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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
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gttggCGCGCGGTGCAAGCCTGTCCGGCATGTGGAGTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGAAACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCAAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCATGTGAAATTCGTTCACACTGGAGCGTCTTGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTATCAGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTCCTTTGCTATCGCTGCCAGCTTCGGTAt < 2:2087836/286‑1 (MQ=255) ggtggCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCCGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGAAACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGc < 2:54000/125‑1 (MQ=255) gtggCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGAAACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTATCAGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTCCTTTGCTATCGCTGCCAGCTTCGGTATg > 1:348249/1‑288 (MQ=255) cgcTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGAAACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTATCAGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTCCTTTGCTATCGCTGCCAGCTTCGGTATGgctg < 1:1745062/288‑1 (MQ=255) ||| AAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCAATCGAAGGTCTGATGGCCTTCTTCCTCGAATCCACCTTTGTAGGTCTGTTCTTCTTCGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTAGTAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGCTGGATGCAAAACCCAATCGCGTCCGATTTCAACTTTGAAACTATGCGTATGGAGATGGTGAGCTTCTCCGAGCTGGTGCTTAACCCGGTTGCTCAGGTGAAATTCGTTCACACTGTAGCGTCTGGTTATGTGACTGGCGCGATGTTCATCCTCGGTATCAGCGCATGGTATATGCTGAAAGGTCGTGACTTCGCCTTCGCTAAACGCTCCTTTGCTATCGCTGCCAGCTTCGGTATGGCTG > CP042583/634424‑634979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |