcgcg > 1:642889/1‑245 (MQ=255) aGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCg < 1:1922991/288‑1 (MQ=255) aGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGATGGCAGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTGACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTACCGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCg < 2:1132481/288‑1 (MQ=255) 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aTCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGAc < 2:1719562/271‑1 (MQ=255) aTCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCAGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCggg < 1:255274/268‑1 (MQ=255) gcggccgcTGCGTTGCTCGCCGGGCGGATTAATGGAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCGGATGCGGTATATGAAGACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGt < 2:2029394/286‑1 (MQ=255) ctcGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGt < 1:1709842/289‑1 (MQ=255) tcGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGT‑a > 1:2008906/1‑289 (MQ=255) tcGCCGATGCGTTGCTTGCCGAGAAGATTAAGGCAGAGGGACTGGTGATCCTAACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAGCTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGT‑a < 2:1616407/289‑1 (MQ=255) cgcTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGT‑AGGCa < 2:824697/289‑1 (MQ=255) cgcTGCGTTGCAGGCCGGGGCGATTAAGGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGT‑AGGCa < 2:1819785/289‑1 (MQ=255) cGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGT‑AGGCATTAg > 1:1113942/1‑288 (MQ=255) 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aTGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGT‑AGGCATTAGACATTTGTGCCTGATGCGACGCTTGAc > 1:1845694/1‑288 (MQ=255) aTGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCGGTA‑TTTCGCTTTAGTCGT‑GGGCATTAGGACTTTGTGGCCGGTGAGCCGGTTGAc > 2:1870750/1‑288 (MQ=255) aTGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTAGCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTCGTCGT‑AGGCATGAGACATTTCTGCCTGAGGCGACGCTTGAc > 2:1523095/1‑288 (MQ=255) 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tttGCCAAAGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGT‑AGGCATTAGACATTTGTGCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAATTGGTGCACAATGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGGCCTACAATGGGTACCGGa > 1:2118538/1‑288 (MQ=255) aaGGCGATGGTTGG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGGGGTGAGTGGTTATGTCAGG‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGGGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGT‑AGGCATTAGACATTTGTGCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAATTGGTGCACAATGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGGCCTACAATGGGTACCGGATCGGTAgg < 2:1845694/289‑1 (MQ=255) aGCCGATGGTTCG‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTATCGCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTTCGCTGTAGTCGT‑AGGCATTAGACATTTGTGCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAATTGGTGCACAATGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGGCCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGc < 1:579527/289‑1 (MQ=255) ||| AATTCTCGACAGCGAAGCCATCGAGTTGTTGCTCAAAGAGGGGCATGTGGTGATTTGCAGTGGCGGCGGCGGTGTGCCTGTGACGGATGACGGAGCAGGGAGTGAAGCAGTGATTGATAAAGATCTCGCCGCTGCGTTGCTCGCCGAGCAGATTAATGCAGATGGACTGGTGATCCTCACCGATGCTGATGCGGTATATGAAAACTGGGGAACGCCGCAG‑CAACGTGCCATTCGCCATGCCACACCGGATGAGTTAGCGCCATTTGCCAAAGCCGATGGTAGC‑ATGGGGCCGAATGTAACGGCGGTGAGTGGTTATGTCAGA‑AGCCGTGGTAAACCCGCGTGGATTGGGGCGTTAAGCCGAATTGAAGAGACGCTGGCGGGCGAAGCGGGGACCTGTA‑TTAGCCTGTAATCGT‑AGGCATTAGACATTTGTGCCTGATGCGACGCTTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAACCGGTGCCGCATCCGGCAATTGGTGCACAATGCCTGATGCGATGCTTGACGCATCTTATCAGGCCTACAATGGGTACCGGATCGGTAGGC > CP042583/451430‑451988 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |