| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 619,917 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 619,918 | 0 | G | C | 99.2% | 610.5 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base C (120/136); minor base T (2/0); total (122/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.23e-01 | |||||||||||
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| * | CP042583 | 619,919 | 0 | C | G | 100.0% | 616.9 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (122/137); total (122/137) | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
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cGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAg < 2:1216310/289‑1 (MQ=255) ||| AGGTCGCGGCTGTGATGGTCCGTGGGGGCCACACGCGAAACTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTAAGCGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACAGCCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCAGCGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAG > CP042583/619637‑620195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |