| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 627,530 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 627,531 | 0 | G | C | 100.0% | 691.3 / NA | 292 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (156/136); total (156/136) | |||||||||||
| * | CP042583 | 627,532 | 0 | C | G | 99.7% | 694.0 / NA | 292 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (155/136); total (156/136) | |||||||||||
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Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
AGACTCCATTCTGGAAGCCATCGACGCAGGCATCAAACTGATTATCACCATCACTGAAGGCATCCCGACGCTGGATATGCTGACCGTGAAAGTGAAGCTGGATGAAGCAGGCGTTCGTATGATCGGCCCGAACTGCCCAGGCGTTATCACTCCGGGTGAATGCAAAATCGGTATCCAGCCTGGTCACATTCACAAACCGGGTAAAGTGGGTATCGTTTCCCGTTCCGGTACACTGACCTATGAAGCGGTTAAACAGACCACGGATTACGGTTTCGGTCAGAGCACCTGTGTCGGTATCGGCGGTGACCCGATCCCGGGCTCTAACTTTATCGACATTCTCGAAATGTTCGAAAAAGATCCGCAGACCGAAGCGATCGTGATGATCGGTGAGATCGGCGGTAGCGCTGAAGAAGAAGCAGCTGCGTACATCAAAGAGCACGTTACCAAGCCAGTTGTGGGTTACATCGCTGGTGTGACTGCGCCGAAAGGCAAACGTATGGGCCACGCGGGTGCCATCATTGCCGGTGGGAAAGGGACTGCGGATGAGAAATTCGCTGCTCTG > CP042583/627250‑627811 ||| tCCATTCTGGAAGCCATCGACGCAGGCATCAAACTGATTATCACCATCACTGAAGGCATCCCGACGCTGGATATGCTGACCGTGAAAGTGAAGCTGGATGAAGCAGGCGTTCGTATGATCGGCCCGAACTGCCCAGGCGTTATCACTCCGGGTGAATGCAAAATCGGTATCCAGCCTGGTCACATTCACAAACCGGGTAAAGTGGGTATCGTTTCCCGTTCCGGTACACTGACCTATGAAGCGGTTAAACAGACCACGGATTACGGTTTCGGTCAGTCGACCTGTGTCg < 2:244630/289‑1 (MQ=255) 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AGACTCCATTCTGGAAGCCATCGACGCAGGCATCAAACTGATTATCACCATCACTGAAGGCATCCCGACGCTGGATATGCTGACCGTGAAAGTGAAGCTGGATGAAGCAGGCGTTCGTATGATCGGCCCGAACTGCCCAGGCGTTATCACTCCGGGTGAATGCAAAATCGGTATCCAGCCTGGTCACATTCACAAACCGGGTAAAGTGGGTATCGTTTCCCGTTCCGGTACACTGACCTATGAAGCGGTTAAACAGACCACGGATTACGGTTTCGGTCAGAGCACCTGTGTCGGTATCGGCGGTGACCCGATCCCGGGCTCTAACTTTATCGACATTCTCGAAATGTTCGAAAAAGATCCGCAGACCGAAGCGATCGTGATGATCGGTGAGATCGGCGGTAGCGCTGAAGAAGAAGCAGCTGCGTACATCAAAGAGCACGTTACCAAGCCAGTTGTGGGTTACATCGCTGGTGTGACTGCGCCGAAAGGCAAACGTATGGGCCACGCGGGTGCCATCATTGCCGGTGGGAAAGGGACTGCGGATGAGAAATTCGCTGCTCTG > CP042583/627250‑627811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |