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Missing coverage evidence... | ||||||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
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GACGGTTATAAAATTCTTTGTAAGCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGC < 1:1896597/131‑1 GGTTATAAAATACTTTGTAAGCCCGTGCTTTCCGGTAACTAGGACATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAG < 2:2968202/289‑1 TTATAAAATTCTTTGTAAGCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGG < 1:1019482/288‑1 TTATAAAATTCTTTGTAAGCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCAGCCGCGTGAGCCAACGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGCCATCCAGGC > 1:1941851/1‑289 TTCTTTGTAAGCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCG < 1:3166247/214‑1 CTTTGTAAGCCGCTGCTTTCCGGTAACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGAT > 1:1341499/1‑289 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ACTATGAAATTACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCATCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGGTAGCCAAAGGTTGTAAACGTACGTTAGGCACTTATGACTTTCGCCTTACAGCCAACCAGGCGTGTCGTGATGTTGAACACCATcccactactccc > 2:3239235/1‑276 TACTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGGGCCAGTTGATTTCCCTGCACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATCGACATCTGCCCTGCCGTCAGTT < 2:1498856/289‑1 CTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATCGACATCTGCCCTGCCGTCAGTTac > 1:602629/1‑287 CTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAAT > 2:888478/1‑260 CTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACG < 1:1458574/149‑1 CTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCC > 1:1723242/1‑111 CTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCC < 1:2187065/89‑1 CTGAACTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCC > 2:2187065/1‑89 CTTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATCGACATCTGCCCTGCCGTCAGTTTCGCTTT > 1:2212142/1‑289 TTGATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATCGACATCTGCCCTGCCGTCAGTTTCGCTTTT < 1:235077/289‑1 GATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATCGACATCTGCCCTGCCGTCAGTTTCGCTTTTA > 1:1498856/1‑288 GATCCGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGG < 1:3021294/183‑1 CGGCGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACACTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATCGACATCTGCCCTGCCGTCAGTTTCGCTTTTACCACC < 1:2689762/289‑1 CGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTA < 1:3208166/182‑1 CGAATGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGTAAAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTA > 2:3208166/1‑182 TGACCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCG > 1:2790151/1‑117 CCAGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATCGACATCTGCCCTGCCGTCAGTTTCGCTTTTACCACCTGGTCCGCTG < 1:2480240/289‑1 AGCGAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCCATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCCTGTCATGATGTTTAAATCCATCGACATCTGCCCTTCCGTCAGTTTCCCTTTTACCACCTGTTCCGCTTCA > 2:2065846/1‑289 GAGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATCGACATCTGCCCTGCCGTCAGTTTCGCTTTTACCACCTGGTCCGCTGCAA < 1:887863/287‑1 AGCCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGTGAGCCAAAGGAAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATCGACATCTGCCCTGCCGTCAGTTTCGC < 1:702588/263‑1 CCAGTTGATTTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGt < 2:2483054/151‑2 TTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGtgagcca > 2:3031987/1‑141 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgaccagcgagccagttgattTCACTGAACAACAGTTTACCTTGCGGTTGT‑AAAAGCCGCAGGGTGTGCCTGCCATCGAACCAGCACGCGCCCTGGTCGGTAGTGAGCAATTTATCGCCCAGTTGCCACGCCCCGTTAATCACAAACACCACCCCGCCGCGACTGCCAAAGGTAGTAAACGTACGTTCGGCAATTCTGACTTTCGCCTTACAGACATCCAGGCGTGTCATGATGTTGAAATCCATGCTCATCTGCCCTGCCGTCAGTTTCGCTTTTACCACCTGGTCCGCTGCAAAGGCAAAA > CP042583/1506397‑1506678 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |