Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 619,950 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 619,950 | 0 | A | T | 99.6% | 608.8 / ‑6.1 | 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (126/128); minor base G (1/0); total (127/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 619,951 | 0 | G | C | 99.6% | 603.2 / NA | 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (127/127); minor base A (0/1); total (127/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 619,952 | 0 | C | G | 100.0% | 605.8 / NA | 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (127/128); total (127/128) |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTAAGCGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACAGCCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCAGCGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGTTGAAAGTGATCCGCGAGCGTCTGAAAA > CP042583/619677‑620226 ||| ctgaaactCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCtgg < 1:1675904/289‑1 (MQ=255) ctCACCGGTGTAAAGACGTCTGCGAATCCACTCTGCCGGGGACCCTGGAGCTTTCCGTTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTgg < 2:1098889/288‑1 (MQ=255) aCCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTcg < 1:1991544/289‑1 (MQ=255) aagTTCTCGGATCCCGTCGGCCGGGTTTCCTGGGGCTTTCCCGTACCTTCGCTGACGGCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGtc < 2:1739083/288‑1 (MQ=255) ttCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGtctgca > 1:791409/1‑289 (MQ=255) ttCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGtctgca > 1:917614/1‑289 (MQ=255) ttCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGtctgca > 2:1079915/1‑289 (MQ=255) ttCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTAGCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATAGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCGGGACCTGGTGGTCTGTGGTAGCGCGGCAGGtcggca > 1:1727131/1‑289 (MQ=255) tCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCt > 2:1282934/1‑289 (MQ=255) tCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCt > 2:1039760/1‑289 (MQ=255) agccTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGc < 1:1245110/287‑1 (MQ=255) ccTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTAGCGCCGAGCAg > 1:1068482/1‑289 (MQ=255) ccTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACGCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCa > 2:214/1‑288 (MQ=255) tttCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCAc < 1:1039760/288‑1 (MQ=255) tCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCa < 2:495795/278‑1 (MQ=255) tCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTg > 2:1232354/1‑288 (MQ=255) ccTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTCCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATg > 1:973366/1‑288 (MQ=255) tCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGcc < 1:129816/263‑1 (MQ=255) tCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCCCGGCGCGATGcccg > 2:2162770/1‑287 (MQ=255) cGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAg > 1:1001522/1‑288 (MQ=255) cGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGc < 2:341986/289‑1 (MQ=255) gCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCg > 1:1417177/1‑289 (MQ=255) acgacgtgcccgTGAATGTGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCTCTACATGATGGGCGTTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAGGGCGAAGATGTGATTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTc < 1:34376/278‑1 (MQ=255) aCGTCGATCCGGTGGAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGAACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGGTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTc < 2:942409/289‑1 (MQ=255) aCGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTc < 1:762354/289‑1 (MQ=255) ccGAGCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGGGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTg < 2:580133/287‑1 (MQ=255) ggTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGGGAAATCGCTTGTGTATCGGTCCACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCGTGGGTGGCGCGGCAGGTCTGCATCCGCACGAGTCGAGCGCCGGGCAGGGCGCACGGCGCGGGGCAACGGGGTCGGATGTTGaa > 2:762354/1‑289 (MQ=255) tGAAAGGGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAg < 2:1198001/288‑1 (MQ=255) tGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAg < 2:791409/288‑1 (MQ=255) tGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAg < 1:1282934/288‑1 (MQ=255) tGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACGACAGGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGTCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAg < 1:1643661/288‑1 (MQ=255) cGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTgg < 1:882309/288‑1 (MQ=255) cGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGGTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGTACTGTTTGCCGTGGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTAGCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTgg < 1:1348537/288‑1 (MQ=255) gATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTcg < 1:1201856/201‑1 (MQ=255) ttATCCCGACCTGTAACTACCTGATGGGTGGGAGTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGGCTGGGAAGGGGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTACGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGa < 2:860610/288‑1 (MQ=255) tCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGt > 1:809055/1‑200 (MQ=255) cccAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGc > 1:115351/1‑250 (MQ=255) cccAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGc < 2:115351/250‑1 (MQ=255) aaCCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTgg < 1:1074950/289‑1 (MQ=255) ccTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGCTCGCCTGAACCGc > 2:1917857/1‑284 (MQ=255) ccTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGc < 1:1917857/284‑1 (MQ=255) gTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCTAGAGGGGCGCACTGCGCGATGCCACATGTTCGGCGGTTTAGTCGTCTCTGGATCCCCTGAACCTCTGGAAcgc > 2:1213040/1‑287 (MQ=255) cACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACaat < 1:257359/288‑1 (MQ=255) tACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGc < 2:72479/214‑1 (MQ=255) aaaggtgggggggTATTCCAGCCCAAGTTGCCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGGGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCg < 2:1068482/282‑1 (MQ=255) cATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCACTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTGGAAGCGTCTCTGTGTCGCCTGAACCGCTGGAACACAAATCGt > 2:1656265/1‑289 (MQ=255) atgatgGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTa > 2:1309749/1‑289 (MQ=255) tgatgGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTaa < 2:559217/289‑1 (MQ=255) cgatgGGAGGAAGTGCGACCAAAGTTACCGGTCAGGAGCTGACTGTGAATGAGAATGACGATGATGTGGTTGTTCCGGGAGTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTaa < 2:1597710/288‑1 (MQ=255) atgGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCa < 2:1868695/216‑1 (MQ=255) atgGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCa > 1:1868695/1‑216 (MQ=255) atgGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATTTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTaa > 1:603222/1‑287 (MQ=255) atgGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACg > 1:1535759/1‑289 (MQ=255) gCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGa > 2:465136/1‑289 (MQ=255) cGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGa < 1:465136/288‑1 (MQ=255) cGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGa < 1:2178591/288‑1 (MQ=255) ggTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGAc > 1:1747534/1‑147 (MQ=255) ttCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATcc > 1:1458883/1‑289 (MQ=255) caagtttACCGGTCAGGGACTGACTGGGAATGAGAAAGGCGAATAGGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGGGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCg < 2:386063/284‑1 (MQ=255) cAAAGTGACCGGGCAGGAACTTGCTGTGAATGAGAAATGCGAGGGTGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTGTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCg < 2:2097697/289‑1 (MQ=255) aggTTACGGGTCAGGCACGGAGTGTGAATGAGAAGGGCGAGGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCGGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGAt < 2:1893213/287‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGCTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTTTCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAg < 1:409226/289‑1 (MQ=255) cAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGa < 2:133809/263‑1 (MQ=255) aGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTgcg < 1:99794/190‑1 (MQ=255) actgTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAATATCCGGTGGCGCTGCGGATAGCGCTGAAACAAt > 2:1985122/1‑289 (MQ=255) tgAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAATTCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTg < 1:1118024/249‑1 (MQ=255) tgAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAAc > 2:2218039/1‑245 (MQ=255) tgAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAAc < 1:2218039/245‑1 (MQ=255) tgAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAACGCGCTGAAAGAATGTAt > 2:691504/1‑289 (MQ=255) tgAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTAt > 2:449222/1‑289 (MQ=255) agaAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATgcagca > 1:543879/1‑289 (MQ=255) agaAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCCCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATgcagca > 1:240670/1‑289 (MQ=255) aaaGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTgcg < 2:1619893/170‑1 (MQ=255) aaaGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTgcg > 1:1619893/1‑170 (MQ=255) aaaGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTGTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAATAATGTATgcagcaga > 1:1823685/1‑287 (MQ=255) aaaGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCa > 2:712327/1‑272 (MQ=255) aaGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTATCCGTCGGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTct < 1:1964124/288‑2 (MQ=255) aaGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTct < 1:1770718/288‑2 (MQ=255) ataTGTGGTTGTTCCGGGACTTTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTCCCCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTctcg < 1:1323233/287‑4 (MQ=255) ggTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTgg < 1:721291/208‑1 (MQ=255) ggTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGc > 2:1811846/1‑240 (MQ=255) ttCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCg < 2:1503276/236‑1 (MQ=255) gggACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGt > 1:1164294/1‑289 (MQ=255) tttGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATc > 1:1831006/1‑217 (MQ=255) tttGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGCGCCGTAAAGCGCTGAAAAAATGCATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGACGGTGATGCGa > 2:1689990/1‑289 (MQ=255) tttGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTa > 2:1769351/1‑250 (MQ=255) tGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATg < 1:2162770/289‑1 (MQ=255) gTTGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGa < 1:560412/289‑1 (MQ=255) ttGGTGAAATCGCTTGTGTATCGGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGCTCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCTGACAGCGCTGCAAGAATTGATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGaa > 1:1090910/1‑289 (MQ=255) tgtgtatcggTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGt < 1:702736/280‑1 (MQ=255) tcggtcaagggCGCTACCCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTGGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGTTGAAAg < 2:1458883/280‑1 (MQ=255) gTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCTCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTATCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGTTGAAAGt > 1:838045/1‑287 (MQ=255) cGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTctcggtc > 2:899535/1‑229 (MQ=255) cgcTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGTTGAAAGTGATCCGCGa > 1:41889/1‑288 (MQ=255) cgcTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGTTGAAAGTGATCCGCGAg > 1:211257/1‑289 (MQ=255) cTAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAg > 1:1225489/1‑266 (MQ=255) tAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTg > 2:616404/1‑236 (MQ=255) tAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTg < 1:616404/236‑1 (MQ=255) tAACCGTCTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGTTGAAAGTGATCCGCGAGCg > 2:277561/1‑288 (MQ=255) cTGGGCGGCAACTCGCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCTCGGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGTTGAAAGTGATCCGCGAGCGTCTAaaaa > 1:857896/1‑289 (MQ=255) ||| CTGAAACTCGATCACCTGGGTAAAGAAGTTCTCGAATCCCGTCTGCCGGGTATCCTGGAGCTTTCCCGTACCTTCGCTCACGTCGATCCGGTGAAAGAGCCGATTCCGGTTATCCCAACCTGTCACTACATGATGGGCGGTATTCCGACCAAAGTTACCGGTCAGGCACTGACTGTGAATGAGAAAGGCGAAGATGTGGTTGTTCCGGGACTGTTTGCCGTTGGTGAAATCGCTTGTGTAAGCGTACACGGCGCTAACCGTCTGGGCGGCAACAGCCTGCTGGACCTGGTGGTCTTTGGTCGCGCGGCAGGTCTGCATCTGCAAGAGTCTATCGCCGAGCAGGGCGCACTGCGCGATGCCAGCGAGTCTGATGTTGAAGCGTCTCTGGATCGCCTGAACCGCTGGAACAATAATCGTAACGGTGAAGATCCGGTGGCGATCCGTAAAGCGCTGCAAGAATGTATGCAGCATAACTTCAGCGTCTTCCGTGAAGGTGATGCGATGGCGAAAGGGCTTGAGCAGTTGAAAGTGATCCGCGAGCGTCTGAAAA > CP042583/619677‑620226 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |